记录相关流程和脚本方便自己和大家参考,佛系更新,独木难支,欢迎志同道合的小伙伴加入!
这个repo已经开通Discussion版块,希望可以成为大家学习交流的平台
Mou Yin: 看看我写的基因组学研究流程!
Hermiolee1: 我占坑的,怎么了嘛
- 测试和更新bwa-mem2/minimap2比对流程
- 测试和更新二代测序SV鉴定流程
- 下一步:将以下一些流程写为snakemake workflow
- SNP calling Snakemake 流程已经完成
- 下一步:将以下一些流程装进conda
- 生物信息工具——我的关注
- 常用数据处理Tips
- 重测序和群体遗传
- 变异鉴定和变异特征 (snakemake自动化)
- 群体历史推测
- 群体关系计算
- 结构变异检测和群体遗传
- Nanopore测序数据甲基化检测
- 植物基因组组装和个性化分析 (以花苜蓿基因组学研究为例)