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ylluX/plugins-based-framework

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Plugins-based Framework

大致学习了qiime2的基于插件的框架,在这里模拟一个demo。

以下是涉及到的4个包:

  • q2:框架管理器
  • q2-sv:结构变异calling插件
  • q2-snv: 点突变calling插件
  • q2-igv: 画图插件

4个包通过"pip isntall ."安装,也可以通过"pip install -e ."来预安装,方便调试。

下面展示各个接口:

q2

q2

q2 sv/sv-batch

q2 sv

q2 snv

q2 snv

q2 igv

q2-igv

sv, snv, **igv **三个插件包通过'Q2.plugins'入口组进行统一管理。

other

click给出了一个基于本地plugins的方法,也可以借鉴:click/examples/complex at main · pallets/click (github.com)

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