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realalanc/MSI-Machine-Learning

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MSI-Machine-Learning

For studying the biological meaning of MSI 相关性数据已上传 初步因果图已经上传,代码在casual,不是那个temptest


CAM:跑不出来

CCDr:也有孤立点但是少了很多

CGNN:不懂神经网络调参(悲)

GES:之前的那个

GIES:和GES一样就不放图了

LinGAM:跑不出来

PC:没有孤立点

SAM:没看懂的报错(进程冲突之类的?)

SAMv1:同上

整个bnlearn:跑不出来(如果不用graph显示x0不能为整数之类的?如果用了graph显示module 'networkx' has no attribute 'adj_matrix'

跑出来的几个里选一个算法到时候扔去dowhy验证吧,或者你试试跑不出来的?


好了,GES的没有指明是哪个(就是名字只有一个Casual的那个,其余几个都对应相应的算法改好了名) 其实GES的,如果是先指定骨架再去做的话效果也不差,没有那么多的孤立节点


指定骨架和不指定骨架还是都对比一下吧 dowhy模块的几个问题已经私信,咱们商量一下咋解决吧


整理了一下仓库,不用的旧数据扔进old_data,旧结果扔进old_result,旧代码扔进old_tool_code&test_code

现在在做评分代替msi的跑图

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