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nickkking/Char-Process

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Char-process

拿到一堆线粒体rna的coI序列,由于全部序列都放在一个txt文件里面,因为后期需要把每一个序列单独拿出来fas文件,然后根据一个表格分类到种。要手动复制粘贴不知道要花多久,所以就用python自动化一下。

v1

整个过程分三步

1.拆分为以缩写命名的单个文件

2.将同一物种的序列归类,放入以物种命名的文件夹

3.发现txt文件中的缩写与物种名表格的缩写部分不相同,暂时处理:找出无法匹配的缩写单独放入一个文件夹,人工处理

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批量fas序列文件拆分成单个文件

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