Repozitorij je namenjen za uporabo pri predmetu Struktura proteinov za študente 2. letnika univerzitetnega študijskega programa Biokemija na Univerzi v Ljubljani, Fakulteti za kemijo in kemijsko tehnologijo, in sicer kot dodatno študijsko gradivo.
Vsebuje primere struktur in povezave do relevantnih zbirk strukturnih podatkov o bioloških (makro)molekulah ter orodij za njihovo vizualizacijo in analizo.
Repozitorij je bil ustvarjen za prvo uporabo v študijskem letu 2023/2024 - kar vidite ni 'končna' verzija, saj bo vsebina sproti posodobljena in dopolnjena.
Vsebina repozitorija služi za pripravo spletne knjige, ki je dostopna za ogled v brskalniku na naslovu mpavsic.github.io/stbio. Posamezne strani si lahko prenesete v formatu MarkDown ali PDF, za prenos so na voljo tudi predpripravljene datoteke s sejami (session files), ki jih lahko odprete s programom za vizualizacijo struktur.
Avtor knjige je Miha Pavšič, razen delov, ki so posebej označeni (npr. seminarske naloge študentov, če bodo naložene v ta repozitorij).
Knjiga je bila ustvarjena z uporabo odličnega odprtokodnega projekta Jupyter Book, repozitorij executablebooks/jupyter-book. Uporabljeni so bili prosto dostopni viri (zbirke strukturnih podatkov) in orodja, navedena v sami knjigi - hvala vsem raziskovalcem in razvijalcem, ki so podatke in programsko kodo dali v uporabo!