GitHub - lholivera/haplotipos: determinación del par de haplotipos que explican una secuencia observada

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determinación del par de haplotipos que explican una secuencia observada

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Copyright Leónidas Hernán Olivera 2017
GNU GENERAL PUBLIC LICENSE Version 3, 29 June 2007

SPANISH VERSION
Este notebook de ipython es la primera versión operativa que resuelve a partir de un listado de secuencias de alineamiento 
y una (o muchas) secuencia objetivo, la determinación de qué par de secuencias de referencia explican mejor la secuencia objetivo,
devolviendo un ranking de las mismas.

De momento es la versión prototipo utilizada para resolver los haplotipos involucrados en la tesis doctoral de la Dra. Laura Barrientos (http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/59531).
Por el momento es un script que se ejecuta secuencialmente (requiere ipython notebook y algunas librerias) y hay que modificar en el codigo el nombre de los archivos que lee. En el repositorio hay archivos de ejemplo.

Si necesita usar el software (y no logra hacerlo a partir del notebook) escriba a [email protected]

Esta es la primera liberación pública como punto de partida para el desarrollo.

Toda contribución es bienvenida bajo licencia GPLv3

Junio de 2017