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Merge branch 'fmriprep_study-friends_sub-06_ses-048.job' into rel/2022
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bpinsard committed Aug 10, 2023
2 parents fda12e1 + f8b0aa3 commit 8868a90
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<ul>
<li>fMRIPrep version: 20.2.5</li>
<li>fMRIPrep command: <code>/usr/local/miniconda/bin/fmriprep -w ./workdir --participant-label 06 --anat-derivatives ./sourcedata/smriprep --fs-subjects-dir ./sourcedata/smriprep/sourcedata/freesurfer --bids-filter-file code/fmriprep_study-friends_sub-06_ses-040_bids_filters.json --output-layout bids --ignore slicetiming --use-syn-sdc --output-spaces MNI152NLin2009cAsym T1w:res-iso2mm --cifti-output 91k --notrack --write-graph --skip_bids_validation --omp-nthreads 8 --nprocs 12 --mem_mb 49152 --fs-license-file code/freesurfer.license --resource-monitor sourcedata/friends ./ participant</code></li>
<li>Date preprocessed: 2022-11-19 18:03:07 +0000</li>
<li>fMRIPrep version: 20.2.6</li>
<li>fMRIPrep command: <code>/usr/local/miniconda/bin/fmriprep -w ./workdir --participant-label 06 --anat-derivatives ./sourcedata/smriprep --fs-subjects-dir ./sourcedata/smriprep/sourcedata/freesurfer --bids-filter-file code/fmriprep_study-friends_sub-06_ses-048_bids_filters.json --output-layout bids --ignore slicetiming --use-syn-sdc --output-spaces MNI152NLin2009cAsym T1w:res-iso2mm --cifti-output 91k --notrack --write-graph --skip_bids_validation --omp-nthreads 8 --nprocs 12 --mem_mb 49152 --fs-license-file code/freesurfer.license sourcedata/friends ./ participant</code></li>
<li>Date preprocessed: 2023-08-09 20:39:25 +0000</li>
</ul>
</div>
2 changes: 1 addition & 1 deletion sub-06/figures/sub-06_desc-preproc_dseg.svg
2 changes: 1 addition & 1 deletion sub-06/figures/sub-06_desc-reconall_T1w.svg
7 changes: 5 additions & 2 deletions sub-06/figures/sub-06_desc-summary_T1w.html
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<ul class="elem-desc">
<li>Subject ID: 06</li>
<li>Structural images: 1 T1-weighted </li>
<li>Functional series: 1</li>
<li>Functional series: 4</li>
<ul class="elem-desc">
<li>Task: s02e04a (1 run)</li>
<li>Task: s06e13a (1 run)</li>
<li>Task: s06e13b (1 run)</li>
<li>Task: s06e14a (1 run)</li>
<li>Task: s06e14b (1 run)</li>
</ul>
<li>Standard output spaces: MNI152NLin2009cAsym, fsaverage, MNI152NLin6Asym</li>
<li>Non-standard output spaces: T1w</li>
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16 changes: 16 additions & 0 deletions sub-06/figures/sub-06_ses-048_task-s06e13a_desc-summary_bold.html
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<details open>
<summary>Summary</summary>
<ul class="elem-desc">
<li>Repetition time (TR): 1.49s</li>
<li>Phase-encoding (PE) direction: Anterior-Posterior</li>
<li>Single-echo EPI sequence.</li>
<li>Slice timing correction: Not applied</li>
<li>Susceptibility distortion correction: PEB/PEPOLAR (phase-encoding based / PE-POLARity)</li>
<li>Registration: FreeSurfer <code>bbregister</code> (boundary-based registration, BBR) - 6 dof</li>
<li>Non-steady-state volumes: 0</li>
</ul>
</details>
<details>
<summary>Confounds collected</summary><br />
<p>global_signal, global_signal_derivative1, global_signal_power2, global_signal_derivative1_power2, csf, csf_derivative1, csf_derivative1_power2, csf_power2, white_matter, white_matter_derivative1, white_matter_power2, white_matter_derivative1_power2, csf_wm, tcompcor, std_dvars, dvars, framewise_displacement, rmsd, t_comp_cor_00, t_comp_cor_01, t_comp_cor_02, t_comp_cor_03, t_comp_cor_04, a_comp_cor_00, a_comp_cor_01, a_comp_cor_02, a_comp_cor_03, a_comp_cor_04, a_comp_cor_05, a_comp_cor_06, a_comp_cor_07, a_comp_cor_08, a_comp_cor_09, a_comp_cor_10, a_comp_cor_11, a_comp_cor_12, a_comp_cor_13, a_comp_cor_14, a_comp_cor_15, a_comp_cor_16, a_comp_cor_17, a_comp_cor_18, a_comp_cor_19, a_comp_cor_20, a_comp_cor_21, a_comp_cor_22, a_comp_cor_23, a_comp_cor_24, a_comp_cor_25, a_comp_cor_26, a_comp_cor_27, a_comp_cor_28, a_comp_cor_29, a_comp_cor_30, a_comp_cor_31, a_comp_cor_32, a_comp_cor_33, a_comp_cor_34, a_comp_cor_35, a_comp_cor_36, a_comp_cor_37, a_comp_cor_38, a_comp_cor_39, 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