Add example data

burgerga · Feb 6, 2017 · d085524 · d085524
1 parent f91c713
commit d085524
Show file tree

Hide file tree

Showing 5 changed files with 161 additions and 0 deletions.
diff --git a/DESCRIPTION b/DESCRIPTION
@@ -10,6 +10,7 @@ Description: Reads and writes 'MTrackJ' Data Files ('.mdf').
     information examples.
 License: GPL-3 | file LICENSE
 LazyData: TRUE
+Depends: R (>= 2.10)
 Imports: hellno
 URL: https://github.com/burgerga/mdftracks
 BugReports: https://github.com/burgerga/mdftracks/issues

diff --git a/R/data.R b/R/data.R
@@ -0,0 +1,16 @@
+#' Example data to show mdftracks functionality
+#'
+#' @format A data frame with 10 rows and 9 variables
+#' \describe{
+#'   \item{cl}{track cluster}
+#'   \item{id}{track identifier (in cluster)}
+#'   \item{p}{point in track (not necessarily the same as frame number)}
+#'   \item{x}{x-coordinate of point}
+#'   \item{y}{y-coordinate of point}
+#'   \item{z}{z-coordinate of point}
+#'   \item{t}{time of point}
+#'   \item{ch}{track channel}
+#'   \item{uid}{track identifier (unique over clusters)}
+#' }
+#' @source Self-generated
+"mdftracks.example.data"
diff --git a/data/mdftracks.example.data.rda b/data/mdftracks.example.data.rda
diff --git a/inst/extdata/example.mdf b/inst/extdata/example.mdf
@@ -0,0 +1,116 @@
+MTrackJ 1.5.1 Data File
+Displaying true true true 1 2 0 0 100 10 0 0 0 2 1 12 0 true false true false
+Assembly 1 FF0000
+Cluster 1 FF0000
+Track 1 FF0000 true
+Point 1 782.0 43.0 1.0 1.0 1.0
+Point 2 784.0 45.0 1.0 2.0 1.0
+Point 3 780.0 47.0 1.0 3.0 1.0
+Point 4 786.0 56.0 1.0 4.0 1.0
+Point 5 794.0 65.0 1.0 5.0 1.0
+Point 6 800.0 69.0 1.0 6.0 1.0
+Point 7 805.0 88.0 1.0 7.0 1.0
+Point 8 804.0 100.0 1.0 8.0 1.0
+Point 9 814.0 110.0 1.0 9.0 1.0
+Point 10 823.0 125.0 1.0 10.0 1.0
+Point 11 833.0 132.0 1.0 11.0 1.0
+Point 12 840.0 137.0 1.0 12.0 1.0
+Point 13 847.0 145.0 1.0 13.0 1.0
+Point 14 851.0 151.0 1.0 14.0 1.0
+Point 15 850.0 156.0 1.0 15.0 1.0
+Point 16 853.0 165.0 1.0 16.0 1.0
+Point 17 857.0 166.0 1.0 17.0 1.0
+Point 18 859.0 173.0 1.0 18.0 1.0
+Point 19 859.0 178.0 1.0 19.0 1.0
+Point 20 860.0 186.0 1.0 20.0 1.0
+Point 21 863.0 193.0 1.0 21.0 1.0
+Point 22 857.0 207.0 1.0 22.0 1.0
+Point 23 846.0 215.0 1.0 23.0 1.0
+Point 24 838.0 220.0 1.0 24.0 1.0
+Point 25 835.0 220.0 1.0 25.0 1.0
+Point 26 833.0 225.0 1.0 26.0 1.0
+Point 27 831.0 232.0 1.0 27.0 1.0
+Point 28 824.0 237.0 1.0 28.0 1.0
+Point 29 819.0 238.0 1.0 29.0 1.0
+Point 30 821.1979865771812 244.5939597315436 1.0 30.0 1.0
+Point 31 821.9429530201342 250.55369127516778 1.0 31.0 1.0
+Point 32 827.9026845637584 269.17785234899327 1.0 32.0 1.0
+Point 33 836.8422818791946 287.0570469798658 1.0 33.0 1.0
+Point 34 849.506711409396 305.68120805369125 1.0 34.0 1.0
+Point 35 855.4664429530201 322.8154362416107 1.0 35.0 1.0
+Point 36 860.6812080536912 335.47986577181206 1.0 36.0 1.0
+Point 37 869.6208053691274 346.65436241610735 1.0 37.0 1.0
+Point 38 875.5805369127517 359.3187919463087 1.0 38.0 1.0
+Point 39 882.2852348993288 377.9429530201342 1.0 39.0 1.0
+Point 40 882.2852348993288 385.3926174496644 1.0 40.0 1.0
+Point 41 880.7953020134228 394.3322147651007 1.0 41.0 1.0
+Point 42 881.5402684563758 408.486577181208 1.0 42.0 1.0
+Point 43 882.2852348993288 421.8959731543624 1.0 43.0 1.0
+Point 44 880.7953020134228 430.83557046979865 1.0 44.0 1.0
+Point 45 873.3456375838925 443.5 1.0 45.0 1.0
+Point 46 872.6006711409395 462.12416107382546 1.0 46.0 1.0
+Point 47 867.3859060402684 472.55369127516775 1.0 47.0 1.0
+Point 48 853.9765100671141 495.6476510067114 1.0 48.0 1.0
+Point 49 848.761744966443 501.60738255033556 1.0 49.0 1.0
+Point 50 828.6476510067114 502.35234899328856 1.0 50.0 1.0
+Point 51 813.0033557046979 495.6476510067114 1.0 51.0 1.0
+Point 52 800.3389261744966 497.13758389261744 1.0 52.0 1.0
+Point 53 792.1442953020133 496.3926174496644 1.0 53.0 1.0
+Point 54 788.4194630872483 512.0369127516778 1.0 54.0 1.0
+Point 55 792.8892617449665 527.6812080536913 1.0 55.0 1.0
+Point 56 796.6140939597315 538.8557046979865 1.0 56.0 1.0
+Point 57 799.5939597315436 537.3657718120805 1.0 57.0 1.0
+Point 58 801.8288590604027 541.8355704697987 1.0 58.0 1.0
+Point 59 801.8288590604027 541.8355704697987 1.0 59.0 1.0
+Point 60 804.8087248322147 546.3053691275168 1.0 60.0 1.0
+Point 61 813.0033557046979 554.5 1.0 61.0 1.0
+Point 62 814.493288590604 553.0100671140939 1.0 62.0 1.0
+Point 63 815.98322147651 555.989932885906 1.0 63.0 1.0
+Point 64 810.0234899328859 563.4395973154362 1.0 64.0 1.0
+Point 65 813.0033557046979 564.1845637583892 1.0 65.0 1.0
+Point 66 816.728187919463 567.1644295302013 1.0 66.0 1.0
+Point 67 824.1778523489933 568.6543624161073 1.0 67.0 1.0
+Point 68 823.4328859060403 575.3590604026846 1.0 68.0 1.0
+Point 69 822.6879194630873 578.3389261744966 1.0 69.0 1.0
+Point 70 827.1577181208054 576.8489932885906 1.0 70.0 1.0
+Point 72 833.1174496644295 573.1241610738255 1.0 71.0 1.0
+Track 2 FFFF00 true
+Point 1 903.1666666666666 66.16666666666667 1.0 1.0 1.0
+Point 2 909.8333333333334 76.16666666666667 1.0 2.0 1.0
+Point 3 916.5 73.5 1.0 3.0 1.0
+Point 4 921.1666666666666 75.5 1.0 4.0 1.0
+Point 5 923.1666666666666 71.5 1.0 5.0 1.0
+Point 6 929.8333333333334 76.83333333333333 1.0 6.0 1.0
+Point 7 935.8333333333334 83.5 1.0 7.0 1.0
+Point 8 941.1666666666666 89.5 1.0 8.0 1.0
+Point 9 940.5 94.83333333333333 1.0 9.0 1.0
+Point 10 943.8333333333334 90.16666666666667 1.0 10.0 1.0
+Point 11 948.5 89.5 1.0 11.0 1.0
+Point 12 952.5 88.16666666666667 1.0 12.0 1.0
+Point 13 950.5 84.16666666666667 1.0 13.0 1.0
+Point 14 947.8333333333334 81.5 1.0 14.0 1.0
+Point 15 950.5 78.16666666666667 1.0 15.0 1.0
+Point 16 952.5 75.5 1.0 16.0 1.0
+Point 17 952.5 70.16666666666667 1.0 17.0 1.0
+Point 18 948.5 62.833333333333336 1.0 18.0 1.0
+Point 19 951.1666666666666 61.5 1.0 19.0 1.0
+Point 20 951.8333333333334 63.5 1.0 20.0 1.0
+Point 21 956.5 56.833333333333336 1.0 21.0 1.0
+Point 22 961.1666666666666 56.166666666666664 1.0 22.0 1.0
+Point 23 962.5 54.166666666666664 1.0 23.0 1.0
+Point 24 961.8333333333334 50.833333333333336 1.0 24.0 1.0
+Point 25 964.5 48.166666666666664 1.0 25.0 1.0
+Point 26 965.1666666666666 45.5 1.0 26.0 1.0
+Point 27 961.8333333333334 50.166666666666664 1.0 27.0 1.0
+Point 28 962.5 46.166666666666664 1.0 28.0 1.0
+Point 29 962.5 42.166666666666664 1.0 29.0 1.0
+Point 30 961.8333333333334 35.5 1.0 30.0 1.0
+Point 31 961.8333333333334 28.166666666666668 1.0 31.0 1.0
+Point 32 963.8333333333334 28.833333333333332 1.0 32.0 1.0
+Point 33 963.1666666666666 27.5 1.0 33.0 1.0
+Point 34 961.1666666666666 29.5 1.0 34.0 1.0
+Point 35 955.8333333333334 26.166666666666668 1.0 35.0 1.0
+Point 36 951.8333333333334 21.5 1.0 36.0 1.0
+Point 37 947.1666666666666 16.166666666666668 1.0 37.0 1.0
+Point 38 947.1666666666666 6.833333333333333 1.0 38.0 1.0
+End of MTrackJ Data File
diff --git a/man/mdftracks.example.data.Rd b/man/mdftracks.example.data.Rd