Main Takeaway

Following the tutorial https://broadinstitute.github.io/wot/tutorial/

Tissues

• FLE
• a budget of descendant mass
• 用什么来算transport cost?(mass *squared distance traveled)
• KL-divergence:从采样角度出发对KL散度进行直观解释：KL散度描述了我们用分布 来估计数据的真实分布 的编码损失。 https://zhuanlan.zhihu.com/p/438129018
• PCA space,PCA(Principal Components Analysis)主成分分析,主成分分析（Principal Component Analysis, PCA）是一种线性降维算法，也是一种常用的数据预处理（Pre-Processing）方法。它的目标是是用方差（Variance）来衡量数据的差异性，并将差异性较大的高维数据投影到低维空间中进行表示。 https://zhuanlan.zhihu.com/p/60664507
• logistic function是怎么来的
• 算出来的精度还不一样？
• growth iteration:When we do more than one growth iteration, the value of λ1 can be interpreted intuitively as an inverse step size in our update of growth rates. A large value allows us to change growth by a lot at each iteration.???
• Markov：https://zhuanlan.zhihu.com/p/489239366,无后效性
• widgets.interactive()???
• Shared Ancestry 表达ancestors与descendants
• Fate Matrices?有什么用，前面不是都表达了马？
• 重心坐标（Barycentric coordinates）
• Notebook 6: Transition tables?

References

• https://zhuanlan.zhihu.com/p/438129018
• https://zhuanlan.zhihu.com/p/60664507
• https://zhuanlan.zhihu.com/p/489239366
• https://zhuanlan.zhihu.com/p/58199366