Workshop CDSB 2024: Desarrollo de paqueterías de R/Bioconductor.

28-31 de octubre de 2024

Les damos la bienvenida al Workshop Desarrollo de paqueterías de R/Bioconductor!

Nos da gusto anunciar que la CDSB, junto con la Red Mexicana de Bioinformática (RMB) y el Nodo Nacional de Bioinformática en la UNAM (NNB-CCG), está organizando el taller Desarrollo de paqueterías de R/Bioconductor como parte del Encuentro Nacional de Bioinformática México 2024.

Todas las sesiones serán teóricas y prácticas. Nos enfocaremos en dos temas principales:

• Creación de paquetes de R/Bioconductor
• Generación de sitios web para la documentación de paquetes de R

¡Registrate aquí!

Instructores

• Dra. Joselyn Cristina Chávez Fuentes: Estancia Postdoctoral en Icahn School of Medicine at Mount Sinai.
• Dra. Alejandra Medina Rivera: Investigadora Asociada en el Laboratorio Internacional de Investigación de Medicina Genómica, UNAM.
• Dra. Yalbi I. Balderas-Martínez: Investigadora en el Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias Ismael Cosío Villegas.
• Dra. Mirna Vázquez Rosas Landa: Investigadora en el Instituto de Ciencias de Mar y Limnología de la UNAM.
• M.C. Erick Cuevas Fernández: Estudiante de Doctorado en la Universidad Nacional Autónoma de México.
• M.C. José Antonio Ovando Ricárdez

Ayudantes

• Dra. Evelia Coss: Posdoctoral en el Laboratorio Internacional de Investigación de Medicina Genómica, UNAM.

Temario

Consulta el calendario de este curso en: http://bit.ly/calendarcdsb2024

• Día 1: Flujo de trabajo orientado a proyectos:

  • Introducción al trabajo con proyectos de RStudio.
  • Paths seguros.
  • Control de versiones con GitHub y RStudio.
  • Solución de problemas con las versiones de paquetes de Rstudio.

• Día 2: Creación de paquetes de R/Bioconductor Parte I

  • Infraestructura de un paquete de R/Bioconductor.
  • Documentación de funciones.
  • Sesión social: Conociendo a la comunidad.
  • Proyectos colaborativos Parte I.

• Día 3: Creación de paquetes de R/Bioconductor Parte II

  • Diseño de pruebas.
  • Creación de viñetas.
  • Compilación e instalación de paquetes.
  • Proyectos colaborativos Parte II.

• Día 4: Creación de sitios web para la documentación de paquetes de R

  • Creación de sitios web con pkgdown
  • Proyectos colaborativos Parte III.
  • Presentación de proyectos.
  • Clausura.

Materiales

Puedes consultar el libro electrónico en: https://comunidadbioinfo.github.io/cdsb2024/

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