Skip to content

Latest commit

 

History

History
2485 lines (2112 loc) · 99.2 KB

ncov_sit-rep_el_2020-03-20.md

File metadata and controls

2485 lines (2112 loc) · 99.2 KB
title authors authorLinks affiliations translators translatorLinks date dataset abstract
Γενομική ανάλυση της εξάπλωσης του COVID-19. Κατάσταση 2020-03-20.
Emma Hodcroft
Nicola Müller
Cassia Wagner
Misja Ilcisin
James Hadfield
Sidney M. Bell
Richard Neher
Trevor Bedford
Fred Hutch, Seattle, USA; Biozentrum, Basel, Switzerland; CZI, CA, USA
Sotiris Salloumis
Sofia Paraskevopoulou
20 Μαρτίου 2020
Aυτή η αναφορά χρησιμοποιεί δεδομένα που είναι δημοσίως διαθέσιμα για την ιχνηλάτηση της εξάπλωσης του COVID-19. Οι αναφορές ενημερώνονται κάθε εβδομάδα.
# Περιληψη

Έχουμε αναλύσει 723 δημοσίως διαθέσιμα COVID-19 γονιδιώματα. Συγκρίνοντας τα ιικά γονιδιώματα μεταξύ τους, μπορούμε να χαρακτηρίσουμε να αντιληφθούμε πώς ο COVID-19 μετακινείται σε όλο τον κόσμο.

Σε αυτή την αναφορά, υπογραμμίζουμε ότι ο ιός έχει εισαχθεί και κυκλοφορεί σε πολλά μέρη του πλανήτη.

Γνωρίζοντας εάν και σε ποιο βαθμό ο COVID-19 κυκλοφορεί τοπικά και πώς τα ενδεχόμενα μέτρα για τον περιορισμό του μπορούν να επιβραδύνουν αυτή την εξάπλωση, προϋποθέτει μια καλή γνώση της δυναμικής της επιδημίας του ιού τοπικά. Αυτό με τη σειρά του προϋποθέτει εκτενείς ελέγχους.

Το γεγονός αυτό καταδεικνύει τη σημασία των εντατικών ελέγχων ώστε να καθυστερήσουν τα γεγονότα μετάδοσης του ιού.

Στις ενημερώσεις αυτής της εβδομάδας περιλαμβάνονται:  

* Αποδεικτικά στοιχεία για εισαγωγές που σχετίζονται με ταξίδια σε πολλά μέρη του κόσμου.
* Πολλά μέρη με πρόσφατες εισαγωγές του ιού μπορούν να αναμένουν ότι τα κρούσματα θα επεκταθούν σε ένα χρονικό διάστημα 4-8 εβδομάδων. Αυτά τα μέρη πρέπει τώρα να προετοιμαστούν.
* Πολλά μέρη τα οποία πρόσφατα υιοθέτησαν μέτρα κοινωνικής απόστασης μπορούν να αναμένουν αύξηση της συσσώρευσης κρουσμάτων βραχυπρόθεσμα, αλλά τα νέα κρούσματα θα πιάσουν πλατώ και θα μειωθούν σε βάθος χρόνου.
* Οι έλεγχοι σε ασθενείς αλλά και σε αυτούς που ξεπέρασαν την ασθένεια θα είναι ζωτικής σημασίας στην αντιμετώπιση της επιδημίας.

Έχουμε ετοιμάσει ορισμένες πηγές πληροφόρησης που αξίζει να διαβάσετε για να εξοικειωθείτε με την ασθένεια COVID-19 και τον ιό που την προκαλεί, τον SARS-CoV-2. Οι πληροφορίες αυτές θα διευκολύνουν την ερμηνεία των δεδομένων που παρουσιάζουμε σε αυτή την αναφορά. Αν δεν είστε εξοικειωμένοι με φυλογενετικά δέντρα σας συνιστούμε να ελέγξετε το άρθρο 'Πώς να διαβάσετε μια φυλογένεση' και να επιστρέψετε όταν είστε έτοιμοι.


## Ιστορικό

<div>
  <a href="https://nextstrain.org/help/coronavirus/human-CoV"><img alt="microscopy image of coronaviruses" width="100" src="https://nextstrain.org/static/ncov_narrative-76cfd610d11ef708d213a3170de9519f.png"/> Ιστορικό των κορονοϊών </a>

  <a href="https://nextstrain.org/help/coronavirus/SARS-CoV-2"><img alt="illustration of a coronavirus" width="100" src="http://data.nextstrain.org/img_nCoV-CDC.jpg"/> Πρόσφατο ιστορικό της νόσου COVID-19 </a>

  <a href="https://nextstrain.org/narratives/trees-background/"><img alt="cartoon of a phylogenetic tree" width="100" src="http://data.nextstrain.org/img_toy_alignment_mini.png"/> Πώς να διαβάσετε Φυλογενέσεις</a>
</div>

## Περαιτέρω ανάγνωση

* Περίληψη της επιδημίας του ιού SARS-CoV-2 [Wikipedia](https://el.wikipedia.org/wiki/Πανδημία_κορονοϊού_2019–20).
* Όλοι οι αριθμοί των κρουσμάτων που αναφέρονται στην παρούσα αναφορά προέρχονται από τον Παγκόσμιο Οργανισμό Υγείας  [ΠΟΥ](https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20200318-sitrep-58-covid-19.pdf?sfvrsn=20876712_2) από τις 20.03.2020.

Αυτή τη στιγμή έχουμε αλληλουχίες από δείγματα που έχουν ληφθεί σε 36 χώρες σε 6 ηπείρους. Αυτό είναι ένα αξιόλογο κατόρθωμα - η αλληλούχηση ενός ιού με μεγάλο RNA γονιδίωμα εν μέσω πανδημίας είναι δύσκολη και είναι η εξαιρετική δουλειά και ο συνεχής διαμοιρασμός δεδομένων από επιστήμονες και γιατρούς σε όλο τον κόσμο που την καθιστούν δυνατή.

Τα δεδομένα αυτά μας επιτρέπουν να κατανοήσουμε πολλά και χρήσιμα χαρακτηριστικά της πανδημίας και να ιχνηλατίσουμε την εξάπλωσή της σε πραγματικό χρόνο. Ταυτόχρονα όμως είναι σημαντικό να τονίσουμε ότι τα συμπεράσματά μας είναι περιορισμένα λόγω της περιορισμένης διαθεσιμότητας δεδομένων. Από τον πραγματικό αριθμό κρουσμάτων, μόνο ένα μέρος υποβάλλεται σε έλεγχο. Από αυτά που ελέγχονται, μόνο ένα υποσύνολο δειγμάτων υποβάλλεται σε αλληλούχηση. Το υποσύνολο των κρουσμάτων που υπόκειται σε έλεγχο διαφέρει αρκετά στις διάφορες γεωγραφικές τοποθεσίες αλλά και μέσα στο χρόνο. Επίσης, οι φυλογενετικές αναλύσεις της πανδημίας συνδέονται πάντα με ένα βαθμό αβεβαιότητας.

Ας δούμε μερικά παραδείγματα

Ο χάρτης δείχνει πολύ λίγες αλληλουχίες από τον παγκόσμιο νότο. Για παράδειγμα, έχουμε αλληλουχίες για μόλις 4 από τις 25 χώρες της Λατινικής Αμερικής όπου ο ΠΟΥ αναφέρει υπάρχουν κρούσματα του COVID-19. Αυτό δεν οφείλεται στο γεγονός ότι ο COVID-19 δεν κυκλοφορεί στις περιοχές αυτές ή ότι αυτά τα κρούσματα δεν είναι τόσο χρήσιμα στην κατανόηση της πανδημίας, αλλά επειδή δεν υπάρχουν πολλά δεδομένα διαθέσιμα από τις περιοχές αυτές.

Σε άλλες περιοχές, όπως η Ολλανδία, υπάρχει διαθέσιμος ένας τεράστιος αριθμός αλληλουχιών σε σχέση με το συνολικό αριθμό κρουσμάτων.

Επομένως, όταν διαβάζετε αυτή την αναφορά, έχετε στο νου σας ότι το μέγεθος κάθε κύκλου στο χάρτη αντιπροσωπεύει το μέγεθος των δεδομένων που είναι αυτή τη στιγμή διαθέσιμα από την εκάστοτε περιοχή και όχι το πραγματικό μέγεθος της επιδημίας. Μπορείτε να διαβάσετε εδώ για το πώς το γεγονός αυτό επιδρά στα συμπεράσματα που εξάγονται σχετικά με την εξάπλωση του ιού.

Ο εντοπισμός της περιοχής όπου ένα κρούσμα μολύνθηκε με τον ιό είναι σημαντικός στον εντοπισμό των περιοχών που βιώνουν τοπική εξάπλωση, σε αντίθεση με κρούσματα που συνδέονται αποκλειστικά με ιστορικά ταξιδίων. Οι αλληλουχίες μας βοηθούν να διακρίνουμε αυτά τα δύο σενάρια μεταξύ τους.

Εδώ το δέντρο είναι χρωματισμένο με βάση το ιστορικό ταξιδίου ενός κρούσματος, όταν αυτό ήταν γνωστό. Βλέποντας την αλληλουχία από τον Καναδά (Canada/BC_78548/2020) στη μέση, παρατηρούμε ότι έχει ένα ιστορικό ταξιδιού στην Ευρώπη. Αυτό το κρούσμα ομαδοποιείται με άλλες ευρωπαϊκές αλληλουχίες, δείχνοτας έτσι ότι σχετίζεται σχεδόν με σιγουριά με ένα γεγονός ταξιδίου.

Με σμίκρυνση, βλέπουμε ότι αυτό δεν είναι πάντα συνεπές.

Εδώ μπορούμε να δούμε ότι σχεδόν όλα τα κρούσματα που έχουν πρόσφατα ιστορικά ταξιδίων στο Ιράν, ομαδοποιούνται στη μέση του δέντρου.

Προς την κορυφή του δέντρου βλέπουμε επίσης ένα καναδικό κρούσμα με ιστορικό ταξιδιού στο Ιράν. Ωστόσο, αυτή η αλληλουχία δεν ομαδοποιείται με κανένα άλλο κρούσμα που έχει ιστορικό ταξιδίου στο Ιράν.

Είναι σχεδόν σίγουρο αυτό το άτομο είχε μολυνθεί από μια δευτερογενή αλυσίδα μετάδοσης του ιού στο Ιράν, αλλά μέχρι να έχουμε περισσότερα δεδομένα δεν μπορούμε να βεβαιώσουμε ότι αυτή η μόλυνση έλαβε χώρα στο ταξίδι.

Στο δέντρο βλέπουμε πολλά ανάμικτα δείγματα από διαφορετικές χώρες. Αυτό σημαίνει ότι αυτού του είδους η αναπόφευκτη μετακίνηση των ανθρώπων έχει ήδη εισάγει τον ιό σε πολλά μέρη της υφηλίου.

Όντως ο ΠΟΥ αναφέρει ότι υπάρχουν επιβεβαιωμένα κρούσματα σε 159 από τις 195 χώρες του κόσμου.

Ωστόσο, δεν έχουν εισαγωγές αποτέλεσμα τη δημιουργία τοπικών επιδημιών.

Ίσως φαίνεται ότι ο COVID-19 εξερράγη ξαφνικά. Για πολλούς ανθρώπους, η πανδημία αυτή φαινομενικά ίσως μέσα σε μια βραδιά να έγινε από μια αφηρημένη ανησυχία που αγγίζει μακρινά μέρη στον κόσμο σε κάτι που έχει σοβαρές επιπτώσεις στην καθημερινή τους ζωή.

Όμως ας έχουμε κατά νου ότι αυτό είναι κάτι που κυκλοφορεί ήδη κάποιον καιρό. Δε σημαίνει απαραίτητα ότι ο ιός εισάγεται σε μερικά μέρη πιο συχνά από ότι σε άλλα. Το πιο πιθανό είναι ότι σε πολλά μέρη τώρα γίνεται αντιληπτή η επιδημία η οποία ωστόσο είχε ήδη ξεκινήσει αρκετές εβδομάδες πριν.

Περιοχές που δεν γνωρίζουν ακόμη τοπικά κρούσματα θα πρέπει να προετοιμαστούν τώρα και να ξεκινήσουν τους ελέγχους επιτήρησης.

# Πώς οι εισαγωγές καταλήγουν σε επιδημίες;

Μερικές φορές οι εισαγωγές δεν καταλήγουν σε δευτερογενή κρούσματα ή σε τοπικά ξεσπάσματα - ειδικά εάν το αρχικό κρούσμα εντοπιστεί και απομονωθεί εγκαίρως.
Πολλές φορές ωστόσο, ο ιός εξαπλώνεται χωρίς να εντοπίζεται στον τοπικό πληθυσμό μέχρι το ξέσπασμα να αγγίξει ένα σημαντικό μέρος του πληθυσμού.
Παρακάτω είναι ένα πείραμα σκέψηςτο οποίο δείχνει πώς το παραπάνω έπαιξε ρόλο στο Wuhan. Ο άξονας ψ αντιπροσωπεύει το χώρο, ο άξονας χ το χρόνο. H σκιασμένη περιοχή αντιπροσωπεύει τον αριθμό κρουσμάτων.

"Ο COVID-19 στο Wuhan εξελίχθηκε από ένα μοναδικό κρούσμα την περίοδο του Νοέμβρη 2019, σε πολλές χιλιάδες κρούσματα στα μέσα Γενάρη 2020, ξεκινώντας από ένα αρχικό κρούσμα και καταλήγοντας σε μια εκτεταμένη τοπική εξάπλωση σε ένα χρονικό διάστημα περίπου 10 εβδομάδων. Θεωρούμε ότι τα διεθνή γεγονότα διασποράς του ιού ξεκίνησαν γύρω στα μέσα του Γενάρη 2020. Επομένως έχουμε τις περίπου 10 κρίσιμες εβδομάδες από τότε έως και τα τέλη Μάρτη ώστε να περιορίσουμε τα γεγονότα αυτά της πανδημίας πριν να πάρουν μεγάλες διαστάσεις" [- Trevor Bedford](https://twitter.com/trvrb/status/1226241284207038464), Φεβρουάριος 2020

Αυτά τα νέα κρούσματα μπορούν με τη σειρά τους να προκαλέσουν περαιτέρω εισαγωγές του ιού σε άλλες τοποθεσίες.

<img src="https://github.com/nextstrain/ncov/raw/master/figures/local-spark-expansion.jpeg" width="70%">


Βλέπουμε ένα ξεκάθαρο παράδειγμα ανάπτυξης μιας μολυσματικής εστίας στα δεδομένα από την πολιτεία της Washington. Η κύλιση του κέρσορα πάνω στη ρίζα του κεντρικού κλαδιού δείχνει ότι ο ιός πιθανών εισήχθη σε αυτήν την περιοχή μεταξύ του τέλους Ιανουαρίου και μέσα Φεβρουαρίου 2020. (μέθοδοι).

Τώρα, στα μέσα Μαρτίου (~ 6 εβδομάδες αργότερα), βλέπουμε ότι μια τοπική εστία φαίνεται ξεκάθαρα στην περιοχή. Από τα δεδομένα των αλληλουχιών μόνο, υπολογίζουμε ένα ρυθμό διπλασιασμού κάθε 3-6 μέρες υποθέτοντας ότι ο πληθυσμός αυξάνεται εκθετικά.

Μπορούμε επίσης να δούμε ένα παράδειγμα του πώς εστίες που αρχικά εντοπίζονται τοπικά, σπείρουν τον ιό σε άλλες τοποθεσίες. Τα δείγματα από τη Utah κοντά στην κορυφή του δέντρου (πορτοκαλί χρώμα) φωλιάζουν μέσα στο κύριο κλαδί της επιδημίας στην Washington. Το γεγονός αυτό σημαίνει ότι υπήρξε μια εισαγωγή από την Washington στη Utah, αφήνοντας ωστόσο την πιθανότητα να υπήρχαν ενδιάμεσα βήματα στην αλυσίδα μετάδοσης.

Δεν γνωρίζουμε με σιγουριά εάν αυτή η εισαγωγή θα οδηγήσει σε τοπικό ξέσπασμα στη Utah. Ωστόσο αν ο ιός συνεχίσει να εξαπλώνεται μετά από αυτές τις εισαγωγές, αναμένουμε να δούμε την εξάπλωση να ξεδιπλώνεται μέσα στις επόμενες 4 εβδομάδες.

Αυτό είναι μόνο ένα παράδειγμα. Ίσως υπάρχουν κι άλλες εισαγωγές στη Utah ή και σε άλλες περιοχές που δεν μπορούμε να δούμε στο δέντρο διότι δεν έχουν αλληλουχηθεί. Το πιο σημαντικό ωστόσο είναι να προετοιμαστούν τώρα οι περιοχές που δεν έχουν καταγράψει κρούσματα και να ξεκινήσουν ελέγχους επιτήρησης.

Ακολουθώντας την ίδια λογική, ενδεχομένως να υπάρχουν πολλές αλυσίδες τοπικής εξάπλωσης τις οποίες δε γνωρίζουμε.

Αυτό σημαίνει ότι ακόμη και σε περιοχές που έχουν επιβληθεί μέτρα κοινωνικού περιορισμού, θα πρέπει να περιμένουμε ότι τα κρούσματα θα αυξηθούν τις επόμενες εβδομάδες. Αυτές οι αυξήσεις ΔΕΝ αποτελούν απόδειξη ότι τα μέτρα απομόνωσης δε λειτουργούν. Χρειάζετει να περάσει χρόνος ώστε αυτοί που φέρουν τον ιό (και πιθανώς και τα μέλη των οικογενειών τους) να αναπτύξουν συμπτώματα, να νοσηλευθούν και να ανακάμψουν. Αναμένουμε επίσης να δούμε μια μεγάλη αύξηση στον αριθμό των επιβεβαιωμένων κρουσμάτων, όσο οι έλεγχοι πραγματοποιούνται σε μεγαλύτερο φάσμα και καθίστανται ευρέως διαθέσιμοι.

Είναι κρίσιμης σημασίας να διατηρούνται τα μέτρα κοινωνικής απόστασης κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου. Όπως φαίνεται στα δεξιά, ο αριθμός των κρουσμάτων συνεχίζει να αυξάνεται μετά την εφαρμογή των μέτρων. Όμως σε βάθος χρόνου, ο συνολικός αριθμός κρουσμάτων μειώνεται σημαντικά.

## Τα μέτρα κοινωνικής απομάκρυνσης δεν σταματούν την εξάπλωση μέσα σε μια νύχτα, αλλά μειώνουν σημαντικά τα κρούσματα και τους θανάτους σε βάθος χρόνου.
Τα μέτρα κοινωνικής απομάκρυνσης - δηλαδή μείωση του αριθμού των ατόμων που συναντάτε κάθε μέρα - μπορεί να είναι δύσκολα στην εφαρμογή τους, είναι ωστόσο κρίσιμης σημασίας για το κοινό καλό.

Αν ο καθένας μείωνε τις καθημερινές επαφές κατά 25%, αναμένουμε μια μείωση της τάξης του 50% στο συνολικό αριθμό κρουσμάτων μέσα στον επόμενο μήνα ([Klein κλπ., 2020-03-13](https://institutefordiseasemodeling.github.io/COVID-public/reports/Working%20paper%20%E2%80%93%20model-based%20estimates%20of%20COVID-19%20burden%20in%20King%20and%20Snohomish%20counties%20through%20April%207.pdf)).
<div>
  <img src="https://github.com/nextstrain/ncov/raw/master/figures/social-distancing-efficacy.png" width="70%">
</div>

  • Ο ιός έχει εισαχθεί σε πολλά μέρη του πλανήτη πολλαπλές φορές.

- Υπάρχουν ενδείξεις για τοπική διασπορά σε πολλές περιοχές. Πέραν τούτου, αναμένουμε ότι οι προγενέστερες εισαγωγές έχουν ήδη εμφυτεύσει πολλές τοπικές επιδημίες οι οποίες θα φανερωθούν τις ερχόμενες εβδομάδες.
- Ο έλεγχος των τοπικών εστιών μέσω της εφαρμογής μέτρων κοινωνικής απομάκρυνσης είναι ζωτικής σημασίας για να: - Ισοπεδωθεί η καμπύλη (#FlattenTheCurve) ώστε να αποφευχθεί η υπερφόρτωση των συστημάτων υγείας από συρρέοντα περιστατικά - Μειωθεί ο συνολικός αριθμός κρουσμάτων και θανάτων   - Δοθεί χρόνος ώστε να αναπτυχθούν θεραπείες και εμβόλια   
# Τί μπορείτε να κάνετε
## ...ο καθένας ξεχωριστά
* Μειώστε δραματικά τον αριθμό των ανθρώπων που έρχεστε σε επαφή καθημερινά, ειδικά εάν ανήκετε σε ομάδα κινδύνου (π.χ. ηλικιωμένοι και άνθρωποι με βεβαρυμένο ιστορικό υγείας).
* Να θυμάστε ότι ακόμα και αν δεν ανήκετε σε ομάδα κινδύνου, πολλοί άνθρωποι γύρω σας ανήκουν σε αυτές. Ακολουθήστε αυτές τις πρακτικές ώστε να προστατεύσετε τους γύρω σας.
* Πλένετε τα χέρια σας "σα να έχετε κόψει μια καυτερή πιπεριά και πρέπει να αλλάξετε φακούς επαφής".
* Μείνετε στο σπίτι όσο γίνεται περισσότερο -- ειδικά εάν είστε άρρωστοι. Προμηθευτείτε τις απαραίτητες ποσότητες τροφίμων σε περίπτωση που πρέπει να μπείτε σε καραντίνα.
* Εάν είστε εργοδότης, ενθαρρύνετε τους εργαζομένους σας να δουλεύουν από το σπίτι όσο αυτό είναι δυνατό.

## ...η πολιτεία  
* Κάνετε εκτεταμένους και δωρεάν ελέγχους για τον εντοπισμό του ιού.
* Εφαρμόστε ισχυρά μέτρα απομόνωσης.
* Χρηματοδοτείστε και υλοποιήστε προσπάθειες ιχνηλάτησης.
* Υποστηρίξτε οικονομικά αυτούς που πλήγονται από τα μέτρα αποκλεισμού (π.χ. ωρομίσθιους, ανθρώπους που εργάζονται στον τομέα φροντίδας παιδιών και ηλικιωμένων, μικρές επιχειρήσεις, κλπ).

Θα θέλαμε να ευχαριστήσουμε αυτήν την υπέροχη και συνεχή προσπάθεια όλων των επιστημόνων που έχουν εργαστεί σε αυτήν την πανδημία, και ιδιαιτέρως αυτούς που δουλεύουν στην Κίνα. Μόνο μέσα από τον άμεσο διαμοιρασμό γενομικών δεδομένων και μεταδεδομένων, αναλύσεις σαν και αυτή είναι δυνατό να πραγματοποιηθούν.


Επίσης ευχαριστούμε θερμά την πλατφόρμα [GISAID](https://www.gisaid.org/) στη οποία ανεβαίνουν και μοιράζονται τα δεδομένα.

Είμαστε ευγνώμονες για τα δεδομένα που συλλέχθηκαν από αυτά τα αρχικά εργαστήρια:

* Arizona Department of Health Services
* Auckland Hospital
* BCCDC Public Health Laboratory
* Bamrasnaradura Hospital
* Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology
* Bundeswehr Institute of Microbiology
* CNR Virus des Infections Respiratoires - France SUD
* CR&WISCO GENERAL HOSPITAL
* California Department of Health
* California Department of Public Health
* Center of Medical Microbiology, Virology, and Hospital Hygiene
* Center of Medical Microbiology, Virology, and Hospital Hygiene, University of Duesseldorf
* Centers for Disease Control, R.O.C. (Taiwan)
* Centre for Human and Zoonotic Virology (CHAZVY), College of Medicine University of Lagos/Lagos University Teaching Hospital (LUTH), part of the Laboratory Network of the Nigeria Centre for Disease Control (NCDC)
* Centre for Infectious Diseases and Microbiology - Public Health
* Centre for Infectious Diseases and Microbiology Laboratory Services
* Centre for Infectious Diseases and Microbiology- Public Health
* Centro Hospital do Porto, E.P.E. - H. Geral de Santo Antonio
* Centro Hospitalar e Universitario de Sao Joao, Porto
* Charite Universitatsmedizin Berlin, Institute of Virology; Institut fur Mikrobiologie der Bundeswehr, Munich
* Department of Infectious Diseases, Istituto Superiore di Sanita, Roma , Italy
* Department of Infectious Diseases, Istituto Superiore di Sanita, Rome, Italy
* Department of Infectious and Tropical Diseases, Bichat Claude Bernard Hospital, Paris
* Department of Internal Medicine, Triemli Hospital
* Department of Laboratory Medicine, National Taiwan University Hospital
* Department of Microbiology, Institute for Viral Diseases, College of Medicine, Korea University
* Department of Pathology, Toshima Hospital
* Department of Virology III, National Institute of Infectious Diseases
* Department of Virology and Immunology, University of Helsinki and Helsinki University Hospital, Huslab Finland
* Department of microbiology laboratory,Anhui Provincial Center for Disease Control and Prevention
* Dept. of Pathology, National Institute of Infectious Diseases
* Dept. of Virology III, National Institute of Infectious Diseases
* Dienst Gezondheid & Jeugd Zuid-Holland Zuid
* Division of Infectious Diseases, Department of Internal Medicine, Korea University College of Medicine
* Division of Infectious Diseases, University Hospital Zurich
* Division of Viral Diseases, Center for Laboratory Control of Infectious Diseases, Korea Centers for Diseases Control and Prevention
* Dutch COVID-19 response team
* ErasmusMC
* Foundation Elisabeth-Tweesteden Ziekenhuis
* Foundation Pamm
* Fujian Center for Disease Control and Prevention
* General Hospital of Central Theater Command of People's Liberation Army of China
* Guangdong Provincial Center for Diseases Control and Prevention; Guangdong Provincial Public Health
* Guangdong Provincial Center for Diseases Control and Prevention; Guangdong Provinical Public Health
* Guangdong Provincial Center for Diseases Control and Prevention;Guangdong Provincial Institute of Public Health
* Guangdong Provincial Institution of Public Health, Guangdong Provinical Center for Disease Control and Prevention
* HUS Diagnostiikkakeskus, Hallinto
* Hangzhou Center for Disease Control and Prevention
* Hangzhou Center for Disease and Control Microbiology Lab
* Harborview Medical Center
* Hong Kong Department of Health
* Hospital Israelita Albert Einstein
* Hospital Sao Joaquim Beneficencia Portuguesa
* IL Department of Public Health Chicago Laboratory
* INMI Lazzaro Spallanzani IRCCS
* Indian Council of Medical Research - National Institute of Virology
* Indian Council of Medical Research-National Institute of Virology
* Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College
* Institute of Viral Disease Control and Prevention, China CDC
* Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias
* Jingzhou Center for Disease Control and Prevention
* KU Leuven, Clinical and Epidemiological Virology
* Klinik Hirslanden Zurich
* Korea Centers for Disease Control & Prevention (KCDC) Center for Laboratory Control of Infectious Diseases Division of Viral Diseases
* Laboratoire National de Sante
* Laboratoire de Virologie, HUG
* Laboratorio di Microbiologia e Virologia, Universita Vita-Salute San Raffaele, Milano
* Laboratory Medicine
* Lapland Central Hospital
* MHC Brabant Zuidoost
* MHC Drente
* MHC Flevoland
* MHC Gooi & Vechtstreek
* MHC Haaglanden
* MHC Hart voor Brabant
* MHC Kennemerland
* MHC Rotterdam-Rijnmond
* MHC Utrecht
* MHC West-Brabant
* MSHS Clinical Microbiology Laboratories
* Massachusetts Department of Public Health
* Monash Medical Centre
* NHC Key laboratory of Enteric Pathogenic Microbiology, Institute of Pathogenic Microbiology
* National Centre for Infectious Diseases
* National Influenza Center - National Institute of Hygiene and Epidemiology (NIHE)
* National Influenza Centre, National Public Health Laboratory, Kathmandu, Nepal
* National Institute for Viral Disease Control and Prevention, China CDC
* National Public Health Laboratory
* National Public Health Laboratory, National Centre for Infectious Diseases
* Pathology Queensland
* Providence Regional Medical Center
* Public Health Ontario Laboratory
* RIVM
* Respiratory Virus Unit, Microbiology Services Colindale, Public Health England
* Seattle Flu Study
* Second Hospital of Anhui Medical University
* Serology, Virology and OTDS Laboratories (SAViD), NSW Health Pathology Randwick
* Servicio Microbiologia. Hospital Clinico Universitario. Valencia.
* Shenzhen Key Laboratory of Pathogen and Immunity, National Clinical Research Center for Infectious Disease, Shenzhen Third People's Hospital
* Shenzhen Third People's Hospital
* Singapore General Hospital
* Singapore General Hospital, Molecular Laboratory, Division of Pathology
* Sorbonne Universite, Inserm et Assistance Publique-Hopitaux de Paris (Pitie Salpetriere)
* South China Agricultural University
* State Health Office Baden-Wuerttemberg
* Taiwan Centers for Disease Control
* Texas Department of State Health Services
* The Central Hospital Of Wuhan
* The National Institute of Public Health Center for Epidemiology and Microbiology
* The University of Hong Kong - Shenzhen Hospital
* Tianmen Center for Disease Control and Prevention
* UCD National Virus Reference Laboratory
* UW Virology Lab
* Union Hospital of Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology
* Unknown
* Valley Medical Center
* Virology Department, Sheffield Teaching Hospitals NHS Foundation Trust
* Virology Unit, Institut Pasteur du Cambodge.
* WA State Department of Health
* Wales Specialist Virology Centre
* Washington State Department of Health
* Washington State Public Health Lab
* Weifang Center for Disease Control and Prevention
* West of Scotland Specialist Virology Centre, NHSGGC
* Wisconsin Department of Health Services
* Wuhan Fourth Hospital
* Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences
* Wuhan Jinyintan Hospital
* Wuhan Lung Hospital
* Yongchuan District Center for Disease Control and Prevention
* Zhejiang Provincial Center for Disease Control and Prevention
* Zhongxian Center for Disease Control and Prevention
* Andersen Lab, The Scripps Research Institute
* Arizona Department of Health Services
* Auckland Hospital
* BCCDC Public Health Laboratory
* Bamrasnaradura Hospital
* Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology
* Bundeswehr Institute of Microbiology
* CNR Virus des Infections Respiratoires - France SUD
* CR&WISCO GENERAL HOSPITAL
* California Department of Health
* California Department of Public Health
* Center of Medical Microbiology, Virology, and Hospital Hygiene, University of Duesseldorf
* Centers for Disease Control, R.O.C. (Taiwan)
* Centre Hositalier Universitaire de Rouen Laboratoire de Virologie
* Centre Hospitalier Compiegne Laboratoire de Biologie
* Centre Hospitalier Regional Universitaire de Nantes Laboratoire de Virologie
* Centre Hospitalier Rene Dubois Laboratoire de Microbiologie - Bat A
* Centre for Human and Zoonotic Virology (CHAZVY), College of Medicine University of Lagos/Lagos University Teaching Hospital (LUTH), part of the Laboratory Network of the Nigeria Centre for Disease Control (NCDC)
* Centre for Infectious Diseases and Microbiology - Public Health
* Centre for Infectious Diseases and Microbiology Laboratory Services
* Centre for Infectious Diseases and Microbiology- Public Health
* Centro Hospital do Porto, E.P.E. - H. Geral de Santo Antonio
* Centro Hospitalar e Universitario de Sao Joao, Porto
* Charite Universitatsmedizin Berlin, Institute of Virology; Institut fur Mikrobiologie der Bundeswehr, Munich
* Clinica Alemana de Santiago, Chile
* Clinica Santa Maria, Santiago, Chile
* Department of Infectious Diseases, Istituto Superiore di Sanita, Roma , Italy
* Department of Infectious Diseases, Istituto Superiore di Sanita, Rome, Italy
* Department of Infectious and Tropical Diseases, Bichat Claude Bernard Hospital, Paris
* Department of Internal Medicine, Triemli Hospital
* Department of Laboratory Medicine, National Taiwan University Hospital
* Department of Microbiology, Institute for Viral Diseases, College of Medicine, Korea University
* Department of Pathology, Toshima Hospital
* Department of Virology III, National Institute of Infectious Diseases
* Department of Virology and Immunology, University of Helsinki and Helsinki University Hospital, Huslab Finland
* Department of Virus and Microbiological Special diagnostics, Statens Serum Institut, Copenhagen, Denmark.
* Department of microbiology laboratory,Anhui Provincial Center for Disease Control and Prevention
* Dept. of Pathology, National Institute of Infectious Diseases
* Dept. of Virology III, National Institute of Infectious Diseases
* Dienst Gezondheid & Jeugd Zuid-Holland Zuid
* Division of Infectious Diseases, Department of Internal Medicine, Korea University College of Medicine
* Division of Infectious Diseases, University Hospital Zurich
* Division of Viral Diseases, Center for Laboratory Control of Infectious Diseases, Korea Centers for Diseases Control and Prevention
* Dutch COVID-19 response team
* ErasmusMC
* Foundation Elisabeth-Tweesteden Ziekenhuis
* Foundation Pamm
* Fujian Center for Disease Control and Prevention
* General Hospital of Central Theater Command of People's Liberation Army of China
* Gorgas Memorial Institute for Health Studies
* Guangdong Provincial Center for Diseases Control and Prevention; Guangdong Provincial Public Health
* Guangdong Provincial Center for Diseases Control and Prevention; Guangdong Provinical Public Health
* Guangdong Provincial Center for Diseases Control and Prevention;Guangdong Provincial Institute of Public Health
* Guangdong Provincial Institution of Public Health, Guangdong Provinical Center for Disease Control and Prevention
* HUS Diagnostiikkakeskus, Hallinto
* Hangzhou Center for Disease Control and Prevention
* Hangzhou Center for Disease and Control Microbiology Lab
* Harborview Medical Center
* Hong Kong Department of Health
* Hopital Instruction des Armees - BEGIN
* Hopital Robert Debre Laboratoire de Virologie
* Hopitaux universitaires de Geneve Laboratoire de Virologie
* Hospital Israelita Albert Einstein
* Hospital Sao Joaquim Beneficencia Portuguesa
* Hospital de Talca, Chile
* IL Department of Public Health Chicago Laboratory
* INMI Lazzaro Spallanzani IRCCS
* Indian Council of Medical Research - National Institute of Virology
* Indian Council of Medical Research-National Institute of Virology
* Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College
* Institute of Viral Disease Control and Prevention, China CDC
* Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias
* Jingzhou Center for Disease Control and Prevention
* KU Leuven, Clincal and Epidemiological Virology
* KU Leuven, Clinical and Epidemiological Virology
* Klinik Hirslanden Zurich
* Korea Centers for Disease Control & Prevention (KCDC) Center for Laboratory Control of Infectious Diseases Division of Viral Diseases
* LACEN RJ - Laboratorio Central de Saude Publica Noel Nutels
* LACEN/ES - Laboratorio Central de Saude Publica do Espirito Santo
* Laboratoire National de Sante
* Laboratoire de Virologie Institut de Virologie - INSERM U 1109 Hopitaux Universitaires de Strasbourg
* Laboratoire de Virologie, HUG
* Laboratorio Central de Saude Publica Professor Goncalo Moniz  LACEN/BA
* Laboratorio di Microbiologia e Virologia, Universita Vita-Salute San Raffaele, Milano
* Laboratory Medicine
* Laboratory of Molecular Virology, Pontificia Universidad Catolica de Chile
* Lapland Central Hospital
* MHC Brabant Zuidoost
* MHC Drente
* MHC Flevoland
* MHC Gooi & Vechtstreek
* MHC Haaglanden
* MHC Hart voor Brabant
* MHC Kennemerland
* MHC Rotterdam-Rijnmond
* MHC Utrecht
* MHC West-Brabant
* MSHS Clinical Microbiology Laboratories
* Massachusetts Department of Public Health
* Minnesota Department of Health, Public Health Laboratory
* Monash Medical Centre
* NHC Key laboratory of Enteric Pathogenic Microbiology, Institute of Pathogenic Microbiology
* NYU Langone Health
* National Centre for Infectious Diseases
* National Influenza Center - National Institute of Hygiene and Epidemiology (NIHE)
* National Influenza Centre, National Public Health Laboratory, Kathmandu, Nepal
* National Institute for Viral Disease Control and Prevention, China CDC
* National Public Health Laboratory
* National Public Health Laboratory, National Centre for Infectious Diseases
* Pathology Queensland
* Providence Regional Medical Center
* Public Health Ontario Laboratory
* R. G. Lugar Center for Public Health Research,  National Center for Disease Control and Public Health (NCDC) of Georgia.
* RIVM
* Regional Virus Laboratory, Belfast
* Respiratory Virus Unit, Microbiology Services Colindale, Public Health England
* Seattle Flu Study
* Second Hospital of Anhui Medical University
* Serology, Virology and OTDS Laboratories (SAViD), NSW Health Pathology Randwick
* Servicio Microbiologia, Hospital Clinico Universitario, Valencia
* Servicio Microbiologia. Hospital Clinico Universitario. Valencia.
* Shandong Provincial Center for Disease Control and Prevention
* Shenzhen Key Laboratory of Pathogen and Immunity, National Clinical Research Center for Infectious Disease, Shenzhen Third People's Hospital
* Shenzhen Third People's Hospital
* Singapore General Hospital
* Singapore General Hospital, Molecular Laboratory, Division of Pathology
* Sorbonne Universite, Inserm et Assistance Publique-Hopitaux de Paris (Pitie Salpetriere)
* South China Agricultural University
* State Health Office Baden-Wuerttemberg
* State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, National Clinical Research Center for Infectious Diseases, First Affiliated Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, China. 310003
* State Key Laboratory of Respiratory Disease, National Clinical Research Center for Respiratory Disease, Guangzhou Institute of Respiratory Health, the First Affiliated Hospital of Guangzhou Medical University
* Tai Lung Veterinary Laboratory, Agriculture, Fisheries and Conservation Department
* Taiwan Centers for Disease Control
* Texas Department of State Health Services
* The Central Hospital Of Wuhan
* The National Institute of Public Health Center for Epidemiology and Microbiology
* The University of Hong Kong - Shenzhen Hospital
* Tianmen Center for Disease Control and Prevention
* UCD National Virus Reference Laboratory
* UW Virology Lab
* Union Hospital of Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology
* Unknown
* Utah Public Health Laboratory
* Valley Medical Center
* Viral Respiratory Lab, National Institute for Biomedical Research (INRB)
* Virology Department, Royal Infirmary of Edinburgh, NHS Lothian
* Virology Department, Sheffield Teaching Hospitals NHS Foundation Trust
* Virology Unit, Institut Pasteur du Cambodge.
* WA State Department of Health
* WHO National Influenza Centre Russian Federation
* Wales Specialist Virology Centre
* Washington State Department of Health
* Washington State Public Health Lab
* Weifang Center for Disease Control and Prevention
* West of Scotland Specialist Virology Centre, NHSGGC
* Wisconsin Department of Health Services
* Wuhan Fourth Hospital
* Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences
* Wuhan Jinyintan Hospital
* Wuhan Lung Hospital
* Yongchuan District Center for Disease Control and Prevention
* Zhejiang Provincial Center for Disease Control and Prevention
* Zhongxian Center for Disease Control and Prevention

Αυτά τα δεδομένα κοινοποιήθηκαν μέσω του GISAID. Ευχαριστούμε πολύ για τη συμβολή τους.


Στα δεξιά δίνουμε συγκεκριμένες ακολουθίες που μοιράζονται σε κάθε εργαστήριο.


Τα γονιδιώματα SARS-CoV-2 μοιράστηκαν γενναιόδωρα από επιστήμονες σε αυτά τα εργαστήρια υποβολής:

* Arizona Department of Health Services
	* USA/AZ1/2020

* Auckland Hospital
	* NewZealand/01/2020

* BCCDC Public Health Laboratory
	* Canada/BC_37_0-2/2020

* Bamrasnaradura Hospital
	* Nonthaburi/61/2020
	* Nonthaburi/74/2020

* Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology
	* pangolin/Guangdong/P2S/2019
	* pangolin/Guangxi/P1E/2017
	* pangolin/Guangxi/P2V/2017
	* pangolin/Guangxi/P3B/2017
	* pangolin/Guangxi/P4L/2017
	* pangolin/Guangxi/P5E/2017
	* pangolin/Guangxi/P5L/2017

* Bundeswehr Institute of Microbiology
	* Germany/BavPat2/2020
	* Germany/BavPat3/2020

* CNR Virus des Infections Respiratoires - France SUD
	* France/RA739/2020

* CR&WISCO GENERAL HOSPITAL
	* Wuhan/HBCDC-HB-05/2020

* California Department of Health
	* USA/CA3/2020
	* USA/CA4/2020
	* USA/CA5/2020

* California Department of Public Health
	* USA/CA-CDPH-UC1/2020
	* USA/CA-CDPH-UC2/2020
	* USA/CA-CDPH-UC3/2020
	* USA/CA-CDPH-UC4/2020
	* USA/CA-CDPH-UC5/2020
	* USA/CA-CDPH-UC6/2020
	* USA/CA-CDPH-UC7/2020
	* USA/CA-CDPH-UC8/2020
	* USA/CA-CDPH-UC9/2020
	* USA/CA1/2020
	* USA/CA2/2020
	* USA/CA6/2020
	* USA/CA7/2020
	* USA/CA8/2020
	* USA/CA9/2020
	* USA/UC-CDPH-UC11/2020

* Center of Medical Microbiology, Virology, and Hospital Hygiene
	* Germany/NRW-01/2020
	* Germany/NRW-02-1/2020
	* Germany/NRW-03/2020
	* Germany/NRW-04/2020

* Center of Medical Microbiology, Virology, and Hospital Hygiene, University of Duesseldorf
	* Germany/NRW-011/2020
	* Germany/NRW-05/2020
	* Germany/NRW-06/2020
	* Germany/NRW-07/2020
	* Germany/NRW-08/2020
	* Germany/NRW-09/2020
	* Germany/NRW-10/2020

* Centers for Disease Control, R.O.C. (Taiwan)
	* Taiwan/2/2020

* Centre for Human and Zoonotic Virology (CHAZVY), College of Medicine University of Lagos/Lagos University Teaching Hospital (LUTH), part of the Laboratory Network of the Nigeria Centre for Disease Control (NCDC)
	* Nigeria/Lagos01/2020

* Centre for Infectious Diseases and Microbiology - Public Health
	* Australia/NSW10/2020
	* Australia/NSW12/2020
	* Australia/NSW13/2020
	* Australia/NSW14/2020

* Centre for Infectious Diseases and Microbiology Laboratory Services
	* Australia/NSW01/2020
	* Australia/NSW05/2020
	* Australia/NSW06/2020
	* Australia/NSW07/2020
	* Australia/NSW08/2020
	* Australia/NSW09/2020
	* Sydney/2/2020

* Centre for Infectious Diseases and Microbiology- Public Health
	* Australia/NSW11/2020

* Centro Hospital do Porto, E.P.E. - H. Geral de Santo Antonio
	* Portugal/CV62/2020

* Centro Hospitalar e Universitario de Sao Joao, Porto
	* Portugal/CV63/2020

* Charite Universitatsmedizin Berlin, Institute of Virology; Institut fur Mikrobiologie der Bundeswehr, Munich
	* Germany/BavPat1/2020

* Department of Infectious Diseases, Istituto Superiore di Sanita, Roma , Italy
	* Italy/CDG1/2020

* Department of Infectious Diseases, Istituto Superiore di Sanita, Rome, Italy
	* Italy/SPL1/2020

* Department of Infectious and Tropical Diseases, Bichat Claude Bernard Hospital, Paris
	* France/IDF0372-isl/2020
	* France/IDF0372/2020
	* France/IDF0373/2020
	* France/IDF0386-islP1/2020
	* France/IDF0386-islP3/2020
	* France/IDF0515-isl/2020
	* France/IDF0515/2020
	* France/IDF0571/2020

* Department of Internal Medicine, Triemli Hospital
	* Switzerland/1000477102/2020
	* Switzerland/1000477377/2020

* Department of Laboratory Medicine, National Taiwan University Hospital
	* Taiwan/NTU01/2020
	* Taiwan/NTU02/2020
	* Taiwan/NTU03/2020

* Department of Microbiology, Institute for Viral Diseases, College of Medicine, Korea University
	* SouthKorea/KUMC01/2020
	* SouthKorea/KUMC02/2020
	* SouthKorea/KUMC04/2020
	* SouthKorea/KUMC06/2020

* Department of Pathology, Toshima Hospital
	* Japan/TK/20-31-3/2020

* Department of Virology III, National Institute of Infectious Diseases
	* Japan/AI/I-004/2020

* Department of Virology and Immunology, University of Helsinki and Helsinki University Hospital, Huslab Finland
	* Finland/FIN01032020/2020
	* Finland/FIN03032020A/2020
	* Finland/FIN03032020B/2020
	* Finland/FIN03032020C/2020

* Department of microbiology laboratory,Anhui Provincial Center for Disease Control and Prevention
	* Anhui/SZ005/2020

* Dept. of Pathology, National Institute of Infectious Diseases
	* Japan/NA-20-05-1/2020
	* Japan/OS-20-07-1/2020

* Dept. of Virology III, National Institute of Infectious Diseases
	* Japan/KY-V-029/2020
	* Japan/TY-WK-012/2020
	* Japan/TY-WK-501/2020
	* Japan/TY-WK-521/2020

* Dienst Gezondheid & Jeugd Zuid-Holland Zuid
	* Netherlands/Hardinxveld_Giessendam_1364806/2020

* Division of Infectious Diseases, Department of Internal Medicine, Korea University College of Medicine
	* SouthKorea/KUMC03/2020
	* SouthKorea/KUMC05/2020

* Division of Infectious Diseases, University Hospital Zurich
	* Switzerland/1000477796/2020
	* Switzerland/1000477797/2020
	* Switzerland/1000477806/2020

* Division of Viral Diseases, Center for Laboratory Control of Infectious Diseases, Korea Centers for Diseases Control and Prevention
	* SouthKorea/KCDC05/2020
	* SouthKorea/KCDC06/2020
	* SouthKorea/KCDC07/2020
	* SouthKorea/KCDC12/2020
	* SouthKorea/KCDC24/2020

* Dutch COVID-19 response team
	* Netherlands/Gelderland_1/2020
	* Netherlands/Limburg_2/2020
	* Netherlands/Limburg_3/2020
	* Netherlands/Limburg_4/2020
	* Netherlands/Limburg_5/2020
	* Netherlands/Limburg_6/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_1/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_10/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_11/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_12/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_13/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_14/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_15/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_16/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_17/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_18/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_19/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_2/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_20/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_21/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_22/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_23/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_24/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_25/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_26/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_27/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_28/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_29/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_3/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_30/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_31/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_32/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_33/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_34/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_35/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_36/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_37/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_38/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_39/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_4/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_5/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_6/2020
	* Netherlands/NoordHolland_1/2020
	* Netherlands/NoordHolland_2/2020
	* Netherlands/Overijssel_1/2020
	* Netherlands/Overijssel_2/2020
	* Netherlands/Utrecht_1/2020
	* Netherlands/Utrecht_10/2020
	* Netherlands/Utrecht_11/2020
	* Netherlands/Utrecht_12/2020
	* Netherlands/Utrecht_13/2020
	* Netherlands/Utrecht_14/2020
	* Netherlands/Utrecht_15/2020
	* Netherlands/Utrecht_16/2020
	* Netherlands/Utrecht_2/2020
	* Netherlands/Utrecht_3/2020
	* Netherlands/Utrecht_4/2020
	* Netherlands/Utrecht_5/2020
	* Netherlands/Utrecht_6/2020
	* Netherlands/Utrecht_7/2020
	* Netherlands/Utrecht_8/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_1/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_10/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_11/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_13/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_14/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_15/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_16/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_17/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_18/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_19/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_2/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_20/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_21/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_22/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_23/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_24/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_5/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_6/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_7/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_8/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_9/2020

* ErasmusMC
	* Netherlands/Nieuwendijk_1363582/2020
	* Netherlands/Rotterdam_1363790/2020

* Foundation Elisabeth-Tweesteden Ziekenhuis
	* Netherlands/Tilburg_1363354/2020
	* Netherlands/Tilburg_1364286/2020

* Foundation Pamm
	* Netherlands/Berlicum_1363564/2020

* Fujian Center for Disease Control and Prevention
	* Fujian/13/2020
	* Fujian/8/2020

* General Hospital of Central Theater Command of People's Liberation Army of China
	* Wuhan/WH01/2019
	* Wuhan/WH02/2019
	* Wuhan/WH03/2020
	* Wuhan/WH04/2020

* Guangdong Provincial Center for Diseases Control and Prevention; Guangdong Provincial Public Health
	* Foshan/20SF207/2020
	* Foshan/20SF210/2020
	* Foshan/20SF211/2020
	* Guangdong/20SF012/2020
	* Guangdong/20SF013/2020
	* Guangdong/20SF014/2020
	* Guangdong/20SF025/2020
	* Guangdong/20SF028/2020
	* Guangdong/20SF040/2020

* Guangdong Provincial Center for Diseases Control and Prevention; Guangdong Provinical Public Health
	* Guangdong/20SF174/2020
	* Guangzhou/20SF206/2020

* Guangdong Provincial Center for Diseases Control and Prevention;Guangdong Provincial Institute of Public Health
	* Guangdong/20SF201/2020

* Guangdong Provincial Institution of Public Health, Guangdong Provinical Center for Disease Control and Prevention
	* Guangdong/2020XN4239-P0034/2020
	* Guangdong/2020XN4243-P0035/2020
	* Guangdong/2020XN4273-P0036/2020
	* Guangdong/2020XN4276-P0037/2020
	* Guangdong/2020XN4291-P0038/2020
	* Guangdong/2020XN4373-P0039/2020
	* Guangdong/2020XN4433-P0040/2020
	* Guangdong/2020XN4448-P0002/2020
	* Guangdong/2020XN4459-P0041/2020
	* Guangdong/2020XN4475-P0042/2020
	* Guangdong/DG-S2-P0054/2020
	* Guangdong/DG-S41-P0056/2020
	* Guangdong/DG-S6-P0055/2020
	* Guangdong/DG-S9-P0045/2020
	* Guangdong/FS-S29-P0051/2020
	* Guangdong/FS-S30-P0052/2020
	* Guangdong/FS-S34-P0015/2020
	* Guangdong/FS-S42-P0046/2020
	* Guangdong/FS-S48-P0047/2020
	* Guangdong/FS-S50-P0053/2020
	* Guangdong/GD2020012-P0022/2020
	* Guangdong/GD2020016-P0011/2020
	* Guangdong/GD2020080-P0010/2020
	* Guangdong/GD2020085-P0043/2020
	* Guangdong/GD2020086-P0021/2020
	* Guangdong/GD2020087-P0008/2020
	* Guangdong/GD2020115-P0009/2020
	* Guangdong/GD2020134-P0031/2020
	* Guangdong/GD2020139-P0007/2020
	* Guangdong/GD2020227-P0029/2020
	* Guangdong/GD2020233-P0027/2020
	* Guangdong/GD2020234-P0023/2020
	* Guangdong/GD2020241-P0013/2020
	* Guangdong/GD2020246-P0028/2020
	* Guangdong/GD2020258-P0018/2020
	* Guangdong/GDFS2020052-P0025/2020
	* Guangdong/GDFS2020054-P0005/2020
	* Guangdong/GDFS2020056-P0044/2020
	* Guangdong/GDFS2020127-P0026/2020
	* Guangdong/GDSZ202004-P0004/2020
	* Guangdong/GDSZ202008-P0020/2020
	* Guangdong/GDSZ202009-P0032/2020
	* Guangdong/GDSZ202013-P0014/2020
	* Guangdong/GDSZ202015-P0019/2020
	* Guangdong/GZ-S6-P0050/2020
	* Guangdong/JM-S1-P0062/2020
	* Guangdong/MM-S1-P0048/2020
	* Guangdong/SZ-N128-P0057/2020
	* Guangdong/SZ-N59-P0049/2020
	* Guangdong/ZH-N22-P0059/2020
	* Guangdong/ZH-S33-P0058/2020
	* Guangdong/ZQ-S2-P0061/2020
	* Guangdong/ZS-S6-P0060/2020

* HUS Diagnostiikkakeskus, Hallinto
	* Finland/FIN-25/2020

* Hangzhou Center for Disease Control and Prevention
	* Hangzhou/HZCDC0001/2020

* Hangzhou Center for Disease and Control Microbiology Lab
	* Hangzhou/HZ-1/2020

* Harborview Medical Center
	* USA/WA3-UW1/2020
	* USA/WA9-UW6/2020

* Hong Kong Department of Health
	* HongKong/VB20024950/2020
	* HongKong/VB20026565/2020
	* HongKong/VM20001061/2020
	* HongKong/case42_VM20002493/2020
	* HongKong/case48_VM20002507/2020
	* HongKong/case52_VM20002582/2020
	* HongKong/case78_VM20002849/2020
	* HongKong/case85_VM20002868/2020
	* HongKong/case90_VM20002907/2020
	* canine/HongKong/20-02756/2020

* Hospital Israelita Albert Einstein
	* Brazil/SPBR-01/2020
	* Brazil/SPBR-02/2020
	* Brazil/SPBR-03/2020

* Hospital Sao Joaquim Beneficencia Portuguesa
	* Brazil/SPBR-04/2020
	* Brazil/SPBR-05/2020
	* Brazil/SPBR-06/2020

* IL Department of Public Health Chicago Laboratory
	* USA/IL1/2020
	* USA/IL2/2020

* INMI Lazzaro Spallanzani IRCCS
	* Italy/INMI1-cs/2020
	* Italy/INMI1-isl/2020

* Indian Council of Medical Research - National Institute of Virology
	* India/1-27/2020

* Indian Council of Medical Research-National Institute of Virology
	* India/1-31/2020

* Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College
	* Wuhan/IPBCAMS-WH-01/2019
	* Wuhan/IPBCAMS-WH-02/2019
	* Wuhan/IPBCAMS-WH-03/2019
	* Wuhan/IPBCAMS-WH-04/2019
	* Wuhan/IPBCAMS-WH-05/2020

* Institute of Viral Disease Control and Prevention, China CDC
	* Wuhan/IVDC-HB-envF13-20/2020
	* Wuhan/IVDC-HB-envF13-21/2020
	* Wuhan/IVDC-HB-envF13/2020
	* Wuhan/IVDC-HB-envF54/2020

* Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias
	* Mexico/CDMX/InDRE_01/2020

* Jingzhou Center for Disease Control and Prevention
	* Jingzhou/HBCDC-HB-01/2020

* KU Leuven, Clinical and Epidemiological Virology
	* Belgium/GHB-03021/2020

* Klinik Hirslanden Zurich
	* Switzerland/1000477757/2020

* Korea Centers for Disease Control & Prevention (KCDC) Center for Laboratory Control of Infectious Diseases Division of Viral Diseases
	* SouthKorea/KCDC03/2020

* Laboratoire National de Sante
	* Luxembourg/Lux1/2020

* Laboratoire de Virologie, HUG
	* Switzerland/AG0361/2020
	* Switzerland/BL0902/2020
	* Switzerland/GE3121/2020
	* Switzerland/GE3895/2020
	* Switzerland/GE5373/2020
	* Switzerland/GE9586/2020
	* Switzerland/TI9486/2020
	* Switzerland/VD5615/2020

* Laboratorio di Microbiologia e Virologia, Universita Vita-Salute San Raffaele, Milano
	* Italy/UniSR1/2020

* Laboratory Medicine
	* Taiwan/CGMH-CGU-01/2020

* Lapland Central Hospital
	* Finland/1/2020

* MHC Brabant Zuidoost
	* Netherlands/Eindhoven_1363782/2020

* MHC Drente
	* Netherlands/Dalen_1363624/2020

* MHC Flevoland
	* Netherlands/Zeewolde_1365080/2020

* MHC Gooi & Vechtstreek
	* Netherlands/Blaricum_1364780/2020
	* Netherlands/Naarden_1364774/2020

* MHC Haaglanden
	* Netherlands/Nootdorp_1364222/2020

* MHC Hart voor Brabant
	* Netherlands/Oisterwijk_1364072/2020

* MHC Kennemerland
	* Netherlands/Haarlem_1363688/2020

* MHC Rotterdam-Rijnmond
	* Netherlands/Rotterdam_1364040/2020

* MHC Utrecht
	* Netherlands/Utrecht_1363564/2020
	* Netherlands/Utrecht_1363628/2020
	* Netherlands/Utrecht_1364066/2020

* MHC West-Brabant
	* Netherlands/Andel_1365066/2020
	* Netherlands/Helmond_1363548/2020

* MSHS Clinical Microbiology Laboratories
	* USA/NY1-PV08001/2020

* Massachusetts Department of Public Health
	* USA/MA1/2020

* Monash Medical Centre
	* Australia/VIC01/2020

* NHC Key laboratory of Enteric Pathogenic Microbiology, Institute of Pathogenic Microbiology
	* Jiangsu/JS01/2020
	* Jiangsu/JS02/2020
	* Jiangsu/JS03/2020

* National Centre for Infectious Diseases
	* Singapore/12/2020
	* Singapore/13/2020
	* Singapore/14/2020
	* Singapore/3/2020
	* Singapore/4/2020

* National Influenza Center - National Institute of Hygiene and Epidemiology (NIHE)
	* Vietnam/VR03-38142/2020

* National Influenza Centre, National Public Health Laboratory, Kathmandu, Nepal
	* Nepal/61/2020

* National Institute for Viral Disease Control and Prevention, China CDC
	* Beijing/IVDC-BJ-005/2020
	* Chongqing/IVDC-CQ-001/2020
	* Henan/IVDC-HeN-002/2020
	* Jiangsu/IVDC-JS-001/2020
	* Jiangxi/IVDC-JX-002/2020
	* Shandong/IVDC-SD-001/2020
	* Shanghai/IVDC-SH-001/2020
	* Sichuan/IVDC-SC-001/2020
	* Wuhan/IVDC-HB-01/2019
	* Wuhan/IVDC-HB-04/2020
	* Wuhan/IVDC-HB-05/2019
	* Yunnan/IVDC-YN-003/2020

* National Public Health Laboratory
	* Singapore/11/2020

* National Public Health Laboratory, National Centre for Infectious Diseases
	* Singapore/10/2020
	* Singapore/7/2020
	* Singapore/8/2020
	* Singapore/9/2020

* Pathology Queensland
	* Australia/QLD01/2020
	* Australia/QLD02/2020
	* Australia/QLD03/2020
	* Australia/QLD04/2020
	* Australia/QLD09/2020

* Providence Regional Medical Center
	* USA/WA1/2020

* Public Health Ontario Laboratory
	* Canada/ON-PHL2445/2020
	* Canada/ON-VIDO-01/2020

* RIVM
	* Netherlands/Delft_1363424/2020
	* Netherlands/Diemen_1363454/2020
	* Netherlands/Loon_op_zand_1363512/2020
	* Netherlands/Oss_1363500/2020
	* NetherlandsL/Houten_1363498/2020

* Respiratory Virus Unit, Microbiology Services Colindale, Public Health England
	* England/01/2020
	* England/02/2020
	* England/09c/2020
	* England/200641094/2020
	* England/200690245/2020
	* England/200690300/2020
	* England/200690306/2020
	* England/200690756/2020
	* England/200940527/2020
	* England/200960041/2020
	* England/200960515/2020
	* England/200981386/2020
	* England/200990002/2020
	* England/200990006/2020
	* England/200990660/2020
	* England/200990723/2020
	* England/200990724/2020
	* England/200990725/2020
	* England/200991076/2020
	* England/201000003/2020
	* England/201040081/2020
	* England/201040141/2020

* Seattle Flu Study
	* USA/WA-S2/2020
	* USA/WA-S3/2020

* Second Hospital of Anhui Medical University
	* Hefei/2/2020

* Serology, Virology and OTDS Laboratories (SAViD), NSW Health Pathology Randwick
	* Sydney/3/2020

* Servicio Microbiologia. Hospital Clinico Universitario. Valencia.
	* Spain/Valencia1/2020
	* Spain/Valencia2/2020

* Shenzhen Key Laboratory of Pathogen and Immunity, National Clinical Research Center for Infectious Disease, Shenzhen Third People's Hospital
	* Shenzhen/SZTH-002/2020
	* Shenzhen/SZTH-003/2020
	* Shenzhen/SZTH-004/2020

* Shenzhen Third People's Hospital
	* Shenzhen/SZTH-001/2020

* Singapore General Hospital
	* Singapore/1/2020
	* Singapore/2/2020

* Singapore General Hospital, Molecular Laboratory, Division of Pathology
	* Singapore/5/2020
	* Singapore/6/2020

* Sorbonne Universite, Inserm et Assistance Publique-Hopitaux de Paris (Pitie Salpetriere)
	* France/IDF0626/2020

* South China Agricultural University
	* pangolin/Guandong/1/2019

* State Health Office Baden-Wuerttemberg
	* Germany/Baden-Wuerttemberg-1/2020

* Taiwan Centers for Disease Control
	* Taiwan/3/2020
	* Taiwan/4/2020

* Texas Department of State Health Services
	* USA/TX1/2020

* The Central Hospital Of Wuhan
	* Wuhan/HBCDC-HB-02/2020

* The National Institute of Public Health Center for Epidemiology and Microbiology
	* CzechRepublic/951/2020

* The University of Hong Kong - Shenzhen Hospital
	* Shenzhen/HKU-SZ-002/2020
	* Shenzhen/HKU-SZ-005/2020

* Tianmen Center for Disease Control and Prevention
	* Tianmen/HBCDC-HB-07/2020

* UCD National Virus Reference Laboratory
	* Ireland/COR-20134/2020

* UW Virology Lab
	* USA/WA-UW15/2020
	* USA/WA-UW16/2020
	* USA/WA-UW17/2020
	* USA/WA-UW18/2020
	* USA/WA-UW19/2020
	* USA/WA-UW20/2020
	* USA/WA-UW21/2020
	* USA/WA11-UW7/2020
	* USA/WA12-UW8/2020
	* USA/WA13-UW9/2020
	* USA/WA14-UW10/2020
	* USA/WA15-UW11/2020
	* USA/WA16-UW12/2020
	* USA/WA17-UW13/2020
	* USA/WA18-UW14/2020

* Union Hospital of Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology
	* Wuhan/HBCDC-HB-03/2020
	* Wuhan/HBCDC-HB-04/2020

* Unknown
	* Netherlands/Coevorden_1363618/2020

* Valley Medical Center
	* USA/WA8-UW5/2020

* Virology Department, Sheffield Teaching Hospitals NHS Foundation Trust
	* England/Sheff01/2020
	* England/Sheff02/2020

* Virology Unit, Institut Pasteur du Cambodge.
	* Cambodia/0012/2020

* WA State Department of Health
	* USA/WA1-A12/2020

* Wales Specialist Virology Centre
	* Wales/PHW03/2020
	* Wales/PHW05/2020
	* Wales/PHW1/2020
	* Wales/PHW2/2020

* Washington State Department of Health
	* USA/WA1-F6/2020
	* USA/WA2/2020

* Washington State Public Health Lab
	* USA/WA4-UW2/2020
	* USA/WA6-UW3/2020
	* USA/WA7-UW4/2020

* Weifang Center for Disease Control and Prevention
	* China/WF0001/2020
	* China/WF0002/2020
	* China/WF0003/2020
	* China/WF0004/2020
	* China/WF0006/2020
	* China/WF0009/2020
	* China/WF0012/2020
	* China/WF0014/2020
	* China/WF0015/2020
	* China/WF0016/2020
	* China/WF0017/2020
	* China/WF0018/2020
	* China/WF0019/2020
	* China/WF0020/2020
	* China/WF0021/2020
	* China/WF0023/2020
	* China/WF0024/2020
	* China/WF0026/2020
	* China/WF0028/2020
	* China/WF0029/2020

* West of Scotland Specialist Virology Centre, NHSGGC
	* Scotland/CVR01/2020
	* Scotland/CVR02/2020
	* Scotland/CVR03/2020
	* Scotland/CVR04/2020
	* Scotland/CVR05/2020

* Wisconsin Department of Health Services
	* USA/WI1/2020

* Wuhan Fourth Hospital
	* Wuhan/WH05/2020

* Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences
	* bat/Yunnan/RaTG13/2013

* Wuhan Jinyintan Hospital
	* Wuhan/HBCDC-HB-01/2019
	* Wuhan/HBCDC-HB-02/2019
	* Wuhan/HBCDC-HB-03/2019
	* Wuhan/HBCDC-HB-04/2019
	* Wuhan/WIV02/2019
	* Wuhan/WIV04/2019
	* Wuhan/WIV05/2019
	* Wuhan/WIV06/2019
	* Wuhan/WIV07/2019

* Wuhan Lung Hospital
	* Wuhan/HBCDC-HB-06/2020

* Yongchuan District Center for Disease Control and Prevention
	* Chongqing/YC01/2020

* Zhejiang Provincial Center for Disease Control and Prevention
	* Zhejiang/WZ-01/2020
	* Zhejiang/WZ-02/2020

* Zhongxian Center for Disease Control and Prevention
	* Chongqing/ZX01/2020

* Andersen Lab, The Scripps Research Institute
	* USA/CA-PC101P/2020

* Arizona Department of Health Services
	* USA/AZ1/2020

* Auckland Hospital
	* NewZealand/01/2020

* BCCDC Public Health Laboratory
	* Canada/BC_02421/2020
	* Canada/BC_13297/2020
	* Canada/BC_17397/2020
	* Canada/BC_25211/2020
	* Canada/BC_35720/2020
	* Canada/BC_37_0-2/2020
	* Canada/BC_40860/2020
	* Canada/BC_41851/2020
	* Canada/BC_64686/2020
	* Canada/BC_65034/2020
	* Canada/BC_66353/2020
	* Canada/BC_69243/2020
	* Canada/BC_78548/2020
	* Canada/BC_83109/2020
	* Canada/BC_83163/2020

* Bamrasnaradura Hospital
	* Nonthaburi/61/2020
	* Nonthaburi/74/2020

* Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology
	* pangolin/Guangdong/P2S/2019
	* pangolin/Guangxi/P1E/2017
	* pangolin/Guangxi/P2V/2017
	* pangolin/Guangxi/P3B/2017
	* pangolin/Guangxi/P4L/2017
	* pangolin/Guangxi/P5E/2017
	* pangolin/Guangxi/P5L/2017

* Bundeswehr Institute of Microbiology
	* Germany/BavPat2/2020
	* Germany/BavPat3/2020

* CNR Virus des Infections Respiratoires - France SUD
	* France/RA739/2020

* CR&WISCO GENERAL HOSPITAL
	* Wuhan/HBCDC-HB-05/2020

* California Department of Health
	* USA/CA3/2020
	* USA/CA4/2020
	* USA/CA5/2020

* California Department of Public Health
	* USA/CA-CDPH-UC1/2020
	* USA/CA-CDPH-UC2/2020
	* USA/CA-CDPH-UC3/2020
	* USA/CA-CDPH-UC4/2020
	* USA/CA-CDPH-UC5/2020
	* USA/CA-CDPH-UC6/2020
	* USA/CA-CDPH-UC7/2020
	* USA/CA-CDPH-UC8/2020
	* USA/CA-CDPH-UC9/2020
	* USA/CA1/2020
	* USA/CA2/2020
	* USA/CA6/2020
	* USA/CA7/2020
	* USA/CA8/2020
	* USA/CA9/2020
	* USA/UC-CDPH-UC11/2020

* Center of Medical Microbiology, Virology, and Hospital Hygiene, University of Duesseldorf
	* Germany/NRW-01/2020
	* Germany/NRW-011/2020
	* Germany/NRW-02-1/2020
	* Germany/NRW-03/2020
	* Germany/NRW-04/2020
	* Germany/NRW-05/2020
	* Germany/NRW-06/2020
	* Germany/NRW-07/2020
	* Germany/NRW-08/2020
	* Germany/NRW-09/2020
	* Germany/NRW-10/2020

* Centers for Disease Control, R.O.C. (Taiwan)
	* Taiwan/2/2020

* Centre Hositalier Universitaire de Rouen Laboratoire de Virologie
	* France/N1620/2020

* Centre Hospitalier Compiegne Laboratoire de Biologie
	* France/HF1795/2020
	* France/HF1805/2020
	* France/HF1870/2020
	* France/HF1871/2020
	* France/HF1986/2020
	* France/HF1988/2020
	* France/HF1989/2020
	* France/HF1993/2020
	* France/HF1995/2020
	* France/HF2151/2020
	* France/HF2174/2020

* Centre Hospitalier Regional Universitaire de Nantes Laboratoire de Virologie
	* France/PL1643/2020

* Centre Hospitalier Rene Dubois Laboratoire de Microbiologie - Bat A
	* France/IDF1980/2020

* Centre for Human and Zoonotic Virology (CHAZVY), College of Medicine University of Lagos/Lagos University Teaching Hospital (LUTH), part of the Laboratory Network of the Nigeria Centre for Disease Control (NCDC)
	* Nigeria/Lagos01/2020

* Centre for Infectious Diseases and Microbiology - Public Health
	* Australia/NSW10/2020
	* Australia/NSW12/2020
	* Australia/NSW13/2020
	* Australia/NSW14/2020

* Centre for Infectious Diseases and Microbiology Laboratory Services
	* Australia/NSW01/2020
	* Australia/NSW02/2020
	* Australia/NSW05/2020
	* Australia/NSW06/2020
	* Australia/NSW07/2020
	* Australia/NSW08/2020
	* Australia/NSW09/2020

* Centre for Infectious Diseases and Microbiology- Public Health
	* Australia/NSW11/2020

* Centro Hospital do Porto, E.P.E. - H. Geral de Santo Antonio
	* Portugal/CV62/2020

* Centro Hospitalar e Universitario de Sao Joao, Porto
	* Portugal/CV63/2020

* Charite Universitatsmedizin Berlin, Institute of Virology; Institut fur Mikrobiologie der Bundeswehr, Munich
	* Germany/BavPat1/2020

* Clinica Alemana de Santiago, Chile
	* Chile/Santiago-1/2020

* Clinica Santa Maria, Santiago, Chile
	* Chile/Santiago-2/2020

* Department of Infectious Diseases, Istituto Superiore di Sanita, Roma , Italy
	* Italy/CDG1/2020

* Department of Infectious Diseases, Istituto Superiore di Sanita, Rome, Italy
	* Italy/SPL1/2020

* Department of Infectious and Tropical Diseases, Bichat Claude Bernard Hospital, Paris
	* France/IDF0372-isl/2020
	* France/IDF0372/2020
	* France/IDF0373/2020
	* France/IDF0386-islP1/2020
	* France/IDF0386-islP3/2020
	* France/IDF0515-isl/2020
	* France/IDF0515/2020
	* France/IDF0571/2020

* Department of Internal Medicine, Triemli Hospital
	* Switzerland/1000477102/2020
	* Switzerland/1000477377/2020

* Department of Laboratory Medicine, National Taiwan University Hospital
	* Taiwan/NTU01/2020
	* Taiwan/NTU02/2020
	* Taiwan/NTU03/2020

* Department of Microbiology, Institute for Viral Diseases, College of Medicine, Korea University
	* SouthKorea/KUMC01/2020
	* SouthKorea/KUMC02/2020
	* SouthKorea/KUMC04/2020
	* SouthKorea/KUMC06/2020

* Department of Pathology, Toshima Hospital
	* Japan/TK/20-31-3/2020

* Department of Virology III, National Institute of Infectious Diseases
	* Japan/AI/I-004/2020

* Department of Virology and Immunology, University of Helsinki and Helsinki University Hospital, Huslab Finland
	* Finland/FIN-114/2020
	* Finland/FIN-266/2020
	* Finland/FIN-274/2020
	* Finland/FIN-313/2020
	* Finland/FIN-318/2020
	* Finland/FIN-455/2020
	* Finland/FIN-508/2020
	* Finland/FIN01032020/2020
	* Finland/FIN03032020A/2020
	* Finland/FIN03032020B/2020
	* Finland/FIN03032020C/2020

* Department of Virus and Microbiological Special diagnostics, Statens Serum Institut, Copenhagen, Denmark.
	* Denmark/SSI-101/2020
	* Denmark/SSI-104/2020

* Department of microbiology laboratory,Anhui Provincial Center for Disease Control and Prevention
	* Anhui/SZ005/2020

* Dept. of Pathology, National Institute of Infectious Diseases
	* Japan/NA-20-05-1/2020
	* Japan/OS-20-07-1/2020

* Dept. of Virology III, National Institute of Infectious Diseases
	* Japan/KY-V-029/2020
	* Japan/TY-WK-012/2020
	* Japan/TY-WK-501/2020
	* Japan/TY-WK-521/2020

* Dienst Gezondheid & Jeugd Zuid-Holland Zuid
	* Netherlands/Hardinxveld_Giessendam_1364806/2020

* Division of Infectious Diseases, Department of Internal Medicine, Korea University College of Medicine
	* SouthKorea/KUMC03/2020
	* SouthKorea/KUMC05/2020

* Division of Infectious Diseases, University Hospital Zurich
	* Switzerland/1000477796/2020
	* Switzerland/1000477797/2020
	* Switzerland/1000477806/2020

* Division of Viral Diseases, Center for Laboratory Control of Infectious Diseases, Korea Centers for Diseases Control and Prevention
	* SouthKorea/KCDC05/2020
	* SouthKorea/KCDC06/2020
	* SouthKorea/KCDC07/2020
	* SouthKorea/KCDC12/2020
	* SouthKorea/KCDC24/2020

* Dutch COVID-19 response team
	* Netherlands/Flevoland/1/2020
	* Netherlands/Gelderland/1/2020
	* Netherlands/Gelderland/2/2020
	* Netherlands/Gelderland/3/2020
	* Netherlands/Gelderland_1/2020
	* Netherlands/Limburg/7/2020
	* Netherlands/Limburg_2/2020
	* Netherlands/Limburg_3/2020
	* Netherlands/Limburg_4/2020
	* Netherlands/Limburg_5/2020
	* Netherlands/Limburg_6/2020
	* Netherlands/NA/1/2020
	* Netherlands/NA/10/2020
	* Netherlands/NA/11/2020
	* Netherlands/NA/12/2020
	* Netherlands/NA/13/2020
	* Netherlands/NA/14/2020
	* Netherlands/NA/15/2020
	* Netherlands/NA/16/2020
	* Netherlands/NA/17/2020
	* Netherlands/NA/18/2020
	* Netherlands/NA/19/2020
	* Netherlands/NA/2/2020
	* Netherlands/NA/20/2020
	* Netherlands/NA/21/2020
	* Netherlands/NA/22/2020
	* Netherlands/NA/23/2020
	* Netherlands/NA/24/2020
	* Netherlands/NA/25/2020
	* Netherlands/NA/26/2020
	* Netherlands/NA/27/2020
	* Netherlands/NA/28/2020
	* Netherlands/NA/29/2020
	* Netherlands/NA/30/2020
	* Netherlands/NA/31/2020
	* Netherlands/NA/32/2020
	* Netherlands/NA/33/2020
	* Netherlands/NA/34/2020
	* Netherlands/NA/35/2020
	* Netherlands/NA/4/2020
	* Netherlands/NA/5/2020
	* Netherlands/NA/6/2020
	* Netherlands/NA/7/2020
	* Netherlands/NA/8/2020
	* Netherlands/NA/9/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/41/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/42/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/44/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/45/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/46/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/47/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/48/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/49/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/51/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/52/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/53/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/54/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/55/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/56/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/57/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/58/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/59/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/60/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/61/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/62/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/63/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/64/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/65/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/66/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/67/2020
	* Netherlands/NoordBrabant/68/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_1/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_10/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_11/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_12/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_13/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_14/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_15/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_16/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_17/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_18/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_19/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_2/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_20/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_21/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_22/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_23/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_24/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_25/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_26/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_27/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_28/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_29/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_3/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_30/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_31/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_32/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_33/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_34/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_35/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_36/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_37/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_38/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_39/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_4/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_5/2020
	* Netherlands/NoordBrabant_6/2020
	* Netherlands/NoordHolland/3/2020
	* Netherlands/NoordHolland_1/2020
	* Netherlands/NoordHolland_2/2020
	* Netherlands/Overijssel_1/2020
	* Netherlands/Overijssel_2/2020
	* Netherlands/Utrecht/17/2020
	* Netherlands/Utrecht/18/2020
	* Netherlands/Utrecht/19/2020
	* Netherlands/Utrecht_1/2020
	* Netherlands/Utrecht_10/2020
	* Netherlands/Utrecht_11/2020
	* Netherlands/Utrecht_12/2020
	* Netherlands/Utrecht_13/2020
	* Netherlands/Utrecht_14/2020
	* Netherlands/Utrecht_15/2020
	* Netherlands/Utrecht_16/2020
	* Netherlands/Utrecht_2/2020
	* Netherlands/Utrecht_3/2020
	* Netherlands/Utrecht_4/2020
	* Netherlands/Utrecht_5/2020
	* Netherlands/Utrecht_6/2020
	* Netherlands/Utrecht_7/2020
	* Netherlands/Utrecht_8/2020
	* Netherlands/ZuidHolland/25/2020
	* Netherlands/ZuidHolland/26/2020
	* Netherlands/ZuidHolland/27/2020
	* Netherlands/ZuidHolland/28/2020
	* Netherlands/ZuidHolland/29/2020
	* Netherlands/ZuidHolland/30/2020
	* Netherlands/ZuidHolland/31/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_1/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_10/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_11/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_13/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_14/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_15/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_16/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_17/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_18/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_19/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_2/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_20/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_21/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_22/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_23/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_24/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_5/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_6/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_7/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_8/2020
	* Netherlands/ZuidHolland_9/2020

* ErasmusMC
	* Netherlands/Nieuwendijk_1363582/2020
	* Netherlands/Rotterdam_1363790/2020

* Foundation Elisabeth-Tweesteden Ziekenhuis
	* Netherlands/Tilburg_1363354/2020
	* Netherlands/Tilburg_1364286/2020

* Foundation Pamm
	* Netherlands/Berlicum_1363564/2020

* Fujian Center for Disease Control and Prevention
	* Fujian/13/2020
	* Fujian/8/2020

* General Hospital of Central Theater Command of People's Liberation Army of China
	* Wuhan/WH01/2019
	* Wuhan/WH02/2019
	* Wuhan/WH03/2020
	* Wuhan/WH04/2020

* Gorgas Memorial Institute for Health Studies
	* Panama/328677/2020

* Guangdong Provincial Center for Diseases Control and Prevention; Guangdong Provincial Public Health
	* Foshan/20SF207/2020
	* Foshan/20SF210/2020
	* Foshan/20SF211/2020
	* Guangdong/20SF012/2020
	* Guangdong/20SF013/2020
	* Guangdong/20SF014/2020
	* Guangdong/20SF025/2020
	* Guangdong/20SF028/2020
	* Guangdong/20SF040/2020

* Guangdong Provincial Center for Diseases Control and Prevention; Guangdong Provinical Public Health
	* Guangdong/20SF174/2020
	* Guangzhou/20SF206/2020

* Guangdong Provincial Center for Diseases Control and Prevention;Guangdong Provincial Institute of Public Health
	* Guangdong/20SF201/2020

* Guangdong Provincial Institution of Public Health, Guangdong Provinical Center for Disease Control and Prevention
	* Guangdong/2020XN4239-P0034/2020
	* Guangdong/2020XN4243-P0035/2020
	* Guangdong/2020XN4273-P0036/2020
	* Guangdong/2020XN4276-P0037/2020
	* Guangdong/2020XN4291-P0038/2020
	* Guangdong/2020XN4373-P0039/2020
	* Guangdong/2020XN4433-P0040/2020
	* Guangdong/2020XN4448-P0002/2020
	* Guangdong/2020XN4459-P0041/2020
	* Guangdong/2020XN4475-P0042/2020
	* Guangdong/DG-S2-P0054/2020
	* Guangdong/DG-S41-P0056/2020
	* Guangdong/DG-S6-P0055/2020
	* Guangdong/DG-S9-P0045/2020
	* Guangdong/FS-S29-P0051/2020
	* Guangdong/FS-S30-P0052/2020
	* Guangdong/FS-S34-P0015/2020
	* Guangdong/FS-S42-P0046/2020
	* Guangdong/FS-S48-P0047/2020
	* Guangdong/FS-S50-P0053/2020
	* Guangdong/GD2020012-P0022/2020
	* Guangdong/GD2020016-P0011/2020
	* Guangdong/GD2020080-P0010/2020
	* Guangdong/GD2020085-P0043/2020
	* Guangdong/GD2020086-P0021/2020
	* Guangdong/GD2020087-P0008/2020
	* Guangdong/GD2020115-P0009/2020
	* Guangdong/GD2020134-P0031/2020
	* Guangdong/GD2020139-P0007/2020
	* Guangdong/GD2020227-P0029/2020
	* Guangdong/GD2020233-P0027/2020
	* Guangdong/GD2020234-P0023/2020
	* Guangdong/GD2020241-P0013/2020
	* Guangdong/GD2020246-P0028/2020
	* Guangdong/GD2020258-P0018/2020
	* Guangdong/GDFS2020052-P0025/2020
	* Guangdong/GDFS2020054-P0005/2020
	* Guangdong/GDFS2020056-P0044/2020
	* Guangdong/GDFS2020127-P0026/2020
	* Guangdong/GDSZ202004-P0004/2020
	* Guangdong/GDSZ202008-P0020/2020
	* Guangdong/GDSZ202009-P0032/2020
	* Guangdong/GDSZ202013-P0014/2020
	* Guangdong/GDSZ202015-P0019/2020
	* Guangdong/GZ-S6-P0050/2020
	* Guangdong/JM-S1-P0062/2020
	* Guangdong/MM-S1-P0048/2020
	* Guangdong/SZ-N128-P0057/2020
	* Guangdong/SZ-N59-P0049/2020
	* Guangdong/ZH-N22-P0059/2020
	* Guangdong/ZH-S33-P0058/2020
	* Guangdong/ZQ-S2-P0061/2020
	* Guangdong/ZS-S6-P0060/2020

* HUS Diagnostiikkakeskus, Hallinto
	* Finland/FIN-25/2020

* Hangzhou Center for Disease Control and Prevention
	* Hangzhou/HZCDC0001/2020

* Hangzhou Center for Disease and Control Microbiology Lab
	* Hangzhou/HZ-1/2020

* Harborview Medical Center
	* USA/WA3-UW1/2020
	* USA/WA9-UW6/2020

* Hong Kong Department of Health
	* HongKong/VB20024950/2020
	* HongKong/VB20026565/2020
	* HongKong/VM20001061/2020
	* HongKong/case42_VM20002493/2020
	* HongKong/case48_VM20002507/2020
	* HongKong/case49_VM20002508/2020
	* HongKong/case52_VM20002582/2020
	* HongKong/case78_VM20002849/2020
	* HongKong/case85_VM20002868/2020
	* HongKong/case90_VM20002907/2020

* Hopital Instruction des Armees - BEGIN
	* France/IDF2075/2020

* Hopital Robert Debre Laboratoire de Virologie
	* France/GE1973/2020
	* France/GE1977/2020

* Hopitaux universitaires de Geneve Laboratoire de Virologie
	* Switzerland/AG7120/2020
	* Switzerland/BE2536/2020
	* Switzerland/BE6651/2020
	* Switzerland/BS0914/2020
	* Switzerland/GE0199/2020
	* Switzerland/GE062072020
	* Switzerland/GE1402/2020
	* Switzerland/GE1422/2020
	* Switzerland/GE4135/2020
	* Switzerland/GE4984/2020
	* Switzerland/GE6679/2020
	* Switzerland/GE8102/2020
	* Switzerland/GR2988/2020
	* Switzerland/GR3043/2020
	* Switzerland/SZ1417/2020
	* Switzerland/TI2045/2020
	* Switzerland/VD0503/2020

* Hospital Israelita Albert Einstein
	* Brazil/SPBR-01/2020
	* Brazil/SPBR-02/2020
	* Brazil/SPBR-03/2020

* Hospital Sao Joaquim Beneficencia Portuguesa
	* Brazil/SPBR-04/2020
	* Brazil/SPBR-05/2020
	* Brazil/SPBR-06/2020

* Hospital de Talca, Chile
	* Chile/Talca-1/2020
	* Chile/Talca-2/2020

* IL Department of Public Health Chicago Laboratory
	* USA/IL1/2020
	* USA/IL2/2020

* INMI Lazzaro Spallanzani IRCCS
	* Italy/INMI1-cs/2020
	* Italy/INMI1-isl/2020

* Indian Council of Medical Research - National Institute of Virology
	* India/1-27/2020

* Indian Council of Medical Research-National Institute of Virology
	* India/1-31/2020

* Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College
	* Wuhan/IPBCAMS-WH-01/2019
	* Wuhan/IPBCAMS-WH-02/2019
	* Wuhan/IPBCAMS-WH-03/2019
	* Wuhan/IPBCAMS-WH-04/2019
	* Wuhan/IPBCAMS-WH-05/2020

* Institute of Viral Disease Control and Prevention, China CDC
	* Wuhan/IVDC-HB-envF13-20/2020
	* Wuhan/IVDC-HB-envF13-21/2020
	* Wuhan/IVDC-HB-envF13/2020
	* Wuhan/IVDC-HB-envF54/2020

* Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias
	* Mexico/CDMX-InDRE_01/2020

* Jingzhou Center for Disease Control and Prevention
	* Jingzhou/HBCDC-HB-01/2020

* KU Leuven, Clincal and Epidemiological Virology
	* Belgium/BM-03012/2020

* KU Leuven, Clinical and Epidemiological Virology
	* Belgium/BA-02291/2020
	* Belgium/BC-03016/2020
	* Belgium/GHB-03021/2020
	* Belgium/QKJ-03015/2020
	* Belgium/SH-03014/2020
	* Belgium/VAG-03013/2020
	* Belgium/VLM-03011/2020

* Klinik Hirslanden Zurich
	* Switzerland/1000477757/2020

* Korea Centers for Disease Control & Prevention (KCDC) Center for Laboratory Control of Infectious Diseases Division of Viral Diseases
	* SouthKorea/KCDC03/2020

* LACEN RJ - Laboratorio Central de Saude Publica Noel Nutels
	* Brazil-RJ/314/2020

* LACEN/ES - Laboratorio Central de Saude Publica do Espirito Santo
	* Brazil/ES-225/2020

* Laboratoire National de Sante
	* Luxembourg/Lux1/2020

* Laboratoire de Virologie Institut de Virologie - INSERM U 1109 Hopitaux Universitaires de Strasbourg
	* France/GE1583/2020

* Laboratoire de Virologie, HUG
	* Switzerland/AG0361/2020
	* Switzerland/BL0902/2020
	* Switzerland/GE3121/2020
	* Switzerland/GE3895/2020
	* Switzerland/GE5373/2020
	* Switzerland/GE9586/2020
	* Switzerland/TI9486/2020
	* Switzerland/VD5615/2020

* Laboratorio Central de Saude Publica Professor Goncalo Moniz  LACEN/BA
	* Brazil/BA-312/2020

* Laboratorio di Microbiologia e Virologia, Universita Vita-Salute San Raffaele, Milano
	* Italy/UniSR1/2020

* Laboratory Medicine
	* Taiwan/CGMH-CGU-01/2020
	* Taiwan/CGMH-CGU-03/2020

* Laboratory of Molecular Virology, Pontificia Universidad Catolica de Chile
	* Chile/Santiago_op2d1/2020
	* Chile/Santiago_op3d1/2020
	* Chile/Santiago_op4d1/2020

* Lapland Central Hospital
	* Finland/1/2020

* MHC Brabant Zuidoost
	* Netherlands/Eindhoven_1363782/2020

* MHC Drente
	* Netherlands/Dalen_1363624/2020

* MHC Flevoland
	* Netherlands/Zeewolde_1365080/2020

* MHC Gooi & Vechtstreek
	* Netherlands/Blaricum_1364780/2020
	* Netherlands/Naarden_1364774/2020

* MHC Haaglanden
	* Netherlands/Nootdorp_1364222/2020

* MHC Hart voor Brabant
	* Netherlands/Oisterwijk_1364072/2020

* MHC Kennemerland
	* Netherlands/Haarlem_1363688/2020

* MHC Rotterdam-Rijnmond
	* Netherlands/Rotterdam_1364040/2020

* MHC Utrecht
	* Netherlands/Utrecht_1363564/2020
	* Netherlands/Utrecht_1363628/2020
	* Netherlands/Utrecht_1364066/2020

* MHC West-Brabant
	* Netherlands/Andel_1365066/2020
	* Netherlands/Helmond_1363548/2020

* MSHS Clinical Microbiology Laboratories
	* USA/NY1-PV08001/2020
	* USA/NY2-PV08100/2020

* Massachusetts Department of Public Health
	* USA/MA1/2020

* Minnesota Department of Health, Public Health Laboratory
	* USA/MN1-MDH1/2020
	* USA/MN2-MDH2/2020
	* USA/MN3-MDH3/2020

* Monash Medical Centre
	* Australia/VIC01/2020

* NHC Key laboratory of Enteric Pathogenic Microbiology, Institute of Pathogenic Microbiology
	* Jiangsu/JS01/2020
	* Jiangsu/JS02/2020
	* Jiangsu/JS03/2020

* NYU Langone Health
	* USA/NY-NYUMC1/2020

* National Centre for Infectious Diseases
	* Singapore/12/2020
	* Singapore/13/2020
	* Singapore/14/2020
	* Singapore/3/2020
	* Singapore/4/2020

* National Influenza Center - National Institute of Hygiene and Epidemiology (NIHE)
	* Vietnam/VR03-38142/2020

* National Influenza Centre, National Public Health Laboratory, Kathmandu, Nepal
	* Nepal/61/2020

* National Institute for Viral Disease Control and Prevention, China CDC
	* Beijing/IVDC-BJ-005/2020
	* Chongqing/IVDC-CQ-001/2020
	* Henan/IVDC-HeN-002/2020
	* Jiangsu/IVDC-JS-001/2020
	* Jiangxi/IVDC-JX-002/2020
	* Shandong/IVDC-SD-001/2020
	* Shanghai/IVDC-SH-001/2020
	* Sichuan/IVDC-SC-001/2020
	* Wuhan/IVDC-HB-01/2019
	* Wuhan/IVDC-HB-04/2020
	* Wuhan/IVDC-HB-05/2019
	* Yunnan/IVDC-YN-003/2020

* National Public Health Laboratory
	* Singapore/11/2020

* National Public Health Laboratory, National Centre for Infectious Diseases
	* Singapore/10/2020
	* Singapore/7/2020
	* Singapore/8/2020
	* Singapore/9/2020

* Pathology Queensland
	* Australia/QLD01/2020
	* Australia/QLD02/2020
	* Australia/QLD03/2020
	* Australia/QLD04/2020
	* Australia/QLD09/2020

* Providence Regional Medical Center
	* USA/WA1/2020

* Public Health Ontario Laboratory
	* Canada/ON-PHL2445/2020
	* Canada/ON-VIDO-01/2020

* R. G. Lugar Center for Public Health Research,  National Center for Disease Control and Public Health (NCDC) of Georgia.
	* Georgia/Tb-468/2020
	* Georgia/Tb-477/2020
	* Georgia/Tb-54/2020
	* Georgia/Tb-82/2020

* RIVM
	* Netherlands/Delft_1363424/2020
	* Netherlands/Diemen_1363454/2020
	* Netherlands/Loon_op_zand_1363512/2020
	* Netherlands/Oss_1363500/2020
	* NetherlandsL/Houten_1363498/2020

* Regional Virus Laboratory, Belfast
	* NorthernIreland/HSCNI01/2020

* Respiratory Virus Unit, Microbiology Services Colindale, Public Health England
	* England/01/2020
	* England/02/2020
	* England/09c/2020
	* England/200641094/2020
	* England/200690245/2020
	* England/200690300/2020
	* England/200690306/2020
	* England/200690756/2020
	* England/200940527/2020
	* England/200960041/2020
	* England/200960515/2020
	* England/200981386/2020
	* England/200990002/2020
	* England/200990006/2020
	* England/20099038206/2020
	* England/200990660/2020
	* England/200990723/2020
	* England/200990724/2020
	* England/200990725/2020
	* England/20099079106/2020
	* England/20099107406/2020
	* England/200991076/2020
	* England/201000003/2020
	* England/20100001406/2020
	* England/20100004706/2020
	* England/20100004806/2020
	* England/20100005406/2020
	* England/20100022706/2020
	* England/20100023206/2020
	* England/20100024006/2020
	* England/20100077906/2020
	* England/20100121006/2020
	* England/20100121007/2020
	* England/20100122106/2020
	* England/20100122107/2020
	* England/20102000106/2020
	* England/20102000206/2020
	* England/20102000306/2020
	* England/20102000506/2020
	* England/20102000906/2020
	* England/20102068506/2020
	* England/201040081/2020
	* England/201040141/2020
	* England/20110003506/2020

* Seattle Flu Study
	* USA/WA-S2/2020
	* USA/WA-S3/2020

* Second Hospital of Anhui Medical University
	* Hefei/2/2020

* Serology, Virology and OTDS Laboratories (SAViD), NSW Health Pathology Randwick
	* Australia/NSW03/2020

* Servicio Microbiologia, Hospital Clinico Universitario, Valencia
	* Spain/Valencia3/2020

* Servicio Microbiologia. Hospital Clinico Universitario. Valencia.
	* Spain/Valencia1/2020
	* Spain/Valencia2/2020

* Shandong Provincial Center for Disease Control and Prevention
	* Shandong/LY001/2020
	* Shandong/LY002/2020
	* Shandong/LY003/2020
	* Shandong/LY004/2020
	* Shandong/LY005/2020
	* Shandong/LY006/2020
	* Shandong/LY007/2020
	* Shandong/LY008/2020

* Shenzhen Key Laboratory of Pathogen and Immunity, National Clinical Research Center for Infectious Disease, Shenzhen Third People's Hospital
	* Shenzhen/SZTH-002/2020
	* Shenzhen/SZTH-003/2020
	* Shenzhen/SZTH-004/2020

* Shenzhen Third People's Hospital
	* Shenzhen/SZTH-001/2020

* Singapore General Hospital
	* Singapore/1/2020
	* Singapore/2/2020

* Singapore General Hospital, Molecular Laboratory, Division of Pathology
	* Singapore/5/2020
	* Singapore/6/2020

* Sorbonne Universite, Inserm et Assistance Publique-Hopitaux de Paris (Pitie Salpetriere)
	* France/IDF0626/2020

* South China Agricultural University
	* pangolin/Guangdong/1/2019

* State Health Office Baden-Wuerttemberg
	* Germany/Baden-Wuerttemberg-1/2020

* State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, National Clinical Research Center for Infectious Diseases, First Affiliated Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, China. 310003
	* Hangzhou/ZJU-01/2020
	* Hangzhou/ZJU-05/2020

* State Key Laboratory of Respiratory Disease, National Clinical Research Center for Respiratory Disease, Guangzhou Institute of Respiratory Health, the First Affiliated Hospital of Guangzhou Medical University
	* Guangzhou/GZMU0014/2020
	* Guangzhou/GZMU0016/2020
	* Guangzhou/GZMU0030/2020
	* Guangzhou/GZMU0031/2020
	* Guangzhou/GZMU0042/2020
	* Guangzhou/GZMU0044/2020
	* Guangzhou/GZMU0047/2020
	* Guangzhou/GZMU0048/2020

* Tai Lung Veterinary Laboratory, Agriculture, Fisheries and Conservation Department
	* canine/HongKong/20-02756/2020

* Taiwan Centers for Disease Control
	* Taiwan/3/2020
	* Taiwan/4/2020

* Texas Department of State Health Services
	* USA/TX1/2020

* The Central Hospital Of Wuhan
	* Wuhan/HBCDC-HB-02/2020

* The National Institute of Public Health Center for Epidemiology and Microbiology
	* CzechRepublic/951/2020

* The University of Hong Kong - Shenzhen Hospital
	* Shenzhen/HKU-SZ-002/2020
	* Shenzhen/HKU-SZ-005/2020

* Tianmen Center for Disease Control and Prevention
	* Tianmen/HBCDC-HB-07/2020

* UCD National Virus Reference Laboratory
	* Ireland/COR-20134/2020
	* Ireland/Dublin-19072/2020
	* Ireland/Limerick-19933/2020
	* Ireland/Limerick-19934/2020
	* Ireland/Limerick-19935/2020

* UW Virology Lab
	* USA/WA-UW15/2020
	* USA/WA-UW16/2020
	* USA/WA-UW17/2020
	* USA/WA-UW18/2020
	* USA/WA-UW19/2020
	* USA/WA-UW20/2020
	* USA/WA-UW21/2020
	* USA/WA-UW22/2020
	* USA/WA-UW23/2020
	* USA/WA-UW24/2020
	* USA/WA-UW25/2020
	* USA/WA-UW26/2020
	* USA/WA-UW27/2020
	* USA/WA-UW28/2020
	* USA/WA-UW29/2020
	* USA/WA-UW30/2020
	* USA/WA-UW31/2020
	* USA/WA-UW32/2020
	* USA/WA-UW33/2020
	* USA/WA-UW34/2020
	* USA/WA-UW35/2020
	* USA/WA-UW40/2020
	* USA/WA-UW41/2020
	* USA/WA-UW42/2020
	* USA/WA-UW43/2020
	* USA/WA-UW44/2020
	* USA/WA-UW45/2020
	* USA/WA-UW46/2020
	* USA/WA-UW47/2020
	* USA/WA-UW48/2020
	* USA/WA-UW49/2020
	* USA/WA-UW50/2020
	* USA/WA-UW51/2020
	* USA/WA-UW52/2020
	* USA/WA-UW53/2020
	* USA/WA-UW54/2020
	* USA/WA-UW55/2020
	* USA/WA-UW56/2020
	* USA/WA-UW57/2020
	* USA/WA-UW58/2020
	* USA/WA-UW59/2020
	* USA/WA-UW60/2020
	* USA/WA-UW61/2020
	* USA/WA-UW62/2020
	* USA/WA-UW63/2020
	* USA/WA-UW64/2020
	* USA/WA-UW65/2020
	* USA/WA-UW66/2020
	* USA/WA-UW67/2020
	* USA/WA-UW68/2020
	* USA/WA-UW69/2020
	* USA/WA-UW70/2020
	* USA/WA-UW71/2020
	* USA/WA-UW72/2020
	* USA/WA-UW73/2020
	* USA/WA-UW74/2020
	* USA/WA-UW75/2020
	* USA/WA-UW76/2020
	* USA/WA11-UW7/2020
	* USA/WA12-UW8/2020
	* USA/WA13-UW9/2020
	* USA/WA14-UW10/2020
	* USA/WA15-UW11/2020
	* USA/WA16-UW12/2020
	* USA/WA17-UW13/2020
	* USA/WA18-UW14/2020

* Union Hospital of Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology
	* Wuhan/HBCDC-HB-03/2020
	* Wuhan/HBCDC-HB-04/2020

* Unknown
	* France/BFC2094/2020
	* Netherlands/Coevorden_1363618/2020

* Utah Public Health Laboratory
	* USA/UPHL-01/2020
	* USA/UPHL-02/2020
	* USA/UPHL-03/2020
	* USA/UPHL-04/2020
	* USA/UPHL-05/2020
	* USA/UPHL-06/2020

* Valley Medical Center
	* USA/WA8-UW5/2020

* Viral Respiratory Lab, National Institute for Biomedical Research (INRB)
	* Congo/KN-13/2020

* Virology Department, Royal Infirmary of Edinburgh, NHS Lothian
	* Scotland/EDB003/2020
	* Scotland/EDB004/2020
	* Scotland/EDB005/2020
	* Scotland/EDB006/2020
	* Scotland/EDB007/2020
	* Scotland/EDB008/2020
	* Scotland/EDB009/2020
	* Scotland/EDB011/2020
	* Scotland/EDB012/2020
	* Scotland/EDB013/2020

* Virology Department, Sheffield Teaching Hospitals NHS Foundation Trust
	* England/Sheff01/2020
	* England/Sheff02/2020

* Virology Unit, Institut Pasteur du Cambodge.
	* Cambodia/0012/2020

* WA State Department of Health
	* USA/WA1-A12/2020

* WHO National Influenza Centre Russian Federation
	* Russia/StPetersburg-3524/2020

* Wales Specialist Virology Centre
	* Wales/PHW03/2020
	* Wales/PHW04/2020
	* Wales/PHW05/2020
	* Wales/PHW06/2020
	* Wales/PHW1/2020
	* Wales/PHW10/2020
	* Wales/PHW12/2020
	* Wales/PHW13/2020
	* Wales/PHW2/2020
	* Wales/PHW27/2020
	* Wales/PHW28/2020
	* Wales/PHW33/2020
	* Wales/PHW37/2020
	* Wales/PHW38/2020

* Washington State Department of Health
	* USA/WA1-F6/2020
	* USA/WA2/2020

* Washington State Public Health Lab
	* USA/WA4-UW2/2020
	* USA/WA6-UW3/2020
	* USA/WA7-UW4/2020

* Weifang Center for Disease Control and Prevention
	* China/WF0001/2020
	* China/WF0002/2020
	* China/WF0003/2020
	* China/WF0004/2020
	* China/WF0006/2020
	* China/WF0009/2020
	* China/WF0012/2020
	* China/WF0014/2020
	* China/WF0015/2020
	* China/WF0016/2020
	* China/WF0017/2020
	* China/WF0018/2020
	* China/WF0019/2020
	* China/WF0020/2020
	* China/WF0021/2020
	* China/WF0023/2020
	* China/WF0024/2020
	* China/WF0026/2020
	* China/WF0028/2020
	* China/WF0029/2020

* West of Scotland Specialist Virology Centre, NHSGGC
	* Scotland/CVR01/2020
	* Scotland/CVR02/2020
	* Scotland/CVR03/2020
	* Scotland/CVR04/2020
	* Scotland/CVR05/2020
	* Scotland/CVR06/2020
	* Scotland/CVR07/2020
	* Scotland/CVR10/2020

* Wisconsin Department of Health Services
	* USA/WI1/2020

* Wuhan Fourth Hospital
	* Wuhan/WH05/2020

* Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences
	* bat/Yunnan/RaTG13/2013

* Wuhan Jinyintan Hospital
	* Wuhan/HBCDC-HB-01/2019
	* Wuhan/HBCDC-HB-02/2019
	* Wuhan/HBCDC-HB-03/2019
	* Wuhan/HBCDC-HB-04/2019
	* Wuhan/WIV02/2019
	* Wuhan/WIV04/2019
	* Wuhan/WIV05/2019
	* Wuhan/WIV06/2019
	* Wuhan/WIV07/2019

* Wuhan Lung Hospital
	* Wuhan/HBCDC-HB-06/2020

* Yongchuan District Center for Disease Control and Prevention
	* Chongqing/YC01/2020

* Zhejiang Provincial Center for Disease Control and Prevention
	* Zhejiang/WZ-01/2020
	* Zhejiang/WZ-02/2020

* Zhongxian Center for Disease Control and Prevention
	* Chongqing/ZX01/2020