测序原理 目录
FAQ 目录
测序饱和度评估 目录
测序乘数与覆盖率之间的关系
数据质控与预处理 目录
数据质控 目录
数据预处理 目录
短序列比对 目录
比对算法与工具 目录
SAM格式 目录
第二列(FLAG)标记信息:
最后一列比对详细信息:
估计intertsize 目录
将pair-end reads 比对到参考基因组上,根据得到的SAM文件中两端reads定位的位置,计算得到intertsize分布图
基因差异表达计算 目录
表达定量 目录
差异统计分析 目录
p-value的计算:认为P(x)服从泊松分布
p(y|x) 为基因A在两个样本中表达量相等的概率
变异检测 目录
检测插入缺失:
物种组成与丰度分析 目录
物种组成检测的案例: