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mamba_commands.md

File metadata and controls

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2023 Madagascar IGS Workshop

Liste des environnements qui seront nécessaire pendant l'atelier

Installation d'Anaconda avec WSL

Ceci n'est nécessaire que dans le cas où vous auriez installé Windows Linux Systems sur votre ordinateur personnel. Vous pouvez suivre les instructions sur cette page web

QC : contrôle qualité des reads

conda create -n qc
conda activate 

AQUAMIS : analyse des séquences

Chewiesnake

Abricate : annotation des gènes d'antibioresistance