diff --git a/doc/source/api/regolith.builders.rst b/doc/source/api/regolith.builders.rst
index 2e1d3337d..1ce2163d7 100644
--- a/doc/source/api/regolith.builders.rst
+++ b/doc/source/api/regolith.builders.rst
@@ -11,18 +11,26 @@ regolith.builders package
 Submodules
 ----------
 
-regolith.builders.reimbursementbuilder module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.builders.activitylogbuilder module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.builders.reimbursementbuilder
+.. automodule:: regolith.builders.activitylogbuilder
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.builders.preslistbuilder module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.builders.appraisalbuilder module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.builders.preslistbuilder
+.. automodule:: regolith.builders.appraisalbuilder
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
+
+regolith.builders.basebuilder module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+.. automodule:: regolith.builders.basebuilder
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
@@ -35,50 +43,50 @@ regolith.builders.beamplanbuilder module
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.builders.manuscriptreviewbuilder module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.builders.coabuilder module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.builders.manuscriptreviewbuilder
+.. automodule:: regolith.builders.coabuilder
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.builders.figurebuilder module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.builders.cpbuilder module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.builders.figurebuilder
+.. automodule:: regolith.builders.cpbuilder
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.builders.activitylogbuilder module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.builders.cvbuilder module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.builders.activitylogbuilder
+.. automodule:: regolith.builders.cvbuilder
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.builders.coabuilder module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.builders.figurebuilder module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.builders.coabuilder
+.. automodule:: regolith.builders.figurebuilder
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.builders.basebuilder module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.builders.formalletterbuilder module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.builders.basebuilder
+.. automodule:: regolith.builders.formalletterbuilder
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.builders.proposalreviewbuilder module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.builders.gradebuilder module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.builders.proposalreviewbuilder
+.. automodule:: regolith.builders.gradebuilder
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
@@ -91,18 +99,10 @@ regolith.builders.grantreportbuilder module
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.builders.postdocadbuilder module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
-
-.. automodule:: regolith.builders.postdocadbuilder
-    :members:
-    :undoc-members:
-    :show-inheritance:
-
-regolith.builders.publistbuilder module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.builders.htmlbuilder module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.builders.publistbuilder
+.. automodule:: regolith.builders.htmlbuilder
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
@@ -115,42 +115,42 @@ regolith.builders.internalhtmlbuilder module
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.builders.formalletterbuilder module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.builders.manuscriptreviewbuilder module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.builders.formalletterbuilder
+.. automodule:: regolith.builders.manuscriptreviewbuilder
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.builders.gradebuilder module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.builders.postdocadbuilder module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.builders.gradebuilder
+.. automodule:: regolith.builders.postdocadbuilder
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.builders.htmlbuilder module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.builders.preslistbuilder module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.builders.htmlbuilder
+.. automodule:: regolith.builders.preslistbuilder
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.builders.cvbuilder module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.builders.proposalreviewbuilder module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.builders.cvbuilder
+.. automodule:: regolith.builders.proposalreviewbuilder
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.builders.resumebuilder module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.builders.publistbuilder module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.builders.resumebuilder
+.. automodule:: regolith.builders.publistbuilder
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
@@ -163,18 +163,18 @@ regolith.builders.readinglistsbuilder module
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.builders.cpbuilder module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.builders.reimbursementbuilder module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.builders.cpbuilder
+.. automodule:: regolith.builders.reimbursementbuilder
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.builders.appraisalbuilder module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.builders.resumebuilder module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.builders.appraisalbuilder
+.. automodule:: regolith.builders.resumebuilder
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
diff --git a/doc/source/api/regolith.helpers.rst b/doc/source/api/regolith.helpers.rst
index 4a9a2cddb..93ab76072 100644
--- a/doc/source/api/regolith.helpers.rst
+++ b/doc/source/api/regolith.helpers.rst
@@ -11,34 +11,34 @@ regolith.helpers package
 Submodules
 ----------
 
-regolith.helpers.l_contactshelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.attestationshelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.l_contactshelper
+.. automodule:: regolith.helpers.attestationshelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.u_finishprumhelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.a_expensehelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.u_finishprumhelper
+.. automodule:: regolith.helpers.a_expensehelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.l_todohelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.a_grppub_readlisthelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.l_todohelper
+.. automodule:: regolith.helpers.a_grppub_readlisthelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.reimbstatushelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.a_manurevhelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.reimbstatushelper
+.. automodule:: regolith.helpers.a_manurevhelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
@@ -51,26 +51,34 @@ regolith.helpers.a_presentationhelper module
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.l_milestoneshelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.a_projectumhelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.l_milestoneshelper
+.. automodule:: regolith.helpers.a_projectumhelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.v_meetingshelper module
+regolith.helpers.a_proposalhelper module
 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.v_meetingshelper
+.. automodule:: regolith.helpers.a_proposalhelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.u_contacthelper module
+regolith.helpers.a_proprevhelper module
 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.u_contacthelper
+.. automodule:: regolith.helpers.a_proprevhelper
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
+
+regolith.helpers.a_todohelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+
+.. automodule:: regolith.helpers.a_todohelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
@@ -83,82 +91,82 @@ regolith.helpers.basehelper module
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.u_logurlhelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.f_todohelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.u_logurlhelper
+.. automodule:: regolith.helpers.f_todohelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.a_expensehelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.hellohelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.a_expensehelper
+.. automodule:: regolith.helpers.hellohelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.a_proprevhelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.l_abstracthelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.a_proprevhelper
+.. automodule:: regolith.helpers.l_abstracthelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.a_todohelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.l_contactshelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.a_todohelper
+.. automodule:: regolith.helpers.l_contactshelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.a_proposalhelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.l_currentappointmentshelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.a_proposalhelper
+.. automodule:: regolith.helpers.l_currentappointmentshelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.l_membershelper module
+regolith.helpers.l_generalhelper module
 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.l_membershelper
+.. automodule:: regolith.helpers.l_generalhelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.a_manurevhelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.l_grantshelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.a_manurevhelper
+.. automodule:: regolith.helpers.l_grantshelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.l_progressreporthelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.l_membershelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.l_progressreporthelper
+.. automodule:: regolith.helpers.l_membershelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.f_todohelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.l_milestoneshelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.f_todohelper
+.. automodule:: regolith.helpers.l_milestoneshelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.a_grppub_readlisthelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.l_progressreporthelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.a_grppub_readlisthelper
+.. automodule:: regolith.helpers.l_progressreporthelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
@@ -171,90 +179,82 @@ regolith.helpers.l_projectahelper module
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.l_generalhelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.l_todohelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.l_generalhelper
+.. automodule:: regolith.helpers.l_todohelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.l_grantshelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.makeappointmentshelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.l_grantshelper
+.. automodule:: regolith.helpers.makeappointmentshelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.l_currentappointmentshelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.reimbstatushelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.l_currentappointmentshelper
+.. automodule:: regolith.helpers.reimbstatushelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.l_abstracthelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.u_contacthelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.l_abstracthelper
+.. automodule:: regolith.helpers.u_contacthelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.attestationshelper module
+regolith.helpers.u_finishprumhelper module
 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.attestationshelper
-    :members:
-    :undoc-members:
-    :show-inheritance:
-
-regolith.helpers.a_projectumhelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
-
-.. automodule:: regolith.helpers.a_projectumhelper
+.. automodule:: regolith.helpers.u_finishprumhelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.u_todohelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.u_institutionshelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.u_todohelper
+.. automodule:: regolith.helpers.u_institutionshelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.makeappointmentshelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.u_logurlhelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.makeappointmentshelper
+.. automodule:: regolith.helpers.u_logurlhelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.u_institutionshelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.u_milestonehelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.u_institutionshelper
+.. automodule:: regolith.helpers.u_milestonehelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.hellohelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.u_todohelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.hellohelper
+.. automodule:: regolith.helpers.u_todohelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helpers.u_milestonehelper module
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helpers.v_meetingshelper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helpers.u_milestonehelper
+.. automodule:: regolith.helpers.v_meetingshelper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
diff --git a/doc/source/api/index.rst b/doc/source/api/regolith.rst
similarity index 79%
rename from doc/source/api/index.rst
rename to doc/source/api/regolith.rst
index 1f52ba354..dcd089448 100644
--- a/doc/source/api/index.rst
+++ b/doc/source/api/regolith.rst
@@ -1,217 +1,223 @@
-.. _api:
+:tocdepth: -1
 
-=================
-Regolith API
-=================
-For those of you who want the gritty details.
+regolith package
+================
+
+.. automodule:: regolith
+    :members:
+    :undoc-members:
+    :show-inheritance:
+
+Subpackages
+-----------
 
 .. toctree::
-    :maxdepth: 1
+    :titlesonly:
 
     regolith.builders
+    regolith.helpers
     regolith.static
     regolith.templates
-    regolith.helpers
 
-Other API usage
+Submodules
 ----------
 
-regolith.fsclient
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.app module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.fsclient
+.. automodule:: regolith.app
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helper_connect_main
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.broker module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helper_connect_main
+.. automodule:: regolith.broker
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.stylers
+regolith.builder module
 ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.stylers
+.. automodule:: regolith.builder
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.sorters
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.chained_db module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.sorters
+.. automodule:: regolith.chained_db
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helper_gui_main
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.classlist module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helper_gui_main
+.. automodule:: regolith.classlist
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.deploy
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.client_manager module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.deploy
+.. automodule:: regolith.client_manager
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.grader
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.commands module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.grader
+.. automodule:: regolith.commands
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.validators
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.dates module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.validators
+.. automodule:: regolith.dates
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.runcontrol
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.deploy module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.runcontrol
+.. automodule:: regolith.deploy
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.tools
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.emailer module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.tools
+.. automodule:: regolith.emailer
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.client_manager
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.fsclient module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.client_manager
+.. automodule:: regolith.fsclient
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.builder
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.grader module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.builder
+.. automodule:: regolith.grader
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.classlist
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helper module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.classlist
+.. automodule:: regolith.helper
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.schemas
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helper_connect_main module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.schemas
+.. automodule:: regolith.helper_connect_main
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.storage
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.helper_gui_main module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.storage
+.. automodule:: regolith.helper_gui_main
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.helper
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.interact module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.helper
+.. automodule:: regolith.interact
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.emailer
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.main module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.emailer
+.. automodule:: regolith.main
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.app
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.mongoclient module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.app
+.. automodule:: regolith.mongoclient
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.dates
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.runcontrol module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.dates
+.. automodule:: regolith.runcontrol
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.broker
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.schemas module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.broker
+.. automodule:: regolith.schemas
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.main
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.sorters module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.main
+.. automodule:: regolith.sorters
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.chained_db
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.storage module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.chained_db
+.. automodule:: regolith.storage
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.interact
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.stylers module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.interact
+.. automodule:: regolith.stylers
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.commands
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.tools module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.commands
+.. automodule:: regolith.tools
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
 
-regolith.mongoclient
-^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
+regolith.validators module
+^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-.. automodule:: regolith.mongoclient
+.. automodule:: regolith.validators
     :members:
     :undoc-members:
     :show-inheritance:
diff --git a/doc/source/collections/abstracts.rst b/doc/source/collections/abstracts.rst
index 5ee5c924f..e69de29bb 100644
--- a/doc/source/collections/abstracts.rst
+++ b/doc/source/collections/abstracts.rst
@@ -1,56 +0,0 @@
-Abstracts
-=========
-Abstracts for a conference or workshop. This is generally public information
-
-Schema
-------
-The following lists key names mapped to its type and meaning for each entry.
-
-:_id: string, Unique identifier for submission. This generally includes the author name and part of the title., required
-:coauthors: string, names of coauthors, optional
-:email: string, contact email for the author., required
-:firstname: string, first name of the author., required
-:institution: string, name of the institution, required
-:lastname: string, last name of the author., required
-:references: string, HTML string of reference for the abstract itself, optional
-:text: string, HTML string of the abstract., required
-:timestamp: string, The time when the abstract was submitted., required
-:title: string, title of the presentation/paper., required
-
-
-YAML Example
-------------
-
-.. code-block:: yaml
-
-	Mouginot.Model:
-	  coauthors: P.P.H. Wilson
-	  email: mouginot@wisc.edu
-	  firstname: Baptiste
-	  institution: University of Wisconsin-Madison
-	  lastname: Mouginot
-	  references: '[1] B. MOUGINOT, “cyCLASS: CLASS models for Cyclus,”, Figshare, https://dx.doi.org/10.6084/m9.figshare.3468671.v2
-	    (2016).'
-	  text: The CLASS team has developed high quality predictors based on pre-trained
-	    neural network...
-	  timestamp: 5/5/2017 13:15:59
-	  title: Model Performance Analysis
-
-
-JSON/Mongo Example
-------------------
-
-.. code-block:: json
-
-	{
-	    "_id": "Mouginot.Model",
-	    "coauthors": "P.P.H. Wilson",
-	    "email": "mouginot@wisc.edu",
-	    "firstname": "Baptiste",
-	    "institution": "University of Wisconsin-Madison",
-	    "lastname": "Mouginot",
-	    "references": "[1] B. MOUGINOT, \u201ccyCLASS: CLASS models for Cyclus,\u201d, Figshare, https://dx.doi.org/10.6084/m9.figshare.3468671.v2 (2016).",
-	    "text": "The CLASS team has developed high quality predictors based on pre-trained neural network...",
-	    "timestamp": "5/5/2017 13:15:59",
-	    "title": "Model Performance Analysis"
-	}
diff --git a/doc/source/conf.py b/doc/source/conf.py
index 8e93f7f0e..0cbee7d73 100644
--- a/doc/source/conf.py
+++ b/doc/source/conf.py
@@ -59,11 +59,11 @@
 # source_encoding = 'utf-8-sig'
 
 # The master toctree document.
-master_doc = "index"
+master_doc = "regolith"
 
 # General information about the project.
 project = "regolith"
-copyright = "2015, Anthony Scopatz"
+copyright = "2015, Anthony Scopatz, 2018-now Billinge group members"
 
 # The version info for the project you're documenting, acts as replacement for
 # |version| and |release|, also used in various other places throughout the