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Résumé
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- De nombreux vocabulaires et ontologies sont produits pour représenter et annoter les données agronomiques. Il est donc nécessaire de disposer d'une plateforme commune pour les identifier, les héberger et les utiliser dans les applications d'agro-informatique. Le projet AgroPortal vise à offrir un référentiel d'ontologies de référence pour l'agronomie, en réutilisant la technologie NCBO BioPortal. Les résultats scientifiques et l'expérience du domaine biomédical sont ainsi exploités et transposés dans le domaine de l'agronomie, comprenant les plantes, l'alimentation, l'environnement et éventuellement les sciences animales. Nous proposons un portail d'ontologies qui offre l'hébergement d'ontologies, la recherche, la versioning, la visualisation, le commentaire, la recommandation, permet l'annotation sémantique, ainsi que le stockage et l'exploitation d'alignements d'ontologies. Tout cela dans une infrastructure totalement conforme au web sémantique. Le projet AgroPortal accorde une attention particulière au respect des exigences de la communauté agronomique en termes de formats d'ontologies (par exemple, SKOS, dictionnaires de traits) ou de fonctionnalités prises en charge. Le projet AgroPortal est basé sur cinq cas d'utilisation agronomique qui participent à la conception et à l'orientation de la plateforme. AgroPortal offre déjà un référentiel de référence robuste et stable, d'une grande valeur pour le domaine de l'agronomie.
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Use cases
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Nouvelles fonctionnalités
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- See the notes de version
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Les partenaires
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Le Centre National d'Ontologie Biomédicale (NCBO), l'Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Research Data Alliance (RDA),
- Bioversity International, Food & Agriculture Organization (FAO), Global Open Data for Agriculture & Nutrition (Godan Action), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
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remerciements
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L'AgroPortail est en partie réalisé dans le cadre du projet d'Indexation Sémantique des Ressources Biomédicales Françaises (SIFR)
- qui ont reçu un financement du programme de recherche et d'innovation H2020 de l'UE dans le cadre de Marie Sklodowska-Curie (subvention 701771)
- et l'Agence Nationale de la Recherche (bourse ANR-12-JS02-01001), le Labex NUMEV (bourse ANR-10-LABX-20),
- l'Institut de Biologie Computationnelle de Montpellier (bourse ANR-11-BINF-0002) ainsi que par l'Université de Montpellier et le CNRS.
- Nous remercions également le Centre National des Ontologies Biomédicales pour son aide et le temps passé avec nous dans le déploiement de l'AgroPortail.
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Équipe
- Pour nous contacter: firstname.lastname@lirmm.fr
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- - Clément Jonquet,chercheur au LIRMM (Univ. de Montpellier, France), investigateur principal du projet AgroPortal
- - Anne Toulet, chercheuse au LIRMM (Univ. de Montpellier, France)
- - Vincent Emonet, ingénieur au LIRMM (Univ. de Montpellier, France)
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Cette ontologie s'intègre à OntoloBridge, permettant aux utilisateurs de la communauté de suggérer des ajouts à l'ontologie publique. Remplissez le modèle ci-dessous pour soumettre une demande de terme directement au responsable de l'ontologie.
Libellé du terme (obligatoire)
Nom du terme suggéré. Si un terme peut être décrit avec plusieurs synonymes, n'indiquez ici que le nom préféré.
@@ -469,94 +87,316 @@ fr:
Justification (facultatif)
Fournissez ici toute information supplémentaire sur le terme demandé.
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- # Generale
- showing: Affichage
- of: de
- sort: Trier
- popular: Populaire
- name: Nom
- classes_count: Nombre de classes
- instances_concepts_count: Nombre d'instances/concepts
- notes: Notes
- upload_date: Date de téléchargement
- release_date: Date de publication
- fair_score: Score FAIR
- search_rank: Classement de recherche
- no_matches: Aucune correspondance !
- uploaded: Téléchargé
- view_of: Vue de
- view: Vue
- summary_only: Résumé seulement
- groups: Groupes
- categories: Catégories
- admins: Administrateurs
- status: Statut
- no_submissions_available: Aucune soumission disponible
- classes: classes
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- category: Catégorie
- group: Groupe
- format: Format
- ontology_content: Contenu de l'ontologie
- natural_language: Langage naturel
- formality_levels: Niveaux de formalité
- is_of_type: Est du type
- missing_status: Statut manquant
- types: Types
- artifacts: Artéfacts
- formats: Formats
- selected_ontologies: Ontologies sélectionnées
- all: "Tout"
- none: "aucune"
- keywords: "Mots-clés"
- keywords_separated_by_commas: "Mots-clés séparés par des virgules"
- see_details: "Voir les détails"
- view_fair_scores_definitions: "View fair scores definitions"
- get_json_version: "Get the json version"
- select_ontologies: "Commencez à taper pour sélectionner des ontologies ou laissez vide pour toutes les utiliser"
- clear_selection: "Effacer la sélection"
- select_from_list: "Sélectionner dans la liste"
- more: "Plus"
- statistics: "Statistiques"
- average: "Moyenne"
- min: "Min"
- max: "Max"
- median: "Médiane"
- slices: "Tranches"
- help: "Aide"
- or: "Ou"
- show_advanced_options: "Afficher les options avancées"
- insert_sample_text: "Insérer un exemple de texte"
- class: "Classe"
- filter: "Filtre"
- ontology: "Ontologie"
- type: "Type"
- context: "Contexte"
- umls_sem_type: "Type Sem UMLS"
- matched_ontology: "ontologie correspondante"
- matched_class: "Classe correspondante"
- score: "Score"
- negation: "négation"
- experiencer: "Experiencer"
- temporality: "Temporalité"
- certainty: "Certitude"
- format_results: "Formater les résultats en "
- reproduce_results: "Reproduisez ces résultats en utilisant le "
- additional_parameters: "Paramètres supplémentaires expliqués à "
- input: "Entrée"
- text: "Texte"
- output: "Sortie"
- ontology_sets: "Ensembles d'ontologies"
- insert_sample_input: "Insérer une entrée d'exemple"
- weights_configuration: "Configuration des poids"
- coverage: "Couverture"
- acceptance: "Acceptation"
- knowledge_detail: "Détail de la connaissance"
- specialization: "Spécialisation"
- max_ontologies_per_set: "Nombre maximum d'ontologies par ensemble"
- paste_input_text: "Collez un paragraphe de texte ou des mots-clés à utiliser dans le calcul des recommandations d'ontologie"
- get_recommendations: "Obtenir des recommandations"
- select_ontologies_list: "Sélectionnez les ontologies"
-
-
\ No newline at end of file
+ context: Contexte
+ coverage: Couverture
+ experiencer: Experiencer
+ filter: Filtre
+ format_results: 'Formater les résultats en '
+ get_json_version: Get the json version
+ get_recommendations: Obtenir des recommandations
+ help: Aide
+ home:
+ agroportal_figures: "%{site} en chiffres:"
+ benefit1: Découvrez de nouvelles perspectives et connexions en explorant d'autres
+ ontologies dans le référentiel.
+ benefit2: Contribuez à la croissance et au développement de votre domaine en ajoutant
+ de nouveaux concepts et catégories.
+ benefit3: Utilisez le contrôle de version pour gérer les modifications apportées
+ à votre ontologie au fil du temps et collaborer avec d'autres utilisateurs.
+ benefit4: Obtenez des commentaires et des suggestions d'autres utilisateurs qui
+ peuvent examiner et commenter votre ontologie.
+ benefit5: Obtenez le score et les mesures FAIR pour votre ontologie.
+ fair_details: Voir les détails
+ fairness: Scores FAIR
+ get_annotations: Obtenir des annotations
+ get_recommendations: Obtenir des recommandations
+ index:
+ tagline: le référentiel d'ontologies biomédicales le plus complet au monde
+ title: Bienvenue à la %{organization}
+ welcome: Bienvenue à la %{site},
+ ontology_upload: Veux-tu télécharger une ontologie ?
+ ontology_upload_benefits: 'En téléchargeant votre ontologie sur %{site}, vous
+ pouvez :'
+ ontology_upload_button: Télécharger une ontologie
+ ontology_upload_desc: Télécharger une ontologie est un moyen de partager vos connaissances
+ du domaine avec les autres.
+ paste_text_prompt: Collez un paragraphe de texte ou quelques mots-clés..
+ recommender_annotator: Recommandateur et annotateur
+ supported_by: Soutenu par
+ twitter_news: Actualités twitter
+ with_collaboration: Avec la collaboration de
+ input: Entrée
+ insert_sample_text: Insérer un exemple de texte
+ keywords: Mots-clés
+ keywords_separated_by_commas: Mots-clés séparés par des virgules
+ knowledge_detail: Détail de la connaissance
+ landscape:
+ average_metrics: Métriques moyennes
+ category: Catégorie
+ filter_network: Filtrer le réseau
+ funding_endorsing_organizations: Les organisations qui financent et soutiennent
+ le plus grand nombre d'ontologies
+ group: Groupe
+ groups_and_categories: Groupes et catégories
+ intro: Visualiser les données récupérées à partir des ontologies stockées dans
+ le portail
+ more_properties_charts: Plus de graphiques de propriétés
+ most_active_ontologies: Ontologies les plus actives
+ most_active_organizations: Les organisations les plus actives
+ most_active_people: Les personnes les plus actives
+ most_active_people_as_reviewer: Les personnes les plus actives en tant que relecteurs
+ most_mentioned_people: Les personnes les plus mentionnées en tant que contact,
+ créateur, contributeur ou conservateur
+ most_mentioned_people_as_reviewer: Personnes ayant publié des notes, des avis
+ et des projets
+ ontologies_activity_on: Activité des ontologies sur %{site}
+ ontologies_by: Ontologies par %{type}
+ ontologies_contributors: Contributeurs au développement d'ontologies
+ ontologies_count_by_catalog: Nombre d'ontologies dans chaque catalogue de données
+ ontologies_formats: Format utilisé
+ ontologies_languages: Langues naturelles des ontologies
+ ontologies_licenses: Licences utilisées par les ontologies
+ ontologies_with_notes_reviews_projects: Ontologies avec des notes, des critiques
+ et des projets
+ ontology_fairness_evaluator: Évaluateur de conformité FAIR des ontologies (O’FAIRe)
+ ontology_formality_levels: Niveaux de formalité des ontologies
+ ontology_properties_pie_charts: Graphiques circulaires pour les propriétés utilisées
+ dans les ontologies
+ ontology_relations_network: Réseau de relations ontologiques
+ ontology_tools: Outils les plus utilisés pour construire des ontologies
+ owl_ontology_author_uris: URIs de propriétés d'auteur utilisées pour les ontologies
+ OWL
+ owl_ontology_definition_uris: URIs de propriétés de définition utilisées pour
+ les ontologies OWL
+ owl_ontology_preflabel_uris: URIs de propriétés prefLabel utilisées pour les ontologies
+ OWL
+ owl_ontology_synonym_uris: URIs de propriétés synonymes utilisées pour les ontologies
+ OWL
+ properties_usage_proportion: The proportion of properties usage among stored ontologies
+ properties_use: Utilisation des propriétés
+ relations_between_stored_ontologies: Relations entre les ontologies stockées sur
+ le portail
+ size: Taille
+ title: "%{site} Paysage"
+ layout:
+ header:
+ account_setting: Paramètres du compte
+ annotator: Annotateur
+ browse: Parcourir
+ documentation: Documentation
+ help: Aide
+ landscape: Paysage
+ login: Connexion
+ logout: Déconnecter
+ mappings: Mappings
+ publications: Publications
+ recommender: Recommender
+ release_notes: Notes de version
+ search_prompt: Rechercher dans %{portal_name} ...
+ submit_feedback: Envoyer un commentaire
+ support: assistance
+ login:
+ enter_email: Saisissez votre email
+ enter_password: Saisissez votre mot de passe
+ forgot_password: Mot de passe oublié ?
+ invalid_login: Erreurs sur le formulaire
+ no_account: Vous n'avez pas de compte ?
+ password: Mot de passe
+ register: S'inscrire
+ title: Connexion
+ username_or_email: Nom d'utilisateur ou Email
+ mappings:
+ find_mappings: Trouver les correspondances d'une classe / concept
+ intro: Parcourir les correspondances entre les classes de différentes ontologies
+ loading_mappings: Chargement des correspondances en cours...
+ mappings_bulk_load: Chargement en masse des correspondances
+ no_mappings_available: Aucune correspondance disponible
+ title: Correspondances
+ upload_mappings: Télécharger les correspondances
+ matched_class: Classe correspondante
+ matched_ontology: ontologie correspondante
+ max_ontologies_per_set: Nombre maximum d'ontologies par ensemble
+ nbco_annotatosplus:
+ annotations: Annotations
+ enter_paste_text_to_annotate: 'Entrez ou collez le texte à annoter :'
+ exclude_numbers: Exclure les nombres
+ exclude_synonyms: Exclure les synonymes
+ fast_context:
+ help: 'Activer FastContext pour détecter : si un concept a été nié (affirmé,
+ nié), qui a vécu le concept trouvé (patient, autre), quand le concept annoté
+ s''est produit (récent, historique, hypothétique), et/ou si le concept annoté
+ est incertain (certain, incertain).'
+ title: FastContext
+ filters:
+ additional_parameters_explained_at: 'Des paramètres supplémentaires sont expliqués
+ à la page :'
+ by:
+ certainty: Certitude
+ class: Classe
+ experiencer: Expérience
+ filter: Filtrer
+ match_context: Contexte
+ match_type: Type
+ matched_class: Classe associée
+ matched_ontology: Ontologie associée
+ negation: Négation
+ ontology: Ontologie
+ score: Score
+ temporality: Temporalité
+ title: Les résultats sont filtrés par
+ umls_sem_type: Type sémantique UMLS
+ confidence_threshold: Seuil de confiance du filtre
+ confidence_threshold_help: Spécifiez la position minimale dans la distribution
+ des scores (entre 1 et 100)
+ format_results_as: 'Formater les résultats en tant que :'
+ reproduce_results_using: Reproduire ces résultats en utilisant le
+ score_threshold: Filtrer par seuil de score
+ score_threshold_help: Spécifier la valeur de score minimum pour les annotations
+ include_ancestors_up_to_level: Inclure les ancêtres jusqu'au niveau
+ include_mappings: Inclure les correspondances
+ include_score: Inclure le score
+ index:
+ intro: |
+ Le NCBO Annotator+ est un proxy appelant le service Web NCBO Annotator sur le NCBO BioPortal.
+
+ Tchechmedjiev, A., Abdaoui, A., Emonet, V., Melzi, S., Jonnagaddala, J., & Jonquet, C. (2018). Fonctionnalités améliorées pour annoter et indexer le texte clinique avec NCBO Annotator+. Bioinformatique, 34(11), 1962-1965.
+
+ Si vous utilisez l'API, veuillez fournir une clé API NCBO BioPortal valide et accéder au service sur http://services.bioportal.lirmm.fr/ncbo_annotatorplus
+ Le texte soumis au NCBO Annotator+ doit être en anglais.
+ sample_text: Le mélanome est une tumeur maligne des mélanocytes qui se trouvent
+ principalement dans la peau mais aussi dans l'intestin et l'œil.
+ title: NCBO Annotator +
+ insert_sample_text: Insérer un exemple de texte
+ match_longest_only: Correspondance la plus longue seulement
+ match_partial_words: Correspondance de mots partiels
+ recognizer: Reconnaissance d'entité
+ score_help: Annotations de score suivant la mesure NCBO 2009 précédente (ancienne)
+ ou Annotations de score suivant la mesure C-Value (cvalue) ou Annotations de
+ score suivant la mesure C-Value avec expansion de la hiérarchie (cvalueh)
+ select: Sélectionnez %{name}
+ select_ontologies: Commencez à taper pour sélectionner des ontologies ou laissez
+ vide pour utiliser toutes les ontologies
+ select_ontologies_list: Sélectionnez les ontologies
+ show_advanced_options: Afficher les options avancées
+ start_typing_to_select: Commencez à taper pour sélectionner %{type} ou laissez
+ vide pour tout utiliser
+ umls:
+ semantic_groups: Groupes sémantiques UMLS
+ semantic_types: Types sémantiques UMLS
+ negation: négation
+ none: aucune
+ ontologies:
+ ontology_search_prompt: 'Recherchez une ontologie ou un concept (Ex : Agrovoc...)'
+ self: Ontologies
+ ontology: Ontologie
+ ontology_details:
+ concept:
+ definitions: Définitions
+ id: Identifiant
+ in_schemes: Dans les schémas
+ member_of: Membre de
+ no_preferred_name_for_selected_language: Pas de nom préféré pour la langue sélectionnée.
+ obsolete: Obsolète
+ preferred_name: Nom préféré
+ synonyms: Synonymes
+ type: Type
+ metadata:
+ additional_metadata: Métadonnées supplémentaires
+ ontology_sets: Ensembles d'ontologies
+ output: Sortie
+ projects:
+ contacts: Contacts
+ create_new_project: Créer un nouveau projet
+ created: Créé
+ creator: Utilisateur
+ delete_admin_only: Supprimer (administrateur seulement)
+ delete_confirm: Êtes-vous sûr(e) ?
+ description: Description
+ description_text: Texte de description
+ edit: Modifier
+ home_page: Page d'accueil
+ index:
+ intro: Parcourez une sélection de projets qui utilisent les ressources %{site}
+ institutions: Institutions
+ ontologies: Ontologies
+ project_description: Description du projet
+ self: Projets
+ title: Liste de projets
+ view_projects_help: Aide à la visualisation des projets
+ recommender:
+ intro: Obtenez des recommandations pour les ontologies les plus pertinentes à
+ partir d'un extrait d'un texte biomédical ou d'une liste de mots-clés
+ no_recommendations: Aucune recommandation trouvée
+ no_sets_recommended: Il n'y a pas d'ensembles d'ontologies recommandés pour l'entrée
+ fournie. Veuillez essayer la sortie 'Ontologies'.
+ ontology_recommendation_input: Veuillez coller un paragraphe de texte ou quelques
+ mots-clés pour calculer les recommandations d'ontologie.
+ ontology_recommender: Recommandeur d'ontologie
+ paste_text_recommendations: Collez un paragraphe de texte ou quelques mots-clés
+ à utiliser pour calculer les recommandations d'ontologie
+ recommendation_error: Problème lors de la récupération des recommandations, veuillez
+ réessayer
+ text_length_limit: Veuillez utiliser moins de 500 mots. Si vous devez annoter
+ de plus grands morceaux de texte, vous pouvez utiliser le service web de recommandation.
+ title: recommandeur
+ valid_integer_max_ontologies_per_set: Le nombre maximum d'ontologies par ensemble
+ doit être une valeur entière valide
+ valid_max_ontologies_per_set_range: Le nombre maximum d'ontologies par ensemble
+ doit être un nombre entre 2 et 4
+ valid_numeric_weights: Tous les poids doivent être des valeurs numériques valides
+ weight_sum_greater_than_zero: La somme des poids doit être supérieure à zéro
+ weights_greater_than_zero: Tous les poids doivent être supérieurs ou égaux à zéro
+ register:
+ account_errors: 'Erreurs lors de la création de votre compte :'
+ confirm_password: Confirmer le mot de passe
+ create_account: Créer un nouveau compte
+ email: Email
+ first_name: Prénom
+ last_name: Nom
+ mailing_list: S'inscrire à la liste de diffusion d'AgroPortal
+ optional: "(Facultatif)"
+ password: Mot de passe
+ title: S'inscrire
+ username: Nom d'utilisateur
+ reproduce_results: 'Reproduisez ces résultats en utilisant le '
+ score: Score
+ search:
+ categories: Catégories
+ class_search: Recherche de classe
+ classes_with_definitions: Classes avec Définitions
+ hide_advanced_options: Masquer les options avancées
+ include_in_search: Inclure dans la recherche
+ index:
+ categories_placeholder: Commencez à taper pour sélectionner des catégories ou
+ laissez vide pour tout utiliser
+ obsolete_definition: 'Une classe que les auteurs de l''ontologie ont signalée
+ comme étant obsolète et qu''ils recommandent de ne pas utiliser. Ces cours
+ sont souvent laissés dans des ontologies (plutôt que de les supprimer entièrement)
+ afin que les systèmes existants qui en dépendent continuent à fonctionner.
+
+ '
+ property_definition: Association nommée entre deux entités. Les exemples sont
+ "définition" (une relation entre une classe et du texte) et "partie de" (une
+ relation entre deux classes).
+ search_keywords_placeholder: Entrez une classe, par ex. Mélanome
+ narrow_search_to: Réduire la recherche à
+ obsolete_classes: Classes obsolètes
+ ontologies: Ontologies
+ ontology_views: Vues d'ontologie
+ property_values: Valeurs de propriété
+ show_advanced_options: Afficher les options avancées
+ title: Rechercher
+ view_search_documentation: Voir la documentation de recherche
+ select_from_list: Sélectionner dans la liste
+ select_ontologies: Commencez à taper pour sélectionner des ontologies ou laissez
+ vide pour toutes les utiliser
+ select_ontologies_list: Sélectionnez les ontologies
+ show_advanced_options: Afficher les options avancées
+ specialization: Spécialisation
+ temporality: Temporalité
+ text: Texte
+ type: Type
+ umls_sem_type: Type Sem UMLS
+ view_fair_scores_definitions: View fair scores definitions
+ visits: Visites
+ weights_configuration: Configuration des poids
diff --git a/config/locales/it.yml b/config/locales/it.yml
new file mode 100644
index 0000000000..09ada938a8
--- /dev/null
+++ b/config/locales/it.yml
@@ -0,0 +1,399 @@
+---
+it:
+ activaterecord:
+ errors:
+ models:
+ license:
+ attributes:
+ encrypted_key:
+ invalid_license_key: is an invalid license key
+ no_appliance_id_for_comparison: Could not be validated. Unable to retrieve virtual appliance ID.
+ appliance_id_mismatch: is an appliance id mismatch
+
+ date:
+ formats:
+ year_month_day_concise: "%Y-%m-%d" # 2017-03-01
+ month_day_year: "%b %-d, %Y" # Mar 1, 2017
+ monthfull_day_year: "%B %-d, %Y" # March 1, 2017
+
+ additional_parameters: Parametri aggiuntivi spiegati in
+ admin:
+ licenses:
+ create:
+ success: Licenza rinnovata con successo!
+ all: Tutti
+ annotator:
+ annotate_text_prompt: Inserire o incollare il testo da annotare
+ annotations_result: Annotazioni
+ fast_context: Contesto veloce
+ filters:
+ confidence_threshold: Soglia di confidenza del filtro
+ confidence_threshold_help: Specificare la posizione minima nella distribuzione
+ dei punteggi (tra 1 e 100)
+ exclude_numbers: Escludere i numeri
+ exclude_synonyms: Escludere sinonimi
+ include_mappings: Includere le mappature
+ match_longest_only: Solo la partita più lunga
+ match_partial_words: Riconoscere parole parziali
+ max_hierarchy_level: Includere gli antenati fino al livello
+ score: Includere il punteggio
+ score_help: Punteggio delle annotazioni secondo la precedente misura NCBO 2009
+ (old) o Punteggio delle annotazioni secondo la misura C-Value (cvalue) o Punteggio
+ delle annotazioni secondo la misura C-Value con espansione gerarchica (cvalueh)
+ score_threshold: Filtrare per soglia di punteggio
+ score_threshold_help: Specificare il valore minimo del punteggio per le annotazioni
+ get_annotator: Ottenere le annotazioni
+ index:
+ fast_context:
+ tooltip: 'Abilita FastContext a rilevare: se un concetto è stato negato (affermato,
+ negato), chi ha sperimentato il concetto trovato (paziente, altro), quando
+ si è verificato il concetto annotato (recente, storico, ipotetico), e/o
+ se il concetto annotato è incerto (certo, incerto).'
+ intro: Ottenere annotazioni per un testo biomedico con classi ontologiche
+ lemmatize:
+ tooltip: Abilita Lemmatize per lemmatizzare il testo inviato e utilizzare
+ un dizionario lemmatizzato per le annotazioni
+ sample_text: Il melanoma è un tumore maligno dei melanociti che si trova principalmente
+ nella pelle, ma anche nell'intestino e nell'occhio.
+ lemmatize: Lemmatizzare
+ results_filtered_by: I risultati sono filtrati da
+ select: Selezionare %{name}
+ start_typing_to_select: Iniziare a digitare per selezionare %{type} o lasciare
+ in bianco per utilizzare tutti i dati
+ title: Annotatore
+ umls:
+ semantic_groups: Gruppi semantici UMLS
+ semantic_types: Tipi semantici UMLS
+ certainty: Certezza
+ class: Classe
+ clear_selection: Azzeramento della selezione
+ concepts:
+ request_term:
+ new_term_instructions: |
+ Questa ontologia si integra con OntoloBridge, permettendo agli utenti della comunità di suggerire aggiunte all'ontologia pubblica. Compilare il modello sottostante per inviare una richiesta di termine direttamente al gestore dell'ontologia.
+
+ Etichetta del termine (obbligatorio)
Nome del termine suggerito. Se un termine può essere descritto con più di un sinonimo, inserire qui solo il nome preferito.
+
+
+ Descrizione del termine (obbligatorio)
Breve definizione, descrizione o uso del termine suggerito. In questa sezione si possono elencare i sinonimi di altri termini.
+
+
+ Superclasse (obbligatorio)
Il termine padre del termine suggerito. Il termine genitore deve essere una voce esistente nell'ontologia corrente. La superclasse può essere selezionata direttamente dall'albero delle classi del Bioportale.
+
+
+ Riferimenti (facoltativo)
Fornire prove dell'esistenza del termine richiesto, come ID Pubmed di articoli o link ad altre risorse che descrivono il termine.
+
+
+ Giustificazione (opzionale)
Fornisci qui qualsiasi informazione aggiuntiva sul termine richiesto.
+
+ context: Contesto
+ coverage: Copertura
+ filter: Filtro
+ format_results: Formatta i risultati come
+ get_json_version: Ottenere la versione json
+ get_recommendations: Raccomandazioni
+ help: Aiuto
+ home:
+ agroportal_figures: "%{site} in cifre:"
+ benefit1: Scoprite nuove intuizioni e connessioni esplorando le altre ontologie
+ presenti nel repository.
+ benefit2: Contribuite alla crescita e allo sviluppo del vostro dominio aggiungendo
+ nuovi concetti e categorie.
+ benefit3: Utilizzate il controllo di versione per gestire le modifiche alla vostra
+ ontologia nel tempo e collaborare con altri utenti.
+ benefit4: Ottenere feedback e suggerimenti da altri utenti che possono rivedere
+ e commentare la vostra ontologia.
+ benefit5: Ottenere il punteggio e le metriche FAIR per l'ontologia.
+ fair_details: Vedi dettagli
+ fairness: Punteggi FAIR
+ get_annotations: Ottenere le annotazioni
+ get_recommendations: Raccomandazioni
+ index:
+ tagline: La casa dei vocabolari e delle ontologie in agronomia e nei campi correlati.
+ title: Benvenuti alla %{organization}
+ welcome: Benvenuti al %{site},
+ ontology_upload: Volete caricare un'ontologia?
+ ontology_upload_benefits: 'Caricando la propria ontologia su %{site}, è possibile:'
+ ontology_upload_button: Caricare l'ontologia
+ ontology_upload_desc: Caricare un'ontologia è un modo per condividere la propria
+ conoscenza del dominio con altri.
+ paste_text_prompt: Incollare un paragrafo di testo o alcune parole chiave ...
+ recommender_annotator: Raccomandatore e annotatore
+ supported_by: Supportato da
+ twitter_news: Notizie su Twitter
+ with_collaboration: Con la collaborazione di
+ input: Ingresso
+ insert_sample_text: Inserire un testo di esempio
+ keywords: Parole chiave
+ keywords_separated_by_commas: Parole chiave separate da virgole
+ knowledge_detail: Dettaglio della conoscenza
+ landscape:
+ average_metrics: Metriche medie
+ category: Categoria
+ filter_network: Rete di filtraggio
+ funding_endorsing_organizations: Organizzazioni che finanziano e sostengono il
+ maggior numero di ontologie
+ group: Gruppo
+ groups_and_categories: Gruppi e categorie
+ intro: Visualizzare i dati recuperati dalle ontologie memorizzate nel portale
+ more_properties_charts: Altri grafici delle proprietà
+ most_active_ontologies: Le ontologie più attive
+ most_active_organizations: Le organizzazioni più attive
+ most_active_people: Le persone più attive
+ most_active_people_as_reviewer: Le persone più attive come recensori
+ most_mentioned_people: Le persone più citate come contatto, creatore, collaboratore
+ o curatore
+ most_mentioned_people_as_reviewer: Persone che hanno pubblicato note, recensioni
+ e progetti
+ ontologies_activity_on: Attività ontologica su %{site}
+ ontologies_by: Ontologie per %{type}
+ ontologies_contributors: Contribuenti allo sviluppo dell'ontologia
+ ontologies_count_by_catalog: Numero di ontologie in ogni catalogo di dati
+ ontologies_formats: Formato utilizzato
+ ontologies_languages: Linguaggi naturali delle ontologie
+ ontologies_licenses: Licenze utilizzate dalle ontologie
+ ontologies_with_notes_reviews_projects: Ontologie con note, recensioni e progetti
+ ontology_fairness_evaluator: Valutatore di ontologia FAIR (O'FAIRe)
+ ontology_formality_levels: Livelli di formalità delle ontologie
+ ontology_properties_pie_charts: Grafici a torta per le proprietà utilizzate nelle
+ ontologie
+ ontology_relations_network: Rete di relazioni ontologiche
+ ontology_tools: Strumenti più utilizzati per costruire ontologie
+ owl_ontology_author_uris: URI per le proprietà dell'autore utilizzate per le ontologie
+ OWL
+ owl_ontology_definition_uris: URI per le proprietà di definizione utilizzate per
+ le ontologie OWL
+ owl_ontology_preflabel_uris: URI per le proprietà prefLabel utilizzate per le
+ ontologie OWL
+ owl_ontology_synonym_uris: URI per le proprietà dei sinonimi utilizzati per le
+ ontologie OWL
+ properties_usage_proportion: La percentuale di utilizzo delle proprietà tra le
+ ontologie memorizzate
+ properties_use: Uso della proprietà
+ relations_between_stored_ontologies: Relazioni tra le ontologie memorizzate nel
+ portale
+ size: Dimensione
+ title: "%{site} Paesaggio"
+ layout:
+ header:
+ account_setting: Impostazioni dell'account
+ annotator: Annotatore
+ browse: Sfogliare
+ documentation: Documentazione
+ help: Aiuto
+ landscape: Paesaggio
+ login: Accesso
+ logout: logout
+ mappings: Mappature
+ publications: Pubblicazioni
+ release_notes: Note di rilascio
+ search_prompt: Cerca in %{portal_name} ...
+ submit_feedback: Invia un feedback
+ support: supporto
+ login:
+ enter_email: Inserisci il tuo indirizzo e-mail
+ enter_password: Inserire la password
+ forgot_password: Hai dimenticato la password?
+ invalid_login: Errori nel modulo
+ no_account: Non avete un account?
+ password: Password
+ register: Registro
+ title: Accesso
+ username_or_email: Nome utente o e-mail
+ mappings:
+ find_mappings: Trovare le mappature di una classe/concetto
+ intro: Sfogliare le mappature tra classi di diverse ontologie
+ loading_mappings: Caricamento delle mappature...
+ mappings_bulk_load: Mappatura del carico massivo
+ no_mappings_available: Nessuna mappatura disponibile
+ title: Corrispondenze
+ upload_mappings: Caricare le mappature
+ matched_class: Classe abbinata
+ matched_ontology: ontologia abbinata
+ max_ontologies_per_set: Numero massimo di ontologie per set
+ nbco_annotatosplus:
+ annotations: Annotazioni
+ enter_paste_text_to_annotate: 'Inserire o incollare il testo da annotare:'
+ exclude_numbers: Escludere i numeri
+ exclude_synonyms: Escludere sinonimi
+ fast_context:
+ help: 'Attivare FastContext per rilevare: se un concetto è stato negato (affermato,
+ negato), chi ha sperimentato il concetto trovato (paziente, altro), quando
+ si è verificato il concetto annotato (recente, storico, ipotetico), e/o se
+ il concetto annotato è incerto (certo, incerto).'
+ title: Contesto veloce
+ filters:
+ additional_parameters_explained_at: 'Ulteriori parametri sono spiegati nella
+ pagina:'
+ by:
+ certainty: Certezza
+ class: Classe
+ experiencer: Esperto
+ filter: Filtro
+ match_context: Contesto
+ match_type: Tipo
+ matched_class: Classe associata
+ matched_ontology: Ontologia associata
+ negation: Negazione
+ ontology: Ontologia
+ score: Punteggio
+ temporality: Temporalità
+ title: I risultati sono filtrati da
+ umls_sem_type: Tipo semantico UMLS
+ confidence_threshold: Soglia di fiducia del filtro
+ confidence_threshold_help: Specificare la posizione minima nella distribuzione
+ dei punteggi (tra 1 e 100)
+ format_results_as: 'Formattare i risultati come:'
+ reproduce_results_using: Riprodurre questi risultati utilizzando il metodo
+ score_threshold: Filtrare per soglia di punteggio
+ score_threshold_help: Specificare il valore minimo del punteggio per le annotazioni
+ include_ancestors_up_to_level: Includere gli antenati fino al livello
+ include_mappings: Includere le mappature
+ include_score: Includere il punteggio
+ index:
+ intro: |
+ NCBO Annotator+ è un proxy che chiama il servizio web NCBO Annotator sul BioPortale NCBO.
+
+ Tchechmedjiev, A., Abdaoui, A., Emonet, V., Melzi, S., Jonnagaddala, J., & Jonquet, C. (2018). Funzioni migliorate per l'annotazione e l'indicizzazione di testi clinici con NCBO Annotator+. Bioinformatica, 34(11), 1962-1965.
+
+ Se si utilizza l'API, fornire una chiave API NCBO BioPortal valida e accedere al servizio all'indirizzo http://services.bioportal.lirmm. en/ncbo_annotatorplus
+ Il testo inviato a NCBO Annotator+ deve essere in inglese.
+ sample_text: Il melanoma è un tumore maligno dei melanociti che si trova principalmente
+ nella pelle, ma anche nell'intestino e nell'occhio.
+ title: Annotatore NCBO +
+ insert_sample_text: Inserire un testo di esempio
+ match_longest_only: Solo la partita più lunga
+ match_partial_words: Abbinare parole parziali
+ recognizer: Riconoscimento dell'entità
+ score_help: Punteggio delle annotazioni secondo la precedente misura NCBO 2009
+ (old) o Punteggio delle annotazioni secondo la misura C-Value (cvalue) o Punteggio
+ delle annotazioni secondo la misura C-Value con espansione gerarchica (cvalueh)
+ select: Selezionare %{name}
+ select_ontologies: Iniziare a digitare per selezionare le ontologie o lasciare
+ vuoto per utilizzare tutte le ontologie
+ select_ontologies_list: Selezionare le ontologie
+ show_advanced_options: Mostra le opzioni avanzate
+ start_typing_to_select: Iniziare a digitare per selezionare %{type} o lasciare
+ vuoto per usare tutti
+ umls:
+ semantic_groups: Gruppi semantici UMLS
+ semantic_types: Tipi semantici UMLS
+ negation: negazione
+ none: nessuno
+ ontologies:
+ ontology_search_prompt: 'Ricerca di un''ontologia o di un concetto (es.: Agrovoc
+ ...)'
+ self: Ontologie
+ ontology: Ontologia
+ ontology_details:
+ concept:
+ definitions: Definizioni
+ id: ID
+ in_schemes: In Schemi
+ member_of: Membro di
+ no_preferred_name_for_selected_language: Nessun nome preferito per la lingua
+ selezionata.
+ obsolete: Obsoleto
+ preferred_name: Nome preferito
+ synonyms: Sinonimi
+ type: Tipo
+ metadata:
+ additional_metadata: Metadati aggiuntivi
+ ontology_sets: Insiemi di ontologie
+ output: Uscita
+ projects:
+ contacts: Contatti
+ create_new_project: Creare un nuovo progetto
+ created: Creato
+ creator: Utente
+ delete_admin_only: Elimina (solo per l'amministratore)
+ delete_confirm: Sei sicuro?
+ description: Descrizione
+ description_text: Descrizione Testo
+ edit: Modifica
+ home_page: Pagina iniziale
+ index:
+ intro: Sfoglia una selezione di progetti che utilizzano risorse %{site}
+ institutions: Istituzioni
+ ontologies: Ontologie
+ project_description: Descrizione del progetto
+ self: Progetti
+ title: Elenco dei progetti
+ view_projects_help: Visualizza i progetti Aiuto
+ recommender:
+ intro: Ottenere raccomandazioni per le ontologie più rilevanti da un estratto
+ di un testo biomedico o da un elenco di parole chiave
+ no_recommendations: Nessuna raccomandazione trovata
+ no_sets_recommended: Non ci sono set di ontologie consigliati per l'input fornito.
+ Provare con l'output "Ontologie".
+ ontology_recommendation_input: Incollare un paragrafo di testo o alcune parole
+ chiave per calcolare le raccomandazioni dell'ontologia.
+ ontology_recommender: Raccomandatore di ontologia
+ paste_text_recommendations: Incollare un paragrafo di testo o alcune parole chiave
+ da utilizzare per calcolare le raccomandazioni dell'ontologia
+ recommendation_error: Problema nel recupero delle raccomandazioni, provare di
+ nuovo
+ text_length_limit: Si prega di utilizzare meno di 500 parole. Se avete bisogno
+ di annotare testi più lunghi, potete utilizzare il servizio web di raccomandazione.
+ title: raccomandatore
+ valid_integer_max_ontologies_per_set: Il numero massimo di ontologie per set deve
+ essere un valore intero valido
+ valid_max_ontologies_per_set_range: Il numero massimo di ontologie per set deve
+ essere un numero compreso tra 2 e 4
+ valid_numeric_weights: Tutti i pesi devono essere valori numerici validi
+ weight_sum_greater_than_zero: La somma dei pesi deve essere maggiore di zero
+ weights_greater_than_zero: Tutti i pesi devono essere maggiori o uguali a zero
+ register:
+ account_errors: 'Errori nella creazione dell''account:'
+ confirm_password: Confermare la password
+ create_account: Creare un nuovo account
+ email: Email
+ first_name: Nome
+ last_name: Cognome
+ mailing_list: Registrarsi alla mailing list di AgroPortal
+ optional: "(Opzionale)"
+ password: Password
+ title: Registro
+ username: Nome utente
+ reproduce_results: Riprodurre questi risultati utilizzando il metodo
+ score: Punteggio
+ search:
+ categories: Categorie
+ class_search: Ricerca di classe
+ classes_with_definitions: Classi con definizioni
+ hide_advanced_options: Nascondere le opzioni avanzate
+ include_in_search: Includere nella ricerca
+ index:
+ categories_placeholder: Iniziare a digitare per selezionare le categorie o lasciare
+ vuoto per utilizzare tutte le categorie
+ obsolete_definition: 'Una classe che gli autori dell''ontologia hanno segnalato
+ come obsoleta e che raccomandano di non usare. Spesso queste classi vengono
+ lasciate nelle ontologie (invece di essere eliminate del tutto) in modo che
+ i sistemi esistenti che dipendono da esse continuino a funzionare"
+
+ '
+ property_definition: Un'associazione nominativa tra due entità. Esempi sono
+ "definizione" (una relazione tra una classe e un testo) e "parte di" (una
+ relazione tra due classi).
+ search_keywords_placeholder: Inserire una classe, ad es. Melanoma
+ narrow_search_to: Restringere la ricerca a
+ obsolete_classes: Classi obsolete
+ ontologies: Ontologie
+ ontology_views: Viste ontologiche
+ property_values: Valori della proprietà
+ show_advanced_options: Mostra opzioni avanzate
+ title: Ricerca
+ view_search_documentation: Visualizza la documentazione della ricerca
+ select_from_list: Selezionare dall'elenco
+ select_ontologies: Iniziare a digitare per selezionare le ontologie o lasciare vuoto
+ per utilizzarle tutte
+ select_ontologies_list: Selezionare le ontologie
+ show_advanced_options: Mostra le opzioni avanzate
+ specialization: Specializzazione
+ temporality: Temporalità
+ text: Testo
+ type: Tipo
+ umls_sem_type: Tipo UMLS Sem
+ view_fair_scores_definitions: Visualizza le definizioni dei punteggi equi
+ visits: Visite
+ weights_configuration: Configurazione dei pesi
diff --git a/config/routes.rb b/config/routes.rb
index 007c220f27..8e706eba1d 100644
--- a/config/routes.rb
+++ b/config/routes.rb
@@ -91,8 +91,6 @@
# Top-level pages
match '/feedback', to: 'home#feedback', via: [:get, :post]
get '/account' => 'home#account'
- get '/help' => 'home#help'
- get '/about' => 'home#about'
get '/site_config' => 'home#site_config'
get '/validate_ontology_file' => 'home#validate_ontology_file_show'
post '/annotator_recommender_form' => 'home#annotator_recommender_form'
diff --git a/package.json b/package.json
index c4241b80fa..d5003c910e 100644
--- a/package.json
+++ b/package.json
@@ -9,14 +9,15 @@
"flatpickr": "^4.6.13",
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- "stimulus-read-more": "^4.1.0",
"stimulus-rails-nested-form": "^4.0.0",
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- "vis-util": "^5.0.3",
- "tippy.js": "^6.3.7",
- "tom-select": "^2.2.2"
+ "vis-util": "^5.0.3"
},
"scripts": {
"build": "esbuild app/javascript/*.* --bundle --sourcemap --outdir=app/assets/builds"
diff --git a/yarn.lock b/yarn.lock
index ea428d70f7..6ef2719673 100644
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+++ b/yarn.lock
@@ -225,6 +225,11 @@ stimulus-read-more@^4.1.0:
resolved "https://registry.yarnpkg.com/stimulus-read-more/-/stimulus-read-more-4.1.0.tgz#f34efb2dcb33fd091936d84c569937bc100506c8"
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