対称関数のパラメータをもう少し細かく

[masayoshi-ogura]

現状：
対象の原子種をAとして、
G1,G2はA-A,A-Bの2種類、G4はA-A-A,A-A-B,B-A-Bの3種類を全て同じカットオフ(=Rc)で計算している

変更：
結合相手によってRcを別々に設定してみる。
結晶においてある原子の第１近接、第２近接…と考えていくと、当然相手の原子種で分けることができる。
MDによる原子の揺れを取り入れるためには目的となる近接原子の安定構造時の距離より余裕を持ってRcを設定したいが、遠くなるほど入り乱れ、入って欲しくない近接原子も入ってしまうことになる。
原子種で分ければ、完全にとはいかないがある程度区別できる…気がする

[masayoshi-ogura]

現在使っている対称関数の種類はtype1,2,4の３つで、
そのうちtype2はRsで注目する山の中心をずらせるので、そんなに必要ないかも？