analyse-R/manipuler-les-donnees-avec-dplyr

[giscus[bot]]

analyse-R/manipuler-les-donnees-avec-dplyr

https://larmarange.github.io/analyse-R/manipuler-les-donnees-avec-dplyr.html

[Alphonsboud]

Bonjour,
J'ai des difficultés à utiliser la fonction select de plyr et tidyverse.
Pourtant les packages ont bien été chargé.
Lorsque j'exécute un simple code tel que : select(qct, Sexe, Top), je m'attends à un résultat de 2 colonnes Sexe et Top.
Mais dans le retour R renvoie le message ci-dessous que je ne comprends pas du tout.
"> select(Sexe, Top)
Error in select(Sexe, Top) : unused argument (Top)".
En fait qct est mon dataframe qui contient plusieurs variables dont Sexe et Top.

J'ai pensé à un moment que l'origine du problème serait le dataframe lui-meme.
Alors, j'ai suivi l'exemple de ce guide avec les données de nycflights13, mais le problème persiste encore.
"> select(airports, lat, lon)
Error in select(airports, lat, lon) : unused arguments (lat, lon)"

Je ne sais comment résoudre ce problème.

[larmarange]

Essayez d'utiliser la commande dplyr::select() pour préciser que vous souhaitez utiliser spécfiquement la fonction select() du package dplyr.

Il est possible que vous ayez chargé en mémoire un autre package qui déclare lui une fonction select() créant ainsi un conflit.

[Alphonsboud]

Super, ça fonctionne maintenant.
C'était surement ça le problème.

Merci bien pour la promptitude !

[Alphonsboud]

Cool ça fonctionné après exécution de dplyr::select(). Vous êtes un génie. Merci encore !🙏 Le jeu. 21 sept. 2023 à 09:49, Joseph Larmarange ***@***.***> a écrit :

…

Essayez d'utiliser la commande dplyr::select() pour préciser que vous souhaitez utiliser spécfiquement la fonction select() du package dplyr. Il est possible que vous ayez chargé en mémoire un autre package qui déclare lui une fonction select() créant ainsi un conflit. — Reply to this email directly, view it on GitHub <#180 (reply in thread)>, or unsubscribe <https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/A2GGZ2Y3PGPLQA5UEP6ICIDX3QESJANCNFSM6AAAAAA5BHWGZQ> . You are receiving this because you commented.Message ID: ***@***.***>

[Jn-Gaby-Kamate]

Bonsoir,

[#Mon problème porte sur les accents dans les scripts]

Je ne comprends pas trop le problème des accents dans les scripts. J'arrive pas à compiler un Rapport avec mes scripts lorsquils contiennent des accents (dans les messages d'erreur, j'ai lu "symbole inattendu") . Mai Si j'enlève tous les accents, ça marche. J'aimerais comprendre un plus voire s'il y'a une possibilité que de mettre des accents danw mes et de faire mon rapport sans soucis.

J'en profite, pour féliciter les responsables de cette plate-forme très utile que je découvert à peine. Elle m'aide beaucoup et certainement beaucoup d'autres francophones à apprendre plus sur RStudio.

J'en profite aussi pour me présenter : Je m'appelle Jean G. KAMATE, je viens de terminer mon Master en Économie et Politique Agricole à l'université de Bamako (Mali). Notre programme était basé sur d'autres logiciels Stats... Mais j'ai énormément apprécié R depuis que je l'ai découvert grâce à un prof. pour le fait qu'il Est gratuit et très complet ( pas donc besoin de version cracke 😁 comme nous faisons, nous, étudiants en Afrique avec les autres logiciels).

A cet effet, J'ai commencé à me former sur internet (docs grauits, vidéos...). J'ai suivi la formation en statistique et R de la plateforme funMooc. Cela m'a fait du bien. Mais paw autant que ça. Le caractère anglophone de R, la programmation et le manque de connaissances sur les extensions diminuaient mon engouement pour ce logiciel.
Par exemple je voulais réaliser mon projet de mémoire avec R, mais j'y arrivais et j'ai abandonné. J'avais eu la chance de bénéficier un financement qui m'a permis de collecter des données au près de 1000 individus. Mais les codages, calcul de scores, tableaux de stats descriptives... me paraissaient toujours compliqur sous R.

Mais je continue mon auto-formation, Jusqu'à ce que je tombe sur vos Webin-R sur YouTube.
Honnête, ces vidéos m'ont fait du Bien. Ce sont ces vidéos et La plateforme Analyse-R qui m'ont énormément permis de m'apprivoiser à R.

Actuellement, Je suis sur un projet d'article que je vais réalisé avec RStudio (cette fois-ci, je compte pas abandonné 😁 grâce à vous.). Vous êtes une référence pour moi.

[larmarange]

Bonjour et merci pour votre intérêt pour les webin-R et analyse-R

Pour information, guide-R https://larmarange.github.io/guide-R/ offre une actualisation et une extension des contenus d'analyse-R

Concernant les accents dans les scripts :

• il est vivement déconseillé d'utiliser des accents pour nommer des objets, des fonctions, des variables !
• on peut utiliser néanmoins des accents dans des chaines de textes (entre guillemets)
• il faut s'assurer que son script est bien enregistré en UTF-8 (normalement c'est le cas avec RStudio), c'est un format d'encodage des accents
• si l'on appelle un script dans un autre script avec source(), il faut préciser l'option encoding = "UTF-8"

Cdlt

[Jn-Gaby-Kamate]

Bonjour, Merci pour votre disponibilité. C'est noté.

Dans les options globales de Rstudio, le format était " ISO-8859-1 system default". J'ai changé en "UTF-8".

Merci

[Brahim-k]

bonsoir,
svp, avec un jeux de données, deux variables et 3000 observations, comment plot 5 ou 10 pics de graphe.
Cordialement

[Jn-Gaby-Kamate]

Bonsoir

Objet : Labellisation des variables et valeurs des variables

Après avoir importé mon fichier de données brutes où les valeurs variables sont codifiées donc numérique dans R.

Je voudrais procéder à la labellisation de chaque variable et leurs valeurs.

Pour ensuite appliquer "unlabelled" pour obtenir des factor.

Or, j'aimerais savoir si on peut faire cela en même temps. Par exemple, depuis la Labellisation obtenir des factor ?

[larmarange]

Vous pouvez appliquer des étiquettes de variables (cf. https://larmarange.github.io/guide-R/manipulation/etiquettes-variables.html ) et des étiquettes de valeurs (cf. https://larmarange.github.io/guide-R/manipulation/etiquettes-valeurs.html ) à vos données puis, le moment venu, utiliser unlabelled() ou to_factor() pour convertir les vecteurs labelisés en facteurs (cf. https://larmarange.github.io/guide-R/manipulation/etiquettes-valeurs.html#conversion )

[Jn-Gaby-Kamate]

Bonsoir,

[#Unlabelled et #tblsummary]

J'ai appliqué Unlabelled sur mon fichier de données de type Haven importé sous format STATA. J'ai obtenu des dbl et fact sans problème.

Mais, je vois tbl_summary traite certaines variables avec n(%) alorsqu'elles sont numeriques ? J'ai bien vérifié.

À noter que dans les variables en questions le nombre de valeurs différentes est quand même limité (2 ; 14). Mais je les veux en numérique. Est ce que c'est ça le problème ? Que dois-je faire ?

Merci

[larmarange]

Par défaut, gtsummary traite les variables numériques avec 10 valeurs uniques ou moins comme des variables catégorielles.

On peut, cependant, forcer tbl_summary() à les traiter comme des variables continues à l'aide de l'argument type.

Voir un exemple : https://larmarange.github.io/guide-R/analyses/statistique-univariee.html#forcer-le-type-de-variable

[Pierrefaye96]

Bonjour M. Larmarange dans le cadre d'un TD sur une évaluation d'impact ou on utilise stata on à obtenu un tableau pour les caractéristiques des groupes de contrôle et des traité avec ce code : iebaltab iagri_month_bsl fs_adultskip_bsl m_fs_childskip_bsl ctotal_pcmonth_bsl control_min_market control_compounds control_g_hhsize control_assetindex control_intro_business control_tot_surface control_livestockindex control_primary_savings control_primary_age if country==2, grpvar(treatment) save (Ghanast.xlsx) replace fixedeffect(geo_cluster) pttest. Mais je suis plus à l'aise avec R donc j'ai essayer de reproduire les résultat avec TBl_SUMMARY : tbl <- tbl_summary(
df_gha,
include = c(
treatment, iagri_month_bsl,
m_fs_childskip_bsl, ctotal_pcmonth_bsl, control_min_market,
control_compounds, control_g_hhsize, control_assetindex,
control_intro_business, control_tot_surface,
control_livestockindex, control_primary_savings,
control_primary_age
),
by = treatment,
statistic = all_continuous() ~ "{mean} [{sd}]"
) %>%
add_p(test = everything() ~ "t.test"). J'ai bien réuissi seulement je n'arrive pas comme pour stata ( fixedeffect(geo_cluster)) à fixer en fonction des cluster. Merci

[larmarange]

Bonjour, je ne suis pas familier de Stata ni de la commande iebaltab qui semble venir d'une extension spécifique de Stata. Dans ce que je comprends, cette commande vise à calculer la différence entre deux moyennes.

L'équivalent avec gtsummary serait la fonction add_difference(), cf. https://www.danieldsjoberg.com/gtsummary/reference/add_difference.html

Concernant le paramètre stata fixedeffect(geo_cluster) je ne vois pas vraiment comment cela se traduit statistiquement. Vous pouvez regarder les différents tests disponibles dans gtsummary : https://www.danieldsjoberg.com/gtsummary/reference/tests.html#tbl-summary-add-difference-

Le mieux serait de vus rapprocher de votre enseignant quel serait le bon équivalent.

Cdlt

[Pierrefaye96]

Merci beaucoup Le lun. 27 nov. 2023 à 19:54, Joseph Larmarange ***@***.***> a écrit :

…

Bonjour, je ne suis pas familier de Stata ni de la commande iebaltab qui semble venir d'une extension spécifique de Stata. Dans ce que je comprends, cette commande vise à calculer la différence entre deux moyennes. L'équivalent avec gtsummary serait la fonction add_difference(), cf. https://www.danieldsjoberg.com/gtsummary/reference/add_difference.html Concernant le paramètre stata fixedeffect(geo_cluster) je ne vois pas vraiment comment cela se traduit statistiquement. Vous pouvez regarder les différents tests disponibles dans gtsummary : https://www.danieldsjoberg.com/gtsummary/reference/tests.html#tbl-summary-add-difference- Le mieux serait de vus rapprocher de votre enseignant quel serait le bon équivalent. Cdlt — Reply to this email directly, view it on GitHub <#180 (reply in thread)>, or unsubscribe <https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/A337U3UOMUBUN5NAZ6RSALLYGTOU5AVCNFSM6AAAAAA5BHWGZSVHI2DSMVQWIX3LMV43SRDJONRXK43TNFXW4Q3PNVWWK3TUHM3TMOBUGQZDS> . You are receiving this because you commented.Message ID: ***@***.***>