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if (rule.style.color === '' && rule.style.backgroundColor === '') {
j++;
continue;
}
// replace div.sourceCode by a pre.sourceCode rule
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<a href="manipuler" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" role="button" aria-expanded="false">Manipuler <span class="caret"></span></a>
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<li class="dropdown-header">Prise en main</li>
<li><a href="presentation-et-philosophie.html">Présentation et Philosophie</a></li>
<li><a href="installation-de-R-et-RStudio.html">Installation de <strong>R</strong> et <strong>RStudio</strong></a></li>
<li><a href="premier-contact.html">Premier contact</a></li>
<li><a href="premier-travail-avec-les-donnees.html">Premier travail avec des données</a></li>
<li><a href="extensions.html">Extensions (installation, mise à jour)</a></li>
<li><a href="introduction-au-tidyverse.html">Introduction au <strong>tidyverse</strong></a></li>
<li><a href="vecteurs-indexation-et-assignation.html">Vecteurs, indexation et assignation</a></li>
<li><a href="listes-et-tableaux-de-donnees.html">Listes et Tableaux de données</a></li>
<li><a href="facteurs-et-vecteurs-labellises.html">Facteurs et vecteurs labellisés</a></li>
<li><a href="organiser-ses-fichiers.html">Organiser ses fichiers</a></li>
<li><a href="import-de-donnees.html">Import de données</a></li>
<li><a href="ou-trouver-de-l-aide.html">Où trouver de l'aide ?</a></li>
</ul>
</div>
<div class="col-sm-4">
<ul class="multi-column-dropdown">
<li class="dropdown-header">Manipulation de données</li>
<li><a href="visualiser-ses-donnees.html">Visualiser ses données</a></li>
<li><a href="recodage.html">Recodage de variables</a></li>
<li><a href="manipuler-les-donnees-avec-dplyr.html">Manipuler les données avec <strong>dplyr</strong></a></li>
<li><a href="manipulations-avancees-avec-data-table.html">Manipulations avancées avec <strong>data.table</strong></a></li>
<li><a href="tris.html">Tris</a></li>
<li><a href="sous-ensembles.html">Sous-ensembles</a></li>
<li><a href="fusion-de-tables.html">Fusion de tables</a></li>
<li><a href="gestion-des-dates.html">Gestion des dates</a></li>
<li><a href="fonctions-a-fenetre.html">Fonctions à fenêtre</a></li>
<li><a href="manipuler-du-texte.html">Manipuler du texte avec <strong>stringr</strong></a></li>
<li><a href="reorganiser-ses-donnees-avec-tidyr.html">Réorganiser ses données avec <strong>tidyr</strong></a></li>
<!--<li><a href="scraping.html.old">Scraping</a></li>-->
</ul>
</div>
<div class="col-sm-4">
<ul class="multi-column-dropdown">
<li class="dropdown-header">Exporter</li>
<li><a href="export-de-donnees.html">Export de données</a></li>
<li><a href="export-de-graphiques.html">Export de graphiques</a></li>
</ul>
</div>
</div>
</ul>
</li>
<li class="dropdown">
<a href="analyser" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" role="button" aria-expanded="false">Analyser <span class="caret"></span></a>
<ul class="dropdown-menu multi-column columns-3" role="menu" id="menu_analyser">
<div class="row">
<div class="col-sm-4">
<ul class="multi-column-dropdown">
<li class="dropdown-header">Statistiques introductives</li>
<li><a href="statistique-univariee.html">Statistique univariée</a></li>
<li><a href="statistique-bivariee.html">Statistique bivariée</a></li>
<li><a href="intro-ggplot2.html">Introduction à <strong>ggplot2</strong>, la grammaire des graphiques</a></li>
<li><a href="graphiques-bivaries-ggplot2.html">Graphiques univariés et bivariés avec <strong>ggplot2</strong></a></li>
<li><a href="donnees-ponderees.html">Données pondérées</a></li>
</ul>
</div>
<div class="col-sm-4">
<ul class="multi-column-dropdown">
<li class="dropdown-header">Statistiques intermédiaires</li>
<li><a href="intervalles-de-confiance.html">Intervalles de confiance</a></li>
<li><a href="comparaisons-moyennes-et-proportions.html">Comparaisons (moyennes et proportions)</a></li>
<li><a href="definir-un-plan-d-echantillonnage-complexe.html">Définir un plan d'échantillonnage complexe avec <strong>survey</strong></a></li>
<li><a href="regression-lineaire.html">Régression linéaire</a></li>
<li><a href="regression-logistique.html">Régression logistique binaire, multinomiale et ordinale</a></li>
<li><a href="analyse-des-correspondances-multiples.html">Analyse des correspondances multiples (ACM)</a></li>
<li><a href="classification-ascendante-hierarchique.html">Classification ascendante hiérarchique (CAH)</a></li>
</ul>
</div>
<div class="col-sm-4">
<ul class="multi-column-dropdown">
<li class="dropdown-header">Statistiques avancées</li>
<li><a href="gtsummary.html">Tableaux statistiques avancés avec <strong>gtsummary</strong></a></li>
<li><a href="effets-d-interaction.html">Effets d'interaction dans un modèle</a></li>
<li><a href="multicolinearite.html">Multicolinéarité dans la régression</a></li>
<li><a href="modeles.html">Quel type de modèles choisir ?</a></li>
<li><a href="analyse-de-survie.html">Analyse de survie</a></li>
<li><a href="analyse-de-sequences.html">Analyse de séquences</a></li>
<!--<li><a href="modeles-a-effets-aleatoires.html">Modèles à effets aléatoires (modèles mixtes et GEE)</a></li>-->
<li><a href="trajectoires-de-soins.html">Trajectoires de soins : un exemple de données longitudinales</a></li>
<li><a href="analyse-de-reseaux.html">Analyse de réseaux</a></li>
<li><a href="analyse-spatiale.html">Analyse spatiale</a></li>
<li><a href="analyse-textuelle.html">Analyse textuelle</a></li>
</ul>
</div>
</div>
</ul>
</li>
<li class="dropdown">
<a href="approfondir" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" role="button" aria-expanded="false">Approfondir <span class="caret"></span></a>
<ul class="dropdown-menu multi-column columns-3" role="menu" id="menu_approfondir">
<div class="row">
<div class="col-sm-4">
<ul class="multi-column-dropdown">
<li class="dropdown-header">Graphiques</li>
<li><a href="ggplot2.html"><strong>ggplot2</strong> et la grammaire des graphiques</a></li>
<li><a href="etendre-ggplot2.html">Étendre <strong>ggplot2</strong></a></li>
<li><a href="combiner-plusieurs-graphiques.html">Combiner plusieurs graphiques</a></li>
<li><a href="exemples-graphiques-avances.html">Exemples de graphiques avancés</a></li>
<li><a href="graphiques-interactifs.html">Graphiques interactifs</a></li>
<li><a href="lattice-graphiques-et-formules.html"><strong>lattice</strong> : graphiques et formules</a></li>
<li><a href="cartes.html">Cartes</a></li>
<li><a href="autres-extensions-graphiques.html">Autres extensions graphiques</a></li>
</ul>
</div>
<div class="col-sm-4">
<ul class="multi-column-dropdown">
<li class="dropdown-header">Programmation</li>
<li><a href="conditions-et-comparaisons.html">Conditions et comparaisons</a></li>
<li><a href="formules.html">Formules</a></li>
<li><a href="structures-conditionnelles.html">Structures conditionnelles</a></li>
<li><a href="vectorisation.html">Vectorisation (dont <strong>purrr</strong>)</a></li>
<li><a href="expressions-regulieres.html">Expressions régulières</a></li>
<!--<li class="dev"><a href="ecrire-ses-propres-fonctions.html">Écrire ses propres fonctions</a></li>-->
<li><a href="rmarkdown-les-rapports-automatises.html"><strong>R Markdown</strong> : les rapports automatisés</a></li>
</ul>
</div>
<div class="col-sm-4">
<ul class="multi-column-dropdown">
<li class="dropdown-header">Divers</li>
<li><a href="formater-nombres.html">Mettre en forme des nombres avec <strong>scales</strong></a></li>
<li><a href="couleurs.html">Couleurs et Palettes</a></li>
<li><a href="annotations-mathematiques.html">Annotations mathématiques</a></li>
<li><a href="calculer-un-age.html">Calculer un âge</a></li>
<li><a href="diagramme-de-lexis.html">Diagramme de Lexis</a></li>
</ul>
</div>
</div>
</ul>
</li>
<li class="dropdown">
<a href="index" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown" role="button" aria-expanded="false">Index <span class="caret"></span></a>
<ul class="dropdown-menu" role="menu" id="menu_naviguer">
<li><a href="index-des-concepts.html">Index des concepts</a></li>
<li><a href="index-des-fonctions.html">Index des fonctions</a></li>
<li><a href="index-des-extensions.html">Index des extensions</a></li>
</ul>
</li>
<li><a href="analyse-R.pdf">PDF</a></li>
<li><a href="https://larmarange.github.io/guide-R/">guide-R</a></li>
<li><a href="https://larmarange.github.io/webin-R/">webin-R</a></li>
<li><a href="https://www.youtube.com/c/webinR"><i class="fa fa-youtube" aria-hidden="true"></i></a></li>
<!--<li><a href="https://github.com/larmarange/analyse-R">GitHub</a></li>-->
</ul>
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<a href="https://github.com/larmarange/analyse-R"><img style="position: absolute; top: 60px; left: 40px; border: 0;" src="images/fork_me.png" alt="Contribuer sur GitHub"></a>
</div>
<div class="col-sm-9" role="main">
<article>
<div id="header">
<h1 class="title toc-ignore">Export de données</h1>
</div>
<div id="TOC">
<ul>
<li><a href="#export-de-tableaux-de-données" id="toc-export-de-tableaux-de-données">Export de tableaux de données</a></li>
<li><a href="#exporter-des-objets-spatiaux" id="toc-exporter-des-objets-spatiaux">Exporter des objets spatiaux</a></li>
<li><a href="#sauvegarder-des-objets" id="toc-sauvegarder-des-objets">Sauvegarder des objets</a></li>
</ul>
</div>
<p><dfn data-index="données, exporter"></dfn><dfn data-index="exporter des données"></dfn></p>
<div id="export-de-tableaux-de-données" class="section level2 hasAnchor">
<h2 class="hasAnchor">Export de tableaux de données<a href="#export-de-tableaux-de-données" class="anchor-section" aria-label="Anchor link to header"></a></h2>
<p>On peut avoir besoin d’exporter un tableau de données dans <strong>R</strong> vers un fichier dans différents formats. La plupart des fonctions d’import disposent d’un équivalent permettant l’export de données. On citera notamment :</p>
<ul>
<li><code data-pkg="reader" data-rdoc="write_delim">write_csv</code>, <code data-pkg="reader" data-rdoc="write_delim">write_delim</code>, <code data-pkg="reader" data-rdoc="write_delim">write_tsv</code> (<code class="pkg">readr</code>)permettent d’enregistrer un <em>data frame</em> ou un tibble dans un fichier au format texte délimité</li>
<li><code data-pkg="haven" data-rdoc="read_sas">write_sas</code> (<code class="pkg">haven</code>) permet d’exporter au format <strong>SAS</strong></li>
<li><code data-pkg="haven" data-rdoc="read_spss">write_sav</code> (<code class="pkg">haven</code>) permet d’exporter au format <strong>SPSS</strong></li>
<li><code data-pkg="haven" data-rdoc="read_dta">write_dta</code> (<code class="pkg">haven</code>) permet d’exporter au format <strong>Stata</strong></li>
</ul>
<p>L’extension <code>readxl</code> ne fournit pas de fonction pour exporter au format <strong>Excel</strong>. Par contre, on pourra passer par la fonction <code data-pkg="openxlsx">write.xlsx</code> de l’extension <code class="pkg">openxlsx</code> ou la fonction <code data-pkg="xlsx">write.xlsx</code> de l’extension <code class="pkg">xlsx</code>. L’intérêt de l’extension <code class="pkg">openxlsx</code> est de ne pas dépendre de <strong>Java</strong> à la différence de l’extension <code class="pkg">xlsx</code>.</p>
<p>Pour le format <strong>dBase</strong>, on peut utiliser <code data-pkg="foreign">write.dbf</code> (<code class="pkg">foreign</code>).</p>
<p>Ces fonctions sont utiles si on souhaite diffuser des données à quelqu’un d’autre, ou entre deux logiciels.</p>
<p>Si vous travaillez sur des données de grandes dimensions, les formats texte peuvent être lents à exporter et importer. Dans ce cas, l’extension <code class="pkg">feather</code> peut être utile : elle permet d’enregistrer un <em>data frame</em> au format feather, qui n’est pas le plus compact mais qui est extrêmement rapide à lire et écrire <a href="#fn1" class="footnote-ref" id="fnref1"><sup>1</sup></a>.</p>
<p>Les fonctions <code data-pkg="feather">read_feather</code> et <code data-pkg="feather" data-doc="read_feather">write_feather</code> permettent d’importer et exporter des tableaux de données dans ce format.</p>
</div>
<div id="exporter-des-objets-spatiaux" class="section level2 hasAnchor">
<h2 class="hasAnchor">Exporter des objets spatiaux<a href="#exporter-des-objets-spatiaux" class="anchor-section" aria-label="Anchor link to header"></a></h2>
<p>On aura recours à l’extension <code class="pkg">maptools</code> qui fournit les fonctions <code data-pkg="maptools" data-rdoc="readShapePoints">writePointsShape</code> | <code class="pkg">maptools</code>, <code data-pkg="maptools" data-rdoc="readShapeLines">writeLinesShape</code> et <code data-pkg="maptools" data-rdoc="readShapePoly">writePolyShape</code> pour exporter des données respectivement de type points, lignes et polygones au format <strong>Shapefile</strong>, et la fonction <code data-pkg="maptools" data-rdoc="readAsciiGrid">writeAsciiGrid</code> pour exporter un objet raster au format <strong>ASCII grid</strong>.</p>
</div>
<div id="sauvegarder-des-objets" class="section level2 hasAnchor">
<h2 class="hasAnchor">Sauvegarder des objets<a href="#sauvegarder-des-objets" class="anchor-section" aria-label="Anchor link to header"></a></h2>
<p>Une autre manière de sauvegarder des données est de les enregistrer au format <code>RData</code>. Ce format propre à <strong>R</strong> est compact, rapide, et permet d’enregistrer plusieurs objets <strong>R</strong>, quel que soit leur type, dans un même fichier.</p>
<p>Pour enregistrer des objets, il suffit d’utiliser la fonction <code data-pkg="base">save</code> et de lui fournir la liste des objets à sauvegarder et le nom du fichier :</p>
<div class="sourceCode" id="cb1"><pre class="sourceCode r"><code class="sourceCode r"><span id="cb1-1"><a href="#cb1-1" tabindex="-1"></a><span class="fu">save</span>(d, rp2012, tab, <span class="at">file =</span> <span class="st">"fichier.RData"</span>)</span></code></pre></div>
<p>Pour charger des objets préalablement enregistrés, utiliser <code>load</code> :</p>
<div class="sourceCode" id="cb2"><pre class="sourceCode r"><code class="sourceCode r"><span id="cb2-1"><a href="#cb2-1" tabindex="-1"></a><span class="fu">load</span>(<span class="st">"fichier.RData"</span>)</span></code></pre></div>
<p>Les objets <code>d</code>, <code>rp2012</code> et <code>tab</code> devraient alors apparaître dans votre environnement.</p>
<div class="important">
<p>Attention, quand on utilise <code data-pkg="base">load</code>, les objets chargés sont importés directement dans l’environnement en cours avec leur nom d’origine. Si d’autres objets du même nom existaient déjà, ils sont écrasés sans avertissement.</p>
</div>
<p><strong>R</strong> propose différentes fonctions permettant d’exporter des données vers des formats variés.</p>
<table>
<thead>
<tr class="header">
<th align="left">Type de fichier souhaité</th>
<th align="left">Fonction</th>
<th align="left">Extension</th>
</tr>
</thead>
<tbody>
<tr class="odd">
<td align="left">texte</td>
<td align="left"><code data-pkg="utils">write.table</code></td>
<td align="left"><code class="pkg">utils</code></td>
</tr>
<tr class="even">
<td align="left">CSV</td>
<td align="left"><code data-pkg="utils" data-rdoc="write.table">write.csv</code></td>
<td align="left"><code class="pkg">utils</code></td>
</tr>
<tr class="odd">
<td align="left">CSV</td>
<td align="left"><code data-pkg="readr">write_csv</code></td>
<td align="left"><code class="pkg">readr</code></td>
</tr>
<tr class="even">
<td align="left">Excel</td>
<td align="left"><code data-pkg="xlsx">write.xlsx</code></td>
<td align="left"><code class="pkg">xlsx</code></td>
</tr>
<tr class="odd">
<td align="left">dBase</td>
<td align="left"><code data-pkg="foreign">write.dbf</code></td>
<td align="left"><code class="pkg">foreign</code></td>
</tr>
<tr class="even">
<td align="left">SPSS</td>
<td align="left"><code data-pkg="haven">write_sav</code></td>
<td align="left"><code class="pkg">haven</code></td>
</tr>
<tr class="odd">
<td align="left">SPSS</td>
<td align="left"><code data-pkg="foreign">write.foreign</code></td>
<td align="left"><code class="pkg">foreign</code></td>
</tr>
<tr class="even">
<td align="left">Stata</td>
<td align="left"><code data-pkg="foreign">write.dta</code></td>
<td align="left"><code class="pkg">foreign</code></td>
</tr>
<tr class="odd">
<td align="left">Stata</td>
<td align="left"><code data-pkg="haven">write_dta</code></td>
<td align="left"><code class="pkg">haven</code></td>
</tr>
<tr class="even">
<td align="left">SAS</td>
<td align="left"><code data-pkg="foreign">write.foreign</code></td>
<td align="left"><code class="pkg">foreign</code></td>
</tr>
<tr class="odd">
<td align="left">SPSS</td>
<td align="left"><code data-pkg="foreign">write.foreign</code></td>
<td align="left"><code class="pkg">foreign</code></td>
</tr>
</tbody>
</table>
<p>À nouveau, pour plus de détails on se référera aux pages d’aide de ces fonctions et au manuel <cite>R Data Import/Export</cite> accessible à l’adresse suivante : <a href="http://cran.r-project.org/manuals.html" class="uri">http://cran.r-project.org/manuals.html</a>.</p>
</div>
<div class="footnotes footnotes-end-of-document">
<hr />
<ol>
<li id="fn1"><p><code>feather</code> est un format compatible avec <strong>Python</strong>, <strong>R</strong> et <strong>Julia</strong>. Pour plus d’informations voir <a href="https://github.com/wesm/feather" class="uri">https://github.com/wesm/feather</a><a href="#fnref1" class="footnote-back">↩︎</a></p></li>
</ol>
</div>
</article>
</div>
<div class="col-sm-3" role="complementary">
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</nav>
</div>
</div>
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// manage active state of menu based on current page
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href = href.substr(href.lastIndexOf('/') + 1);
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// Identifier les <pre> fermant
$('pre').next("*:not(pre)").prev().addClass('last'); // Dernier <pre> de chaque groupe contigu de <pre>
$('pre').parent().each(function (){
$(this).children('pre').last().addClass('last');
}); // Si <pre> est le dernier enfant de son parent
// Ajout liens rdocumentation et tooltip
$("code[data-pkg]").each(function( index ) {
pkg = $(this).attr('data-pkg');
if ($(this).attr('data-rdoc') !== undefined) {
rdocumentation = $(this).attr('data-rdoc');
} else {
rdocumentation = $(this).text();
}
fonction = $(this).text();
//$(this).wrap('<a href="http://www.rdocumentation.org/packages/'+pkg+'/functions/'+rdocumentation+'">');
$(this).wrap('<a href="http://rdrr.io/pkg/'+pkg+'/sym/'+rdocumentation+'">');
$(this).attr('data-toggle','tooltip');
$(this).attr('data-placement','top');
$(this).attr('title','package : ' + pkg);
$('[data-toggle="tooltip"]').tooltip();
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$("code.pkg").each(function( index ) {
//$(this).wrap('<a href="http://www.rdocumentation.org/packages/'+$(this).text()+'">');
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// Figures
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// Colorbox
/*----
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maxWidth: '90%',
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-----*/
/* Clipboard --------------------------*/
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$('.btn-copy-ex').tooltip({container: 'body'});
// Initialize clipboard:
var clipboardBtnCopies = new ClipboardJS('[data-clipboard-copy]', {
text: function(trigger) {
return trigger.parentNode.textContent;
}
});
clipboardBtnCopies.on('success', function(e) {
changeTooltipMessage(e.trigger, 'Copié !');
e.clearSelection();
});
clipboardBtnCopies.on('error', function() {
changeTooltipMessage(e.trigger,'Appuyez sur Ctrl+C ou Command+C pour copier');
});
});
}
// Bigfoot
$(".footnotes > li").addClass("footnote");
$.bigfoot({
activateOnHover: true,
actionOriginalFN: "ignore"
});
});
</script>
<!-- Utterances comments
<script src="https://utteranc.es/client.js"
repo="larmarange/analyse-R"
issue-term="pathname"
label="commentaires"
theme="github-light"
crossorigin="anonymous"
async>
</script>
-->
<!-- Giscus comments -->
<script src="https://giscus.app/client.js"
data-repo="larmarange/analyse-R"
data-repo-id="MDEwOlJlcG9zaXRvcnkzNDk4NjY2Ng=="
data-category-id="DIC_kwDOAhXaqs4B_iH_"
data-mapping="pathname"
data-reactions-enabled="1"
data-emit-metadata="0"
data-theme="light"
data-lang="fr"
crossorigin="anonymous"
async>
</script>
<!-- disqus -->
<!---
<div class="row">
<div id="disqus_thread" class="col-sm-9" role="complementary"></div>
</div>
<script type="text/javascript">
/* * * CONFIGURATION VARIABLES: EDIT BEFORE PASTING INTO YOUR WEBPAGE * * */
var disqus_shortname = 'analyse-r'; // required: replace example with your forum shortname
/* * * DON'T EDIT BELOW THIS LINE * * */
(function() {
var dsq = document.createElement('script'); dsq.type = 'text/javascript'; dsq.async = true;
dsq.src = '//' + disqus_shortname + '.disqus.com/embed.js';
(document.getElementsByTagName('head')[0] || document.getElementsByTagName('body')[0]).appendChild(dsq);
})();
</script>
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<script>
// add bootstrap table styles to pandoc tables
function bootstrapStylePandocTables() {
$('tr.odd').parent('tbody').parent('table').addClass('table table-condensed');
}
$(document).ready(function () {
bootstrapStylePandocTables();
});
</script>
<!-- tabsets -->
<script>
$(document).ready(function () {
window.buildTabsets("TOC");
});
$(document).ready(function () {
$('.tabset-dropdown > .nav-tabs > li').click(function () {
$(this).parent().toggleClass('nav-tabs-open');
});
});
</script>
<!-- code folding -->
</body>
</html>