.travis.yml

language: java
dist: bionic
sudo: false
jdk:
  - oraclejdk11
env:
  global:
    - FILE_TO_VALIDATE_ANALYSIS=default_analysis_schema.yaml 
    - FILE_TO_VALIDATE_BIOSAMPLE=default_biosample_schema.yaml
    - FILE_TO_VALIDATE_DATASET=default_dataset_schema.yaml
    - FILE_TO_VALIDATE_INDIVIDUAL=default_individual_schema.yaml
    - FILE_TO_VALIDATE_INTERACTOR=default_interactor_schema.yaml
    - FILE_TO_VALIDATE_RUN=default_run_schema.yaml
    - FILE_TO_VALIDATE_VARIANT_ANNOT=default_variant_annotations_schema.yaml
    - FILE_TO_VALIDATE_VARIANT=default_variant_identification_schema.yaml    
    - FILE_TO_VALIDATE_VARIANT_IN_SAMPLE=default_variant_in_sample_schema.yaml
    - FILE_TO_VALIDATE_VARIANT_INTERPRETATION=default_variant_interpretation_schema.yaml
    - FILE_TO_VALIDATE_COHORT=default_cohort_schema.yaml
    - FILE_TO_VALIDATE_COMMON=common.yaml
    - GH_URL=https://raw.githubusercontent.com
    - VALIDATOR_URL=http://validator.swagger.io/validator/debug?url
    - URL_TO_VALIDATE=$GH_URL/$TRAVIS_REPO_SLUG/${TRAVIS_PULL_REQUEST_BRANCH:-$TRAVIS_BRANCH}
before_install:
  - git clone --branch=v1.1.0 https://github.com/mcupak/oas-validator.git
script:
  - ./oas-validator/validate.sh "$URL_TO_VALIDATE/$FILE_TO_VALIDATE_ANALYSIS"
  - ./oas-validator/validate.sh "$URL_TO_VALIDATE/$FILE_TO_VALIDATE_BIOSAMPLE"
  - ./oas-validator/validate.sh "$URL_TO_VALIDATE/$FILE_TO_VALIDATE_DATASET"
  - ./oas-validator/validate.sh "$URL_TO_VALIDATE/$FILE_TO_VALIDATE_INDIVIDUAL"
  - ./oas-validator/validate.sh "$URL_TO_VALIDATE/$FILE_TO_VALIDATE_INTERACTOR"
  - ./oas-validator/validate.sh "$URL_TO_VALIDATE/$FILE_TO_VALIDATE_RUN"
  - ./oas-validator/validate.sh "$URL_TO_VALIDATE/$FILE_TO_VALIDATE_VARIANT_ANNOT"
  - ./oas-validator/validate.sh "$URL_TO_VALIDATE/$FILE_TO_VALIDATE_VARIANT"
  - ./oas-validator/validate.sh "$URL_TO_VALIDATE/$FILE_TO_VALIDATE_VARIANT_IN_SAMPLE"
  - ./oas-validator/validate.sh "$URL_TO_VALIDATE/$FILE_TO_VALIDATE_VARIANT_INTERPRETATION"
  - ./oas-validator/validate.sh "$URL_TO_VALIDATE/$FILE_TO_VALIDATE_COHORT"
  - ./oas-validator/validate.sh "$URL_TO_VALIDATE/$FILE_TO_VALIDATE_COMMON"