Skip to content

Latest commit

 

History

History
12 lines (7 loc) · 670 Bytes

genome_assembly_101.md

File metadata and controls

12 lines (7 loc) · 670 Bytes

Сборка генома самой полулярной бактерии

Начнем с самого простого. Как собрать бактерию из сырых ридов Fastq. Сейчас мы не будем думать, про очистку и подготовку данных. Просто сборка как есть. С использованием разных сборщиков.

Цель научиться запускать популярные сборщики бактериальных геномов.

Сборка с помощью SPAdes

Сборка с помощью Unicycler

Сборка с помощью IDBA