From 914676523acb3d418630be08ce5d33b986bc137b Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: =?UTF-8?q?=E7=94=A8=E6=88=B7=E5=90=8D?= <邮箱地址> Date: Tue, 27 Aug 2024 15:18:59 +0800 Subject: [PATCH] Site updated: 2024-08-27 15:18:58 --- 2024/08/26/DIANN/index.html | 20 +++++++++---------- about/index.html | 5 +++++ archives/2024/08/index.html | 5 +++++ archives/2024/index.html | 5 +++++ archives/index.html | 5 +++++ categories/index.html | 5 +++++ .../\350\233\213\347\231\275/index.html" | 5 +++++ friends/index.html | 5 +++++ index.html | 5 +++++ search.xml | 13 ++++-------- tags/DIA-NN/index.html | 5 +++++ tags/index.html | 5 +++++ 12 files changed, 64 insertions(+), 19 deletions(-) diff --git a/2024/08/26/DIANN/index.html b/2024/08/26/DIANN/index.html index 318067f..eee7507 100644 --- a/2024/08/26/DIANN/index.html +++ b/2024/08/26/DIANN/index.html @@ -87,7 +87,7 @@

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http://music.163.com/#/song?id=2145149147

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  1. Spectral:谱图
    2. -
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the library must not contain non-fragmented precursor ions as ‘fragments’
precursor。each fragment ion must actually be produced by the peptide backbone fragmentation.：在质谱分析中，前体离子通常指的是在质谱仪中经过某种方式（如电离）产生的、尚未进一步碎裂的离子。这些离子在质谱仪的进一步处理中（如碰撞诱导解离CID、高能碰撞解离HCD等）可能会被碎裂成更小的片段离子（Fragment Ions），这些片段离子随后被用于化合物的鉴定和结构分析。

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$S=\sqrt{\frac{\sum{(X-\bar{X})^2}} {n-1}}$

为什么进行FASTA文件消化？

不依赖谱库的搜索（library-free search）方法，如DIA-NN，直接使用FASTA文件中的蛋白质序列生成假设的肽段，并通过这些肽段来匹配实验数据。这种方法不需要预先构建的谱库，使得分析过程更加灵活和广泛适用，特别是对于未研究过的样本或新发现的蛋白质。

DIA-NN中的FASTA文件消化步骤

  1. 加载FASTA文件: 研究人员将包含目标蛋白质序列的FASTA文件输入到DIA-NN中。
    2. @@ -877,6 +872,11 @@

    Summa + diff --git a/about/index.html b/about/index.html index ceb2388..e5b1e61 100644 --- a/about/index.html +++ b/about/index.html @@ -522,6 +522,11 @@

    + diff --git a/archives/2024/08/index.html b/archives/2024/08/index.html index a7b8659..7e65fd1 100644 --- a/archives/2024/08/index.html +++ b/archives/2024/08/index.html @@ -439,6 +439,11 @@

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    + diff --git a/categories/index.html b/categories/index.html index 99412a3..317e800 100644 --- a/categories/index.html +++ b/categories/index.html @@ -399,6 +399,11 @@

    Categories

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    + diff --git a/friends/index.html b/friends/index.html index e8dd09d..a65c9b2 100644 --- a/friends/index.html +++ b/friends/index.html @@ -419,6 +419,11 @@

    Friends

    + diff --git a/index.html b/index.html index 9d5b68b..7a70c57 100644 --- a/index.html +++ b/index.html @@ -546,6 +546,11 @@

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    http://music.163.com/#/song?id=2145149147

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    1. Spectral:谱图
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    the library must not contain non-fragmented precursor ions as ‘fragments’
    precursor。each fragment ion must actually be produced by the peptide backbone fragmentation.：在质谱分析中，前体离子通常指的是在质谱仪中经过某种方式（如电离）产生的、尚未进一步碎裂的离子。这些离子在质谱仪的进一步处理中（如碰撞诱导解离CID、高能碰撞解离HCD等）可能会被碎裂成更小的片段离子（Fragment Ions），这些片段离子随后被用于化合物的鉴定和结构分析。

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    $S=\sqrt{\frac{\sum{(X-\bar{X})^2}} {n-1}}$

    为什么进行FASTA文件消化？

    不依赖谱库的搜索（library-free search）方法，如DIA-NN，直接使用FASTA文件中的蛋白质序列生成假设的肽段，并通过这些肽段来匹配实验数据。这种方法不需要预先构建的谱库，使得分析过程更加灵活和广泛适用，特别是对于未研究过的样本或新发现的蛋白质。

    DIA-NN中的FASTA文件消化步骤

    1. 加载FASTA文件: 研究人员将包含目标蛋白质序列的FASTA文件输入到DIA-NN中。
      2. diff --git a/tags/DIA-NN/index.html b/tags/DIA-NN/index.html index d1738b2..a5f18c8 100644 --- a/tags/DIA-NN/index.html +++ b/tags/DIA-NN/index.html @@ -443,6 +443,11 @@

      + diff --git a/tags/index.html b/tags/index.html index f5a7c94..4a68fb7 100644 --- a/tags/index.html +++ b/tags/index.html @@ -399,6 +399,11 @@

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