#GATK4 允英维护版本主要更新内容:
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Active Region 增加 active 条件,针对深度较高的低频突变有较高的灵敏度,同时保证了分析时长的可控性
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修改 force allele 模式下,指定的位点与 Haplotype 中突变位置重合但突变内容不符情况下的添加规则,从而保证后续 Haplotype 的准确性
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增加 VCF 字段: 突变在read中位置的标准差 POSSD,用来过滤某些假阳性位点(可能由于酶切等原因导致)
#GATK4 允英维护版本主要更新内容:
Active Region 增加 active 条件,针对深度较高的低频突变有较高的灵敏度,同时保证了分析时长的可控性
修改 force allele 模式下,指定的位点与 Haplotype 中突变位置重合但突变内容不符情况下的添加规则,从而保证后续 Haplotype 的准确性
增加 VCF 字段: 突变在read中位置的标准差 POSSD,用来过滤某些假阳性位点(可能由于酶切等原因导致)