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15-creer-des-graphiques-et-cartes-pour-le-web.Rmd
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15-creer-des-graphiques-et-cartes-pour-le-web.Rmd
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# Créer des cartes pour le web
## Les cartes Leaflet
[`leaflet`](https://leafletjs.com/) est une bibliothèque javascript de cartographie en ligne. R permet de produire des cartes en exploitant cette bibliothèque.
La limitation de `leaflet` est qu'il ne permet de visualiser que des données en projection WGS84.
Dans ce chapitre, nous utiliserons les packages suivants
```{r}
library(leaflet)
library(sf)
library(tidyverse)
#remotes::install_github("MaelTheuliere/variousdata")
library(variousdata)
```
### Carte choroplète
Ci-dessous un exemple avancé de carte choroplète avec leaflet.
- Définition des données de départ
```{r}
sdg_indicators_2015_sf <- sdg_indicators_sf %>%
filter(timeperiod ==2015)
```
- Transformation de la projection car `leaflet` ne connait que le WGS 84
```{r}
sdg_indicators_2015_sf<-st_transform(sdg_indicators_2015_sf,crs=("+proj=longlat +datum=WGS84 +no_defs"))
```
- Discrétisation de la variable d'intérêt
```{r}
bins <-quantile(sdg_indicators_2015_sf$sh_sta_mmr,
na.rm=T)
```
- Création d'une palette de couleurs associée
`leaflet` intègre une fonction `colorBin()` qui permet d'associer à un vecteur de valeurs numériques un vecteur de couleurs en fonction d'une palette et d'un vecteur de bornes.
```{r}
pal <- colorBin("YlOrRd", domain =
sdg_indicators_2015_sf$sh_sta_mmr,
bins = bins)
```
- Création d'un label ad-hoc à afficher en surbrillance au passage de la souris sur la carte.
```{r}
labels <- sprintf(
"<strong>%s</strong><br/>%g décès pour 100 000 naissance en 2015",
sdg_indicators_2015_sf$geoareaname, sdg_indicators_2015_sf$sh_sta_mmr
) %>% lapply(htmltools::HTML)
```
- Réalisation de la carte
La fonction `addPolygons()` permet de créer la carte choroplète.
La fonction `addProviderTiles()` permet de rajouter un fond cartographique parmis les couches fournies par `leaflet`.
```{r,fig.width=7,fig.height=4}
leaflet(sdg_indicators_2015_sf) %>%
addProviderTiles(providers$CartoDB.Positron) %>%
addPolygons(data=sdg_indicators_2015_sf,
fillColor=~pal(sh_sta_mmr),
weight = 2,
opacity = 1,
color = "white",
dashArray = "3",
fillOpacity = 0.7,
highlight = highlightOptions(
weight = 5,
color = "#666",
dashArray = "",
fillOpacity = 0.7,
bringToFront = TRUE),
label = labels,
labelOptions = labelOptions(
style = list("font-weight" = "normal", padding = "3px 8px"),
textsize = "15px",
direction = "auto"))
```
### Carte à ronds proportionnels
Pour réaliser des ronds proportionnels, il va falloir comme pour `ggplot2` partir des centroides de nos polygones.
- Création de la table en entrée
```{r}
sdg_indicators_2015_sf_centroid <- sdg_indicators_sf_centroid %>%
filter(timeperiod ==2015)
```
- Transformation de la projection car `leaflet` ne connait que le WGS 84
```{r}
sdg_indicators_2015_sf_centroid <- st_transform(sdg_indicators_2015_sf_centroid,crs=("+proj=longlat +datum=WGS84 +no_defs"))
```
- Discrétisation de la variable d'intérêt
```{r}
bins <-quantile(sdg_indicators_2015_sf_centroid$sh_sta_mmr,na.rm=T)
```
- Création d'une palette de couleurs associée
```{r}
pal <- colorBin("YlOrRd", domain = sdg_indicators_2015_sf_centroid$sh_sta_mmr, bins = bins)
```
- Création d'un label ad-hoc à afficher en surbrillance au passage de la souris sur la carte.
```{r}
labels <- sprintf(
"<strong>%s</strong><br/>%g décès pour 100 000 naissance en 2015",
sdg_indicators_2015_sf_centroid$geoareaname, sdg_indicators_2015_sf_centroid$sh_sta_mmr
) %>% lapply(htmltools::HTML)
```
- Création de la carte
```{r,fig.width=7,fig.height=4}
carte_rond_proportionnel<-leaflet(sdg_indicators_2015_sf_centroid) %>%
addProviderTiles(providers$CartoDB.Positron) %>%
addPolygons(data=sdg_indicators_2015_sf,
fillColor = "#ffffff",
opacity=.2,
color = "white",
dashArray = "3",
fillOpacity = 0.7
) %>%
addCircles(data=sdg_indicators_2015_sf_centroid,
fillColor=~pal(sh_sta_mmr),
radius=~100000*log2(sh_sta_mmr),
weight = 2,
opacity = 1,
color = "white",
dashArray = "3",
fillOpacity = 0.7,
highlight = highlightOptions(
weight = 5,
color = "#666",
dashArray = "",
fillOpacity = 0.7,
bringToFront = TRUE),
label = labels,
labelOptions = labelOptions(
style = list("font-weight" = "normal", padding = "3px 8px"),
textsize = "15px",
direction = "auto")) %>%
addLegend("bottomright", pal = pal, values = ~sh_sta_mmr,
title = "Taux de décès des mères à la naissance",
opacity = 1)
carte_rond_proportionnel
```
## Exporter une sortie html
La foncion `saveWidget()` permet d'exporter une sortie d'un `HTML Widget` en fichier HTML.
```{r, eval=F}
saveWidget(widget=carte_rond_proportionnel,file="Taux de décès des mères à la naissance.html")
```