-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 1
/
Copy pathgenerar_plots.py
169 lines (121 loc) · 4.84 KB
/
generar_plots.py
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
import numpy as np
import pandas as pd
from matplotlib import pyplot as plt
import matplotlib
import time
from tqdm import tqdm
from abc import ABC, abstractmethod
import parameters as p
from plotly.subplots import make_subplots
import plotly.graph_objects as go
from plotly.io import write_image
from datetime import datetime
from fases import Fase
import locale
import json
locale.setlocale(locale.LC_TIME, '')
class Data(ABC):
def __init__(self,nombre_dato, identificador, ruta_archivo):
self.data = pd.read_csv(ruta_archivo)
self.weeks = 32 # Cantidad de semanas para hacer los datos
self.identificador = identificador
self.nombre_dato = nombre_dato
self.fase = Fase()
self.leer_paso_a_paso()
@property
def dates(self):
return [fecha for fecha in self.data.columns.values if '-' in fecha]
def fechas_ultimas_semanas(self):
# Entrega los puntos que se encuentran dentro de las ultimas self.weeks semanas
reciente = datetime.strptime(self.dates[-1], "%Y-%m-%d")
wanted_dates = []
for fecha in self.dates[::-1]:
fecha_obj = datetime.strptime(fecha, "%Y-%m-%d")
if (reciente - fecha_obj).days <= self.weeks*7:
wanted_dates.append(fecha)
wanted_dates.reverse()
return wanted_dates
@property
def comunas(self):
comunas = self.data['Comuna'].values
comunas = [c for c in comunas if "Desconocido" not in c and "Total" not in c]
return comunas
def leer_paso_a_paso(self):
with open(p.PATH_PASO_A_PASO) as json_file:
self.paso_a_paso = json.load(json_file)
def plot(self, comuna, save=True):
x, y = self.puntos(comuna)
plt.style.use('dark_background')
try:
self.fase.fase_de_comuna(comuna)
except:
print(comuna)
return
fig, (ax1, ax2, ax3) = plt.subplots(3,1, gridspec_kw={'height_ratios':[0.5,4,0.2]})
plt.setp(ax2.xaxis.get_majorticklabels(), rotation=45)
ax2.plot_date(x,y,linestyle='-',color='y',mec='r')
ax1.axis('off')
ax3.axis('off')
x_reverse = x[::-1]
x_downsample = x_reverse[:-1:8][::-1]
ax2.set_xticks(x_downsample)
ax2.set_xticklabels(x_downsample)
ax2.set_ylabel('Casos')
ax2.grid()
# Annotations
plt.annotate(f"{self.nombre_dato} en {comuna}", xy=(0.1, 0.9),xycoords='figure fraction',fontsize=15)
plt.annotate(f"Comuna en fase {self.fase.fase_de_comuna(comuna)}", xy=(0.1, 0.85),xycoords='figure fraction',fontsize=15)
fig.savefig(f"images/{self.identificador}-{comuna}-weeks{self.weeks}.png")
plt.close(fig)
def test_plot(self):
self.plot('Macul', save=False)
def generar_plots(self):
for comuna in tqdm(self.comunas):
self.plot(comuna)
@abstractmethod
def puntos(self, comuna):
comuna_data = self.data[self.data["Comuna"] == comuna]
fechas = self.fechas_ultimas_semanas()
casos = comuna_data[fechas].values[0]
x = []
y = []
for i in range(len(fechas) - 1):
fecha_inicial = datetime.strptime(fechas[i], "%Y-%m-%d")
fecha_final = datetime.strptime(fechas[i + 1], "%Y-%m-%d")
# Dias entre fechas
dias = (fecha_final - fecha_inicial).days
x.append(fechas[i + 1])
y.append(casos[i + 1] / dias)
#return fechas, casos
return (x, y)
class CasosIncrementales(Data):
def __init__(self, nombre_data, identificador, ruta_archivo):
super().__init__(nombre_data, identificador, ruta_archivo)
def puntos(self, comuna):
comuna_data = self.data[self.data["Comuna"] == comuna]
fechas = self.fechas_ultimas_semanas()
casos = comuna_data[fechas].values[0]
return fechas, casos
class CasosDiarios(Data):
def __init__(self, nombre_data, identificador, ruta_archivo):
super().__init__(nombre_data, identificador, ruta_archivo)
def puntos(self, comuna):
return super().puntos(comuna)
class CasosActivos(Data):
def __init__(self, nombre_data, identificador, ruta_archivo):
super().__init__(nombre_data, identificador, ruta_archivo)
def puntos(self, comuna):
return super().puntos(comuna)
def generar_todos_los_plots():
lista_datos = [
CasosActivos("Casos Activos", "casosActivos", p.PATH_CASOS_ACTIVOS),
CasosIncrementales("Casos Incrementales","casosIncrementales", p.PATH_CASOS_INCREMENTALES)
]
for dato in lista_datos:
dato.generar_plots()
if __name__ == "__main__":
import os
os.system('clear')
test = CasosIncrementales("Casos Incrementales","casosIncrementales", p.PATH_CASOS_INCREMENTALES)
#test.puntos("Macul")
test.generar_plots()