tidy up

Author: ChristinaXu2017

qsnp/src/org/qcmg/snp/util/PipelineUtil.java

@@ -2,17 +2,13 @@
 
 import gnu.trove.list.TIntList;
 import gnu.trove.list.TLongList;
-import gnu.trove.list.array.TIntArrayList;
 import gnu.trove.list.array.TLongArrayList;
-import gnu.trove.map.TIntCharMap;
 import gnu.trove.map.TIntIntMap;
-import gnu.trove.map.TIntObjectMap;
 import gnu.trove.map.TLongCharMap;
 import gnu.trove.map.TLongIntMap;
 import gnu.trove.map.TLongObjectMap;
 import gnu.trove.map.TMap;
 import gnu.trove.map.hash.THashMap;
-import gnu.trove.map.hash.TIntObjectHashMap;
 import gnu.trove.map.hash.TLongObjectHashMap;
 import gnu.trove.set.TIntSet;
 import gnu.trove.set.hash.TIntHashSet;
@@ -31,7 +27,6 @@
 import org.qcmg.common.log.QLogger;
 import org.qcmg.common.log.QLoggerFactory;
 import org.qcmg.common.model.Accumulator;
-import org.qcmg.common.model.ChrPosition;
 import org.qcmg.common.model.Classification;
 import org.qcmg.common.model.Rule;
 import org.qcmg.common.string.StringUtils;